<ddi:DDIInstance xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:schemaLocation="ddi:instance:3_3 http://ddialliance.org/Specification/DDI-Lifecycle/3.3/XMLSchema/instance.xsd" xmlns:xsd="http://www.w3.org/2001/XMLSchema" xmlns:ddi="ddi:instance:3_3" xmlns:r="ddi:reusable:3_3" xmlns:s="ddi:studyunit:3_3" xmlns:d="ddi:datacollection:3_3" xmlns:a="ddi:archive:3_3" xmlns:c="ddi:conceptualcomponent:3_3" xmlns:cm="ddi:comparative:3_3" xmlns:g="ddi:group:3_3" xmlns:l="ddi:logicalproduct:3_3" xmlns:p="ddi:physicaldataproduct:3_3" xmlns:pi="ddi:physicalinstance:3_3" xmlns:dc="http://purl.org/dc/elements/1.1/" xmlns:xhtml="http://www.w3.org/1999/xhtml" xmlns:xml="http://www.w3.org/XML/1998/namespace" isMaintainable="true" scopeOfUniqueness="Agency">
  <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-36-2:1</r:URN>
  <r:Agency>SND</r:Agency>
  <r:ID>2020-36-2</r:ID>
  <r:Version>1</r:Version>
  <g:ResourcePackage>
    <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-36-2.ResourcePackage:2.0</r:URN>
    <r:OtherMaterialScheme>
      <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-36-2.OtherMaterialScheme:2.0</r:URN>
      <r:OtherMaterial>
        <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-36-1:1.1</r:URN>
        <r:TypeOfMaterial>Dataset</r:TypeOfMaterial>
        <r:Citation>
          <r:Title>
            <r:String xml:lang="sv">Studier av det cytosoliska Hsp70-systemet från jäst och dess roll i proteinhomeostas och reglering av livslängd - Det felveckande markörproteinet gus1-3-GFP och metacaspaset Mca1-GFP avbildat under mitten av den exponentiella tillväxtfasen i Hsp70-mutanta jäststammar</r:String>
            <r:String xml:lang="en">Study of the yeast cytosolic Hsp70-system in protein homeostasis and life span regulation - The misfolding protein marker gus1-3-GFP and the metacaspase Mca1-GFP during mid-exponential growth in yeast Hsp70-mutant yeast strains</r:String>
          </r:Title>
        </r:Citation>
        <r:ExternalURLReference>https://snd.se/catalogue/dataset/2020-36-1</r:ExternalURLReference>
      </r:OtherMaterial>
      <r:OtherMaterial>
        <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-36-3:1.1</r:URN>
        <r:TypeOfMaterial>Dataset</r:TypeOfMaterial>
        <r:Citation>
          <r:Title>
            <r:String xml:lang="sv">Studier av det cytosoliska Hsp70-systemet från jäst och dess roll i proteinhomeostas och reglering av livslängd - Intracellulär kolokalisering av chaperonet Ssa4-GFP och metacaspaset Mca1-RFP före och efter värmestress i en Hsp70-mutant jäststam</r:String>
            <r:String xml:lang="en">Study of the yeast cytosolic Hsp70-system in protein homeostasis and life span regulation - Intracellular colocalisation of the chaperone Ssa4-GFP and the metacaspase Mca1-RFP before and after heat stress in a Hsp70-mutant yeast cell strain</r:String>
          </r:Title>
        </r:Citation>
        <r:ExternalURLReference>https://snd.se/catalogue/dataset/2020-36-3</r:ExternalURLReference>
      </r:OtherMaterial>
      <r:OtherMaterial>
        <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-36-4:1.1</r:URN>
        <r:TypeOfMaterial>Dataset</r:TypeOfMaterial>
        <r:Citation>
          <r:Title>
            <r:String xml:lang="sv">Studier av det cytosoliska Hsp70-systemet från jäst och dess roll i proteinhomeostas och reglering av livslängd - Det molekylära chaperonet GFP-Hsp104 före och efter värmestress i  Hsp70-mutanta jäststammar</r:String>
            <r:String xml:lang="en">Study of the yeast cytosolic Hsp70-system in protein homeostasis and life span regulation - The molecular chaperone GFP-Hsp104 before and after heat stress in Hsp70-mutant yeast strains</r:String>
          </r:Title>
        </r:Citation>
        <r:ExternalURLReference>https://snd.se/catalogue/dataset/2020-36-4</r:ExternalURLReference>
      </r:OtherMaterial>
      <r:OtherMaterial>
        <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-36-5:1.1</r:URN>
        <r:TypeOfMaterial>Dataset</r:TypeOfMaterial>
        <r:Citation>
          <r:Title>
            <r:String xml:lang="sv">Studier av det cytosoliska Hsp70-systemet från jäst och dess roll i proteinhomeostas och reglering av livslängd - Bildsekvenser över tid av den felveckande proteinmarkören guk1-7-GFP under återhämtning efter värmestress i Hsp70- och Hsp104-mutanta jäststammar</r:String>
            <r:String xml:lang="en">Study of the yeast cytosolic Hsp70-system in protein homeostasis and life span regulation - Timelapse microscopy of the misfolding protein guk1-7-GFP in recovery after heat stress in Hsp70- and Hsp104-mutant yeast strains</r:String>
          </r:Title>
        </r:Citation>
        <r:ExternalURLReference>https://snd.se/catalogue/dataset/2020-36-5</r:ExternalURLReference>
      </r:OtherMaterial>
      <r:OtherMaterial>
        <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-36-6:1.1</r:URN>
        <r:TypeOfMaterial>Dataset</r:TypeOfMaterial>
        <r:Citation>
          <r:Title>
            <r:String xml:lang="sv">Studier av det cytosoliska Hsp70-systemet från jäst och dess roll i proteinhomeostas och reglering av livslängd - Det molekylära chaperonet GFP-Hsp104 avbildat före och efter värmestress i  Hsp70-mutanta jäststammar som komplementerats med exogena vildtyp- och chimärmutanta Hsp70-alleler</r:String>
            <r:String xml:lang="en">Study of the yeast cytosolic Hsp70-system in protein homeostasis and life span regulation - The molecular chaperone GFP-Hsp104 before and after heat stress in a Hsp70-mutant yeast strain with exogenous complementation of wildtype and chimaeric mutant alleles of yeast Hsp70-alleles</r:String>
          </r:Title>
        </r:Citation>
        <r:ExternalURLReference>https://snd.se/catalogue/dataset/2020-36-6</r:ExternalURLReference>
      </r:OtherMaterial>
      <r:OtherMaterial>
        <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-36-7:1.1</r:URN>
        <r:TypeOfMaterial>Dataset</r:TypeOfMaterial>
        <r:Citation>
          <r:Title>
            <r:String xml:lang="sv">Studier av det cytosoliska Hsp70-systemet från jäst och dess roll i proteinhomeostas och reglering av livslängd - Hsp70-mutanta jäststammar med det felveckande markörproteinet guk1-7-GFP, nukleolusmarkören Sik1-RFP och kärninfärgning med DAPI avbildad före, direkt efter och i återhämtning från värmestress</r:String>
            <r:String xml:lang="en">Study of the yeast cytosolic Hsp70-system in protein homeostasis and life span regulation - Hsp70-mutant yeast cells with the misfolding marker protein guk1-7-GFP, the nucleolar marker Sik1-RFP and nuclear staining with DAPI imaged before, directly after, and during recovery from heat stress</r:String>
          </r:Title>
        </r:Citation>
        <r:ExternalURLReference>https://snd.se/catalogue/dataset/2020-36-7</r:ExternalURLReference>
      </r:OtherMaterial>
      <r:OtherMaterial>
        <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-36-8:1.1</r:URN>
        <r:TypeOfMaterial>Dataset</r:TypeOfMaterial>
        <r:Citation>
          <r:Title>
            <r:String xml:lang="sv">Studier av det cytosoliska Hsp70-systemet från jäst och dess roll i proteinhomeostas och reglering av livslängd - Hsp70-mutanta jäststammar med det felveckande markörproteinet guk1-7-GFP samt med eller utan intakt HSP104-allel, avbildade under mitten av den exponentiella tillväxtfasen</r:String>
            <r:String xml:lang="en">Study of the yeast cytosolic Hsp70-system in protein homeostasis and life span regulation - Hsp70-mutant yeast strains with the misfolding marker protein guk1-7-GFP and with or without an intact HSP104-allele, imaged during mid-exponential growth</r:String>
          </r:Title>
        </r:Citation>
        <r:ExternalURLReference>https://snd.se/catalogue/dataset/2020-36-8</r:ExternalURLReference>
      </r:OtherMaterial>
      <r:OtherMaterial>
        <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-36-9:1.1</r:URN>
        <r:TypeOfMaterial>Dataset</r:TypeOfMaterial>
        <r:Citation>
          <r:Title>
            <r:String xml:lang="sv">Studier av det cytosoliska Hsp70-systemet från jäst och dess roll i proteinhomeostas och reglering av livslängd - Western blots av SDS-PAGE-geler med primära antikroppar mot Hsp70p och Pgk1p</r:String>
            <r:String xml:lang="en">Study of the yeast cytosolic Hsp70-system in protein homeostasis and life span regulation - Western blots of SDS-PAGE gels with primary antibodies against Hsp70p and Pgk1p</r:String>
          </r:Title>
        </r:Citation>
        <r:ExternalURLReference>https://snd.se/catalogue/dataset/2020-36-9</r:ExternalURLReference>
      </r:OtherMaterial>
      <r:OtherMaterial>
        <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-36-10:1.1</r:URN>
        <r:TypeOfMaterial>Dataset</r:TypeOfMaterial>
        <r:Citation>
          <r:Title>
            <r:String xml:lang="sv">Studier av det cytosoliska Hsp70-systemet från jäst och dess roll i proteinhomeostas och reglering av livslängd - Immunocytofluorescens av Hsp70-mutanta jäststammar med primära antikroppar mot Hsp42p</r:String>
            <r:String xml:lang="en">Study of the yeast cytosolic Hsp70-system in protein homeostasis and life span regulation - Immunocytofluoroscense of Hsp70-mutant yeast strains with primary antibodies against Hsp42p</r:String>
          </r:Title>
        </r:Citation>
        <r:ExternalURLReference>https://snd.se/catalogue/dataset/2020-36-10</r:ExternalURLReference>
      </r:OtherMaterial>
      <r:OtherMaterial>
        <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-36-11:1.1</r:URN>
        <r:TypeOfMaterial>Dataset</r:TypeOfMaterial>
        <r:Citation>
          <r:Title>
            <r:String xml:lang="sv">Studier av det cytosoliska Hsp70-systemet från jäst och dess roll i proteinhomeostas och reglering av livslängd - Silverfärgade 2D-geler av proteinextrakt från vildtyp och Hsp70-mutanta jäststammar</r:String>
            <r:String xml:lang="en">Study of the yeast cytosolic Hsp70-system in protein homeostasis and life span regulation - Silver stained 2D-gels of protein extracts from wild type and Hsp70-mutant yeast strains</r:String>
          </r:Title>
        </r:Citation>
        <r:ExternalURLReference>https://snd.se/catalogue/dataset/2020-36-11</r:ExternalURLReference>
      </r:OtherMaterial>
    </r:OtherMaterialScheme>
    <a:OrganizationScheme>
      <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-36-2.OrganizationScheme-0:2.0</r:URN>
      <a:Individual>
        <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-36-2.Individual-0:2.0</r:URN>
        <r:UserAttributePair>
          <r:AttributeKey>affiliation</r:AttributeKey>
          <r:AttributeValue>Institute of Biomedicine, Department of Microbiology and Immunology, University of Gothenburg</r:AttributeValue>
        </r:UserAttributePair>
        <a:IndividualIdentification>
          <a:IndividualName>
            <a:FirstGiven>Rebecca</a:FirstGiven>
            <a:LastFamily>Andersson</a:LastFamily>
            <a:FullName>
              <r:String>Rebecca Andersson</r:String>
            </a:FullName>
          </a:IndividualName>
          <a:ResearcherID>
            <a:TypeOfID>ORCID</a:TypeOfID>
            <a:ResearcherIdentification>0000-0003-3765-5038</a:ResearcherIdentification>
          </a:ResearcherID>
        </a:IndividualIdentification>
      </a:Individual>
      <a:Individual>
        <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-36-2.Individual-0:2.0</r:URN>
        <r:UserAttributePair>
          <r:AttributeKey>affiliation</r:AttributeKey>
          <r:AttributeValue>Institute of Biomedicine, Department of Microbiology and Immunology, University of Gothenburg</r:AttributeValue>
        </r:UserAttributePair>
        <a:IndividualIdentification>
          <a:IndividualName>
            <a:FirstGiven>Thomas</a:FirstGiven>
            <a:LastFamily>Nyström</a:LastFamily>
            <a:FullName>
              <r:String>Thomas Nyström</r:String>
            </a:FullName>
          </a:IndividualName>
          <a:ResearcherID>
            <a:TypeOfID>ORCID</a:TypeOfID>
            <a:ResearcherIdentification>0000-0001-5489-2903</a:ResearcherIdentification>
          </a:ResearcherID>
        </a:IndividualIdentification>
      </a:Individual>
    </a:OrganizationScheme>
  </g:ResourcePackage>
  <s:StudyUnit>
    <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-36-2.StudyUnit:2.0</r:URN>
    <r:UserID typeOfUserID="datasetIdentifier">2020-36-2</r:UserID>
    <r:Citation>
      <r:Title>
        <r:String xml:lang="sv">Studier av det cytosoliska Hsp70-systemet från jäst och dess roll i proteinhomeostas och reglering av livslängd - Det felveckande markörproteinet guk1-7-GFP avbildat före, under och i återhämtning från värmestress i Hsp70-mutanta jäststammar</r:String>
        <r:String xml:lang="en">Study of the yeast cytosolic Hsp70-system in protein homeostasis and life span regulation - The misfolding protein marker guk1-7-GFP before, during and after in recovery from heat shock stress in Hsp70-mutant yeast strains</r:String>
      </r:Title>
      <r:Creator>
        <r:CreatorReference>
          <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-36-2.Individual-0:2.0</r:URN>
          <r:TypeOfObject>Individual</r:TypeOfObject>
        </r:CreatorReference>
      </r:Creator>
      <r:Publisher>
        <r:PublisherName>
          <r:String xml:lang="sv">Göteborgs universitet</r:String>
          <r:String xml:lang="en">University of Gothenburg</r:String>
        </r:PublisherName>
      </r:Publisher>
      <r:Publisher>
        <r:PublisherName>
          <r:String xml:lang="sv">Göteborgs universitet</r:String>
          <r:String xml:lang="en">University of Gothenburg</r:String>
        </r:PublisherName>
      </r:Publisher>
      <r:PublicationDate>
        <r:SimpleDate>2020-12-16</r:SimpleDate>
      </r:PublicationDate>
      <r:InternationalIdentifier>
        <r:IdentifierContent>10.5878/8r0v-jk54</r:IdentifierContent>
        <r:ManagingAgency controlledVocabularyAgencyName="DOI">DOI</r:ManagingAgency>
      </r:InternationalIdentifier>
    </r:Citation>
    <r:Abstract>
      <r:Content xml:lang="sv">Vi har systematiskt studerat vilka funktioner hos de cytosoliska molekylära chaperonerna av klassen Hsp70 hos jäst som krävs för att upprätthålla en normal livslängd.

Fluorescensmikroskopibilder av levande jästceller i mitten av den exponentiella tillväxtfasen före stress, direkt efter 30 minuters värmestress samt 20, 40 och 60 minuter efter värmestress. Jästen är odlad i komplett syntetiskt medium med 2 % glukos som kolkälla. Alla stammar producerar det felveckade markörproteinet guk1-7-GFP. 
Datasetet har samlats in genom fluorescensmikroskopi.
Bildfilerna är i Carl Zeiss Image-format (.czi).</r:Content>
      <r:Content xml:lang="en">Our study aims to answer the question "Which functions of the Hsp70 class of molecular chaperones are essential for yeast to maintain a standard replicative life span?". To answer this question, we utilised the disparate functions of the Hsp70's Ssa1 and 2 and their paralog Ssa4 in a yeast strain that lacks Ssa1/2 but has an ectopically increased production of Ssa4. We have gathered data on the behaviour of several different markers for protein aggregation under different circumstances, as well as data on proteins from other classes of molecular chaperones. The bulk of the data is in the form of multichannel microscopy images from widefield microscopy, with a few sets of western blots of protein extracts.

Fluorescence microscopy of live yeast cells at mid-exponential growth before stress, directly after 30 minutes of heat shock, and 20, 40 and 60 minutes after heat shock. The yeast is grown in complete synthetic medium with 2 % glucose as carbon source. All strains produce the aggregate marker protein guk1-7-GFP.
The dataset was collected through fluorescence microscopy.
The image files are provided in Carl Zeiss Image format (.czi).</r:Content>
    </r:Abstract>
    <r:Coverage>
      <r:TopicalCoverage>
        <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-36-2.TopicalCoverage:2.0</r:URN>
        <r:Subject xml:lang="en" controlledVocabularyID="10604" controlledVocabularyName="Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2025">Cell Biology</r:Subject>
        <r:Subject xml:lang="sv" controlledVocabularyID="10604" controlledVocabularyName="Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2025">Cellbiologi</r:Subject>
        <r:Subject xml:lang="en" controlledVocabularyID="10606" controlledVocabularyName="Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2025">Microbiology</r:Subject>
        <r:Subject xml:lang="sv" controlledVocabularyID="10606" controlledVocabularyName="Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2025">Mikrobiologi</r:Subject>
        <r:Subject xml:lang="en" controlledVocabularyID="30108" controlledVocabularyName="Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2025">Cell and Molecular Biology</r:Subject>
        <r:Subject xml:lang="sv" controlledVocabularyID="30108" controlledVocabularyName="Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2025">Cell- och molekylärbiologi</r:Subject>
        <r:Subject xml:lang="en" controlledVocabularyID="10616" controlledVocabularyName="Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2025">Molecular Biology</r:Subject>
        <r:Subject xml:lang="sv" controlledVocabularyID="10616" controlledVocabularyName="Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2025">Molekylärbiologi</r:Subject>
        <r:Keyword xml:lang="en" controlledVocabularyID="D018832" controlledVocabularyName="MeSH">Molecular Chaperones</r:Keyword>
        <r:Keyword xml:lang="sv" controlledVocabularyID="D018832" controlledVocabularyName="MeSH">Molekylära chaperoner</r:Keyword>
        <r:Keyword xml:lang="en" controlledVocabularyID="D018840" controlledVocabularyName="MeSH">HSP70 Heat-Shock Proteins</r:Keyword>
        <r:Keyword xml:lang="sv" controlledVocabularyID="D018840" controlledVocabularyName="MeSH">HSP70-värmechockproteiner</r:Keyword>
        <r:Keyword xml:lang="en" controlledVocabularyID="D057165" controlledVocabularyName="MeSH">Proteostasis Deficiencies</r:Keyword>
        <r:Keyword xml:lang="sv" controlledVocabularyID="D057165" controlledVocabularyName="MeSH">Proteostasbrist</r:Keyword>
      </r:TopicalCoverage>
      <r:SpatialCoverage />
      <r:TemporalCoverage>
        <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-36-2.TemporalCoverage:2.0</r:URN>
        <r:ReferenceDate>
          <r:StartDate>2012</r:StartDate>
          <r:EndDate>2020</r:EndDate>
        </r:ReferenceDate>
      </r:TemporalCoverage>
    </r:Coverage>
    <r:AnalysisUnit controlledVocabularyID="AnalysisUnit" controlledVocabularyAgencyName="DDI Alliance">snd.a01</r:AnalysisUnit>
    <r:AnalysisUnitsCovered>
      <r:String xml:lang="en">Cells</r:String>
      <r:String xml:lang="sv">Celler</r:String>
    </r:AnalysisUnitsCovered>
    <d:DataCollection>
      <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-36-2.DataCollection:2.0</r:URN>
      <d:CollectionEvent>
        <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-36-2.CollectionEvent:2.0</r:URN>
        <d:DataCollectorOrganizationReference>
          <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-36-2.Organization-0:2.0</r:URN>
          <d:ID />
          <d:Version />
          <d:TypeOfObject>Organization</d:TypeOfObject>
        </d:DataCollectorOrganizationReference>
        <d:DataCollectionDate>
          <r:StartDate>2017-05-15</r:StartDate>
          <r:EndDate>2017-05-26</r:EndDate>
        </d:DataCollectionDate>
        <d:ModeOfCollection>
          <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-36-2.CollectionEvent-0-ModeOfCollectionType:2.0</r:URN>
          <d:TypeOfModeOfCollection>Biological tests</d:TypeOfModeOfCollection>
          <r:Description>
            <r:Content xml:lang="en">Biological tests</r:Content>
            <r:Content xml:lang="sv">Biologiska provtagningar</r:Content>
          </r:Description>
        </d:ModeOfCollection>
      </d:CollectionEvent>
    </d:DataCollection>
    <a:Archive>
      <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-36-2.Archive:2.0</r:URN>
      <a:ArchiveSpecific>
        <a:Item>
          <a:Access>
            <r:URN>urn:ddi:se.researchdata:2020-36-2.Archive-ArchiveSpecificType-AccessType:2.0</r:URN>
            <a:TypeOfAccess controlledVocabularyName="info:eu-repo-Access-Terms vocabulary">openAccess</a:TypeOfAccess>
          </a:Access>
          <a:DataFileQuantity>17</a:DataFileQuantity>
        </a:Item>
      </a:ArchiveSpecific>
    </a:Archive>
  </s:StudyUnit>
</ddi:DDIInstance>