<ddi:DDIInstance xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:schemaLocation="ddi:instance:3_3 http://ddialliance.org/Specification/DDI-Lifecycle/3.3/XMLSchema/instance.xsd" xmlns:xsd="http://www.w3.org/2001/XMLSchema" xmlns:ddi="ddi:instance:3_3" xmlns:r="ddi:reusable:3_3" xmlns:s="ddi:studyunit:3_3" xmlns:d="ddi:datacollection:3_3" xmlns:a="ddi:archive:3_3" xmlns:c="ddi:conceptualcomponent:3_3" xmlns:cm="ddi:comparative:3_3" xmlns:g="ddi:group:3_3" xmlns:l="ddi:logicalproduct:3_3" xmlns:p="ddi:physicaldataproduct:3_3" xmlns:pi="ddi:physicalinstance:3_3" xmlns:dc="http://purl.org/dc/elements/1.1/" xmlns:xhtml="http://www.w3.org/1999/xhtml" xmlns:xml="http://www.w3.org/XML/1998/namespace" isMaintainable="true" scopeOfUniqueness="Agency">
  <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-208-3:1</r:URN>
  <r:Agency>SND</r:Agency>
  <r:ID>2020-208-3</r:ID>
  <r:Version>1</r:Version>
  <g:ResourcePackage>
    <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-208-3.ResourcePackage:2.0</r:URN>
    <r:OtherMaterialScheme>
      <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-208-3.OtherMaterialScheme:2.0</r:URN>
      <r:OtherMaterial>
        <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-208-1:1.1</r:URN>
        <r:TypeOfMaterial>Dataset</r:TypeOfMaterial>
        <r:Citation>
          <r:Title>
            <r:String xml:lang="sv">Olika mönster mellan genetisk variation och lokal anpassning hos tall - 935 genotyper från 24 populationer av tall från Norra Europa</r:String>
            <r:String xml:lang="en">Divergent pattern between phenotypic and genetic variation in Scots pine - 935 genotyped from 24 populations of Pinus sylvestris across Northern Europe</r:String>
          </r:Title>
        </r:Citation>
        <r:ExternalURLReference>https://snd.se/catalogue/dataset/2020-208-1</r:ExternalURLReference>
      </r:OtherMaterial>
      <r:OtherMaterial>
        <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-208-2:1.1</r:URN>
        <r:TypeOfMaterial>Dataset</r:TypeOfMaterial>
        <r:Citation>
          <r:Title>
            <r:String xml:lang="sv">Olika mönster mellan genetisk variation och lokal anpassning hos tall - 746 obesläktade genotyper från 24 olika populationer av tall från Norra Europa</r:String>
            <r:String xml:lang="en">Divergent pattern between phenotypic and genetic variation in Scots pine - 746 unrelated genotyped Pinus sylvestris from 24 different populations across Northern Europe</r:String>
          </r:Title>
        </r:Citation>
        <r:ExternalURLReference>https://snd.se/catalogue/dataset/2020-208-2</r:ExternalURLReference>
      </r:OtherMaterial>
      <r:OtherMaterial>
        <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-208-4:1.1</r:URN>
        <r:TypeOfMaterial>Dataset</r:TypeOfMaterial>
        <r:Citation>
          <r:Title>
            <r:String xml:lang="sv">Olika mönster mellan genetisk variation och lokal anpassning hos tall - Miljövariabler och koordinater för varje population</r:String>
            <r:String xml:lang="en">Divergent pattern between phenotypic and genetic variation in Scots pine - Environmental variables and coordinates for each population</r:String>
          </r:Title>
        </r:Citation>
        <r:ExternalURLReference>https://snd.se/catalogue/dataset/2020-208-4</r:ExternalURLReference>
      </r:OtherMaterial>
      <r:OtherMaterial>
        <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-208-5:1.1</r:URN>
        <r:TypeOfMaterial>Dataset</r:TypeOfMaterial>
        <r:Citation>
          <r:Title>
            <r:String xml:lang="sv">Olika mönster mellan genetisk variation och lokal anpassning hos tall - Resultatsprotokoll från frystet av fröplantorna</r:String>
            <r:String xml:lang="en">Divergent pattern between phenotypic and genetic variation in Scots pine - Results from seedlings exposure to freezing temperatures</r:String>
          </r:Title>
        </r:Citation>
        <r:ExternalURLReference>https://snd.se/catalogue/dataset/2020-208-5</r:ExternalURLReference>
      </r:OtherMaterial>
    </r:OtherMaterialScheme>
    <a:OrganizationScheme>
      <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-208-3.OrganizationScheme-0:2.0</r:URN>
      <a:Individual>
        <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-208-3.Individual-0:2.0</r:URN>
        <r:UserAttributePair>
          <r:AttributeKey>affiliation</r:AttributeKey>
          <r:AttributeValue>Ecology and Environmental Science, Umeå University</r:AttributeValue>
        </r:UserAttributePair>
        <a:IndividualIdentification>
          <a:IndividualName>
            <a:FirstGiven>David</a:FirstGiven>
            <a:LastFamily>Hall</a:LastFamily>
            <a:FullName>
              <r:String>David Hall</r:String>
            </a:FullName>
          </a:IndividualName>
          <a:ResearcherID>
            <a:TypeOfID>ORCID</a:TypeOfID>
            <a:ResearcherIdentification>0000-0001-8152-2713</a:ResearcherIdentification>
          </a:ResearcherID>
        </a:IndividualIdentification>
      </a:Individual>
    </a:OrganizationScheme>
  </g:ResourcePackage>
  <s:StudyUnit>
    <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-208-3.StudyUnit:2.0</r:URN>
    <r:UserID typeOfUserID="datasetIdentifier">2020-208-3</r:UserID>
    <r:Citation>
      <r:Title>
        <r:String xml:lang="sv">Olika mönster mellan genetisk variation och lokal anpassning hos tall - Normaliserade skadegraden från frystest hos varje genotypad fröplanta</r:String>
        <r:String xml:lang="en">Divergent pattern between phenotypic and genetic variation in Scots pine - Phenotype estimates of the genotyped individuals</r:String>
      </r:Title>
      <r:Creator>
        <r:CreatorReference>
          <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-208-3.Individual-0:2.0</r:URN>
          <r:TypeOfObject>Individual</r:TypeOfObject>
        </r:CreatorReference>
      </r:Creator>
      <r:Publisher>
        <r:PublisherName>
          <r:String xml:lang="sv">Umeå universitet</r:String>
          <r:String xml:lang="en">Umeå University</r:String>
        </r:PublisherName>
      </r:Publisher>
      <r:Publisher>
        <r:PublisherName>
          <r:String xml:lang="sv">Umeå universitet</r:String>
          <r:String xml:lang="en">Umeå University</r:String>
        </r:PublisherName>
      </r:Publisher>
      <r:PublicationDate>
        <r:SimpleDate>2021-01-29</r:SimpleDate>
      </r:PublicationDate>
      <r:InternationalIdentifier>
        <r:IdentifierContent>10.5878/0msc-3v36</r:IdentifierContent>
        <r:ManagingAgency controlledVocabularyAgencyName="DOI">DOI</r:ManagingAgency>
      </r:InternationalIdentifier>
    </r:Citation>
    <r:Abstract>
      <r:Content xml:lang="sv">I den här studien undersökte vi den lokala anpassningen av tidspunkten för invintring och den genetiska variationen hos naturligt tallbestånd i norra Europa. Det geografiska området av studien sträcker sig från Norge i väster till och Komi-regionen i västra Ryssland fram till Uralbergen. Drygt 5000 frön från 56 populationer såddes upp och utsattes för frystemperaturer för att skatta deras frosttolerans och variationen i egenskapen över det geografiska området av denna studie. Från 24 av dessa 56 populationer samlades barr för att extrahera DNA till genotypning för att också kvantifiera den genetiska variationen hos tall i norra Europa och för att undersöka om det finns en tydlig populationsstruktur. Dessutom skulle det studeras om det finns spår av lokal anpassning i den del av genomet som sekvenserades och om dessa spår går att koppla till variationen i frosttolerans.

Den uppmätta normaliserade skadegraden hos varje fröplanta efter exponering för köld. Innehåller även populationsnummer och såddnummer.</r:Content>
      <r:Content xml:lang="en">In this study, we sampled 54 Scots pine populations from the Norwegian coast over the Arctic Circle to western Russia covering 47.3 longitudes or more than 1/8th of the earth’s circumference, which represents the most comprehensive coverage of Northern Europe to date. We inferred variation in autumn phenology and dormancy progression from freeze hardiness tests conducted on &gt;5000 seedlings, of which &gt;900 seedlings from 24 populations were genotyped using genotyping-by-sequencing (GBS). Our main goal was to evaluate adaptive responses in Scots pine at phenotype and genotype levels. Evaluation of cold hardiness along environmental and geographical gradients would contribute to an understanding of the performance of these gradients for predicting freeze damage levels. The genotype data allow evaluation of genetic variance across landscapes and thus shed light on the degree of genetic-environmental association and the recolonization history of Scots pine in Scandinavia.

The phenotypes of all genotyped individuals.  Includes each individuals population number and seedlot</r:Content>
    </r:Abstract>
    <r:Coverage>
      <r:TopicalCoverage>
        <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-208-3.TopicalCoverage:2.0</r:URN>
        <r:Subject xml:lang="en" controlledVocabularyID="10203" controlledVocabularyName="Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2025">Bioinformatics (Computational Biology)</r:Subject>
        <r:Subject xml:lang="sv" controlledVocabularyID="10203" controlledVocabularyName="Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2025">Bioinformatik (beräkningsbiologi)</r:Subject>
        <r:Subject xml:lang="en" controlledVocabularyID="10609" controlledVocabularyName="Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2025">Genetics and Genomics</r:Subject>
        <r:Subject xml:lang="sv" controlledVocabularyID="10609" controlledVocabularyName="Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2025">Genetik och genomik</r:Subject>
        <r:Subject xml:lang="en" controlledVocabularyID="10615" controlledVocabularyName="Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2025">Evolutionary Biology</r:Subject>
        <r:Subject xml:lang="sv" controlledVocabularyID="10615" controlledVocabularyName="Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2025">Evolutionsbiologi</r:Subject>
        <r:Subject xml:lang="en" controlledVocabularyID="40104" controlledVocabularyName="Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2025">Forest Science</r:Subject>
        <r:Subject xml:lang="sv" controlledVocabularyID="40104" controlledVocabularyName="Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2025">Skogsvetenskap</r:Subject>
        <r:Subject xml:lang="en" controlledVocabularyID="biota" controlledVocabularyName="INSPIRE topic categories">Biota</r:Subject>
        <r:Subject xml:lang="sv" controlledVocabularyID="biota" controlledVocabularyName="INSPIRE topic categories">Biologi och ekologi</r:Subject>
        <r:Subject xml:lang="en" controlledVocabularyID="geoscientific-information" controlledVocabularyName="INSPIRE topic categories">Geoscientific Information</r:Subject>
        <r:Subject xml:lang="sv" controlledVocabularyID="geoscientific-information" controlledVocabularyName="INSPIRE topic categories">Geovetenskap</r:Subject>
        <r:Subject xml:lang="en" controlledVocabularyID="environment" controlledVocabularyName="INSPIRE topic categories">Environment</r:Subject>
        <r:Subject xml:lang="sv" controlledVocabularyID="environment" controlledVocabularyName="INSPIRE topic categories">Miljö</r:Subject>
        <r:Subject xml:lang="en" controlledVocabularyID="location" controlledVocabularyName="INSPIRE topic categories">Location</r:Subject>
        <r:Subject xml:lang="sv" controlledVocabularyID="location" controlledVocabularyName="INSPIRE topic categories">Positionering</r:Subject>
        <r:Keyword xml:lang="en" controlledVocabularyID="21675" controlledVocabularyName="EnvThes">genetic population structure</r:Keyword>
        <r:Keyword xml:lang="en" controlledVocabularyID="21415" controlledVocabularyName="EnvThes">population structure</r:Keyword>
        <r:Keyword xml:lang="en" controlledVocabularyID="21639" controlledVocabularyName="EnvThes">population genetics</r:Keyword>
      </r:TopicalCoverage>
      <r:SpatialCoverage>
        <r:Description>
          <r:Content xml:lang="en">Data from Scots pine seeds collected from Norway, Sweden, Finland, Arkhangelsk- och Komi- regions of Russia</r:Content>
        </r:Description>
      </r:SpatialCoverage>
      <r:TemporalCoverage>
        <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-208-3.TemporalCoverage:2.0</r:URN>
        <r:ReferenceDate>
          <r:StartDate>1985</r:StartDate>
          <r:EndDate>2017</r:EndDate>
        </r:ReferenceDate>
      </r:TemporalCoverage>
    </r:Coverage>
    <a:Archive>
      <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-208-3.Archive:2.0</r:URN>
      <a:ArchiveSpecific>
        <a:Item>
          <a:Access>
            <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-208-3.Archive-ArchiveSpecificType-AccessType:2.0</r:URN>
            <a:TypeOfAccess controlledVocabularyName="info:eu-repo-Access-Terms vocabulary">openAccess</a:TypeOfAccess>
          </a:Access>
          <a:DataFileQuantity>3</a:DataFileQuantity>
        </a:Item>
      </a:ArchiveSpecific>
    </a:Archive>
  </s:StudyUnit>
</ddi:DDIInstance>