X-inaktivering under T-cellsutvecklingen i thymus A landscape of X-inactivation during human T-cell development in the thymus 2022-112-1-1 https://doi.org/10.5878/frw5-wd59 Swedish National Data Service Svensk nationell datatjänst Landing page X-inaktivering under T-cellsutvecklingen i thymus A landscape of X-inactivation during human T-cell development in the thymus 2022-112-1-1 https://doi.org/10.5878/frw5-wd59 Ekwall, Olov Ekwall, Olov 2018-02752 2018-02752 ALFGBG-965795 ALFGBG-965795 Swedish National Data Service Svensk nationell datatjänst Landing page Hemic and Immune Systems Blod- och immunsystem Immune System Immunsystem Cardiovascular Surgical Procedures Kardiovaskulära kirurgiska ingrepp T-Lymphocytes T-lymfocyter Thymus Gland Bräss Thymocytes Tymocyter The aim of the study was to investigate X-inactivation during human T-cell development in the thymus. Thymocytes from six different developmental stages from seven individuals were isolated and studied regarding gene expression. The data set contains data from RNA sequencing, DNA methylation and whole exome sequencing. The dataset contains data from the manuscript "A landscape of X-inactivation during human T-cell development in the thymus" by Gylemo et al, and consists of results from RNA sequencing (fastq.gz), analysis of DNA methylation (Grn.idat) and whole exome DNA sequencing (fastq.gz) of six developmental stages of thymocytes from seven individuals. The data is described on individual and cell-type level in the tab-separated metadata files (.tsv). MD5 checksums for each file are included. Huvudsyftet med studien har varit att studera X-inaktivering under T-cellsutveckling i human thymus. I studien har sex olika utvecklingsstadier av thymocyter isolerats från sju individer och studerats avseende genuttryck. Datamaterialet innehåller data från RNA-sekvensering, DNA-metylering och helexom-sekvensering av DNA. Datasetet innehåller data från manuskriptet "A landscape of X-inactivation during human T-cell development in the thymus" av Gylemo et al och innehåller resultat från RNA-sekvensering (fastq.gz), analys av DNA-metylering (Grn.idat) och DNA-exomsekvensering (fastq.gz) av sex olika mognadsstadier av thymocyter från totalt sju individer. Data är beskrivna på individ- och celltypsnivå i de bifogade tabbseparerade metadatafilerna (.tsv). Kontrollsummor i MD5-format för datafilerna finns tillgängliga. Sweden Sverige CellsCells CellerCeller Isolated thymocytes from seven persons were studied, three boys and four girls, all under 3 yrs that underwent cardiac surgery for correction of congenital heart defects. Isolerade thymocyter från sju personer studerades. Försökspersonerna var tre pojkar och fyra flickor, alla under 3 år, som genomgick korrigerande hjärtkirurgi för medfödda hjärtmissbildningar. Numeric Text OtherOther ÖvrigtÖvrigt Access to data through SND. Access to data is restricted. Åtkomst till data via SND. Tillgång till data är begränsad. restrictedAccess Björn Gylemo, Antonio Lentini, Christina Lundqvist, Maike Bensberg, Alessandro Camponeschi, Dora Goldman, Aida Selimović, Olov Ekwall, Colm E. Nestor. (2022). A landscape of X-inactivation during human T-cell development [submitted manuscript]. Björn Gylemo, Antonio Lentini, Christina Lundqvist, Maike Bensberg, Alessandro Camponeschi, Dora Goldman, Aida Selimović, Olov Ekwall, Colm E. Nestor. (2022). A landscape of X-inactivation during human T-cell development [submitted manuscript]. 2022