X-inaktivering under T-cellsutvecklingen i thymus A landscape of X-inactivation during human T-cell development in the thymus 2022-112-1-2 https://doi.org/10.5878/ayae-p143 Swedish National Data Service Svensk nationell datatjänst Landing page X-inaktivering under T-cellsutvecklingen i thymus A landscape of X-inactivation during human T-cell development in the thymus 2022-112-1-2 https://doi.org/10.5878/ayae-p143 Ekwall, Olov Ekwall, Olov 2018-02752 2018-02752 ALFGBG-965795 ALFGBG-965795 Swedish National Data Service Svensk nationell datatjänst Landing page Hemic and Immune Systems Blod- och immunsystem Immune System Immunsystem Cardiovascular Surgical Procedures Kardiovaskulära kirurgiska ingrepp T-Lymphocytes T-lymfocyter Thymus Gland Bräss Thymocytes Tymocyter The aim of the study was to investigate X-inactivation during human T-cell development in the thymus. Thymocytes from six different developmental stages from nine individuals were isolated and studied regarding gene expression. The data set contains data from RNA sequencing, DNA methylation and whole exome sequencing. The dataset contains data from the manuscript "A landscape of X-inactivation during human T-cell development in the thymus" by Gylemo et al, and consists of results from RNA sequencing (fastq.gz), analysis of DNA methylation (Grn.idat), Smart-seq2 single-cell RNA sequencing (fastq.gz) and whole exome DNA sequencing (fastq.gz) of six developmental stages of thymocytes from nine individuals. The data is described on individual and cell-type level in the tab-separated metadata files (.tsv). MD5 checksums for each file are included. Huvudsyftet med studien har varit att studera X-inaktivering under T-cellsutveckling i human thymus. I studien har sex olika utvecklingsstadier av thymocyter isolerats från nio individer och studerats avseende genuttryck. Datamaterialet innehåller data från RNA-sekvensering, DNA-metylering och helexom-sekvensering av DNA. Datasetet innehåller data från manuskriptet "A landscape of X-inactivation during human T-cell development in the thymus" av Gylemo et al och innehåller resultat från RNA-sekvensering (fastq.gz), analys av DNA-metylering (Grn.idat), Smart-seq2 single-cell RNA sekvensering (fastq.gz) och DNA-exomsekvensering (fastq.gz) av sex olika mognadsstadier av thymocyter från totalt nio individer. Data är beskrivna på individ- och celltypsnivå i de bifogade tabbseparerade metadatafilerna (.tsv). Kontrollsummor i MD5-format för datafilerna finns tillgängliga. Sweden Sverige CellsCells CellerCeller Isolated thymocytes from nine persons were studied, four boys and five girls, all under 3 years that underwent cardiac surgery for correction of congenital heart defects. Isolerade thymocyter från nio personer studerades. Försökspersonerna var fyra pojkar och fem flickor, alla under 3 år, som genomgick korrigerande hjärtkirurgi för medfödda hjärtmissbildningar. Numeric Text OtherOther ÖvrigtÖvrigt Access to data through SND. Access to data is restricted. Åtkomst till data via SND. Tillgång till data är begränsad. restrictedAccess Björn Gylemo, Maike Bensberg, Viktoria Hennings, Christina Lundqvist, , Alessandro Camponeschi, Dora Goldman, Aida Selimović, Antonio Lentini, Olov Ekwall, Colm E. Nestor (2024). A landscape of X-inactivation during human T-cell development [manuscript, resubmitted after revision]. Björn Gylemo, Maike Bensberg, Viktoria Hennings, Christina Lundqvist, , Alessandro Camponeschi, Dora Goldman, Aida Selimović, Antonio Lentini, Olov Ekwall, Colm E. Nestor (2024). A landscape of X-inactivation during human T-cell development [manuscript, resubmitted after revision]. 2024