Data för: Gut microbiota markers in early childhood are linked to farm living, pets in household and allergy Data for: Gut microbiota markers in early childhood are linked to farm living, pets in household and allergy 2024-480-1 https://doi.org/10.5878/j3eq-7y09 Swedish National Data Service Svensk nationell datatjänst Landing page Data för: Gut microbiota markers in early childhood are linked to farm living, pets in household and allergy Data for: Gut microbiota markers in early childhood are linked to farm living, pets in household and allergy 2024-480-1 https://doi.org/10.5878/j3eq-7y09 10.1371/journal.pone.0313078 Adlerberth, Ingegerd Adlerberth, Ingegerd Wold, Agnes Wold, Agnes Hesselmar, Bill Hesselmar, Bill ALFGBG966243 ALFGBG966243 ALFGBG720181 ALFGBG720181 K98-06X-12612-01A K98-06X-12612-01A VGFOUREG-12007 VGFOUREG-12007 Swedish National Data Service Svensk nationell datatjänst Landing page Child Barn Pets Sällskapsdjur Hypersensitivity Överkänslighet Breast Feeding Amning Bacteria Bakterier Infant Spädbarn Intestines Tarmar Colony Count, Microbial Mikrobiell koloniräkning Gastrointestinal Microbiome Tarmflora Birth Cohort Födelsekohort HEALTH HÄLSA These data underly a study which described longitudinal gut microbiota development during early childhood, and investigated associations with early life exposures and allergy outcomes. The dataset includes variables on: Host factors and early life exposures: sex, parental allergy, farm residence, pet ownership, and breastfeeding Gut microbiota development: presence and population counts of selected bacterial groups at 9 timepoints between 3 days and 18 months of age. These data were obtained using quantitative bacterial culture of fecal samples, targeting key facultative and anaerobic bacteria of the infant gut (exception: samples obtained at 3 days of age were not cultured quantitatively and targeted facultative bacteria only). Allergy at 3 and 8 years of age: clinical diagnosis of allergy (eczema, food allergy, allergic rhinoconjunctivitis or asthma) Dessa data ligger till grund för en studie som beskriver tarmflorans utveckling över tid under tidig barndom, och undersöker tarmflorans sammansättning i relation till vissa tidiga exponeringar och till senare allergiutveckling. Datasetet inkluderar följande variabler: Värdfaktorer och tidiga exponeringar: kön, hereditet för allergi, uppväxt på bondgård, husdjur och amning. Tarmfloran: förekomst och populationstal för ett antal olika bakteriegrupper vid 9 provtagningstillfällen mellan 3 dagar och 18 månaders ålder. Bakteriadata är baserade på kvantitativ odling av faecesprover med identifiering av fakultativa och anaeroba bakterier som är vanligt förekommande i den tidiga tarmfloran (undantag prover tagna vid 3 dagars ålder som inte odlades kvantitativt och enbart fakultativa bakterier identifierades i dessa). Allergi vid 3 och 8 års ålder: klinisk allergidiagnos (eksem, födoämnesallergi, allergisk rinokonjunktivit eller astma) 2005-09 2015-05 Sweden Sverige IndividualIndividual IndividIndivid Children participating in the FARMFLORA birth cohort study. Around half of these children lived on a farm and half in the same rural area. The study followed the children from birth up to 8 years of age. Barn från födelsekohorten FARMFLORA, varav ungefär hälften bodde på en bondgård och hälften i samma region på landsbygden. Barnen följdes från födseln upp till 8 års ålder. Numeric Longitudinal: Cohort/Event-basedLongitudinal: Cohort/Event-based Longitudinell: Kohort/HändelsebaseradLongitudinell: Kohort/Händelsebaserad The aim of the FARMFLORA study was to map which factors in the farming environment protect against allergy development. The FARMFLORA birth cohort included 65 children of whom 28 lived on dairy farms and 37 lived in a rural area but not on a farm in the Västra Götaland region in South-West Sweden. Recruitment to the cohort occurred between September 2005 and March 2008, by approaching pregnant women at maternity clinics in the study area. The children included were born at ≥38 weeks of gestation.The aim of the FARMFLORA study was to map which factors in the farming environment protect against allergy development. The FARMFLORA birth cohort included 65 children of whom 28 lived on dairy farms and 37 lived in a rural area but not on a farm in the Västra Götaland region in South-West Sweden. Recruitment to the cohort occurred between September 2005 and March 2008, by approaching pregnant women at maternity clinics in the study area. The children included were born at ≥38 weeks of gestation. Syftet med FARMFLORA studien var att kartlägga vilka faktorer i bondgårdsmiljön som skyddar mot allergiutveckling. Födelsekohorten FARMFLORA inkluderade 28 barn från familjer på bondgårdar med mjölkproduktion och 37 kontrollbarn från familjer som bodde på landet men inte på bondgård i Västra Götalandsregionen i sydvästra Sverige. Barnen i kohorten var födda i graviditetsvecka ≥38. Rekrytering till kohorten skedde genom mödravårdscentraler i området mellan september 2005 och mars 2008.Syftet med FARMFLORA studien var att kartlägga vilka faktorer i bondgårdsmiljön som skyddar mot allergiutveckling. Födelsekohorten FARMFLORA inkluderade 28 barn från familjer på bondgårdar med mjölkproduktion och 37 kontrollbarn från familjer som bodde på landet men inte på bondgård i Västra Götalandsregionen i sydvästra Sverige. Barnen i kohorten var födda i graviditetsvecka ≥38. Rekrytering till kohorten skedde genom mödravårdscentraler i området mellan september 2005 och mars 2008. Fecal samples were collected from children on nine occasions from 3 days to 18 months of age. The samples were subjected to quantative bacterial culture, and key bacteria of the infant gut were identified and quantified (exception: samples obtained at 3 days of age were not cultured quantitatively). Data on farm residence, pets in the household and parental allergy were registered upon inclusion Data on breastfeeding was registered by the parents and collected by telephone interviews Allergy was diagnosed by clinical evaluation of children using set diagnostic criteria for atopic eczema, food allergy, asthma or allergic rhinoconjunctivitis by experienced pediatricians at three and eight years of ageFecal samples were collected from children on nine occasions from 3 days to 18 months of age. The samples were subjected to quantative bacterial culture, and key bacteria of the infant gut were identified and quantified (exception: samples obtained at 3 days of age were not cultured quantitatively). Data on farm residence, pets in the household and parental allergy were registered upon inclusion Data on breastfeeding was registered by the parents and collected by telephone interviews Allergy was diagnosed by clinical evaluation of children using set diagnostic criteria for atopic eczema, food allergy, asthma or allergic rhinoconjunctivitis by experienced pediatricians at three and eight years of age Fecesprover erhölls från barnen vid 9 provtagningstillfällen mellan 3 dagar och 18 månaders ålder. Fecesprover odlades kvantitativt och bakterier vanligt förekommande i småbarns tarmflora identifierades och kvantifierades (undantag: prover tagna vid 3 dagars ålder odlades inte kvantitativt). Uppgifter om boende på bondgård, husdjur i hemmet, och allergi hos föräldrarna registrerades i samband med inklusion i studien. Amningsdata registrerades av föräldrarna och dessa uppgifter samlades in vid telefonintervjuer. Allergi hos barnen diagnosticerades av erfarna pediatriker i samband med klinisk undersökning vid 3 och 8 års ålder. I förväg fastställda kriterier för diagnos av atopiskt eksem, födoämnesallergi, allergisk rinokonjunktivit och astma tillämpades.Fecesprover erhölls från barnen vid 9 provtagningstillfällen mellan 3 dagar och 18 månaders ålder. Fecesprover odlades kvantitativt och bakterier vanligt förekommande i småbarns tarmflora identifierades och kvantifierades (undantag: prover tagna vid 3 dagars ålder odlades inte kvantitativt). Uppgifter om boende på bondgård, husdjur i hemmet, och allergi hos föräldrarna registrerades i samband med inklusion i studien. Amningsdata registrerades av föräldrarna och dessa uppgifter samlades in vid telefonintervjuer. Allergi hos barnen diagnosticerades av erfarna pediatriker i samband med klinisk undersökning vid 3 och 8 års ålder. I förväg fastställda kriterier för diagnos av atopiskt eksem, födoämnesallergi, allergisk rinokonjunktivit och astma tillämpades. Access to data through SND. Access to data is restricted. Åtkomst till data via SND. Tillgång till data är begränsad. restrictedAccess Ljung A, Gio-Batta M, Hesselmar B, Imberg H, Rabe H, et al. (2024) Gut microbiota markers in early childhood are linked to farm living, pets in household and allergy. PLOS ONE 19(11): e0313078. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0313078 Ljung A, Gio-Batta M, Hesselmar B, Imberg H, Rabe H, et al. (2024) Gut microbiota markers in early childhood are linked to farm living, pets in household and allergy. PLOS ONE 19(11): e0313078. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0313078 10.1371/journal.pone.0313078 2024