Data för: Major gut microbiota perturbations in firstborn infants compared to those with older siblings soon after delivery Data for: Major gut microbiota perturbations in firstborn infants compared to those with older siblings soon after delivery 2024-526-1 https://doi.org/10.5878/ea19-6s81 Swedish National Data Service Svensk nationell datatjänst Landing page Data för: Major gut microbiota perturbations in firstborn infants compared to those with older siblings soon after delivery Data for: Major gut microbiota perturbations in firstborn infants compared to those with older siblings soon after delivery 2024-526-1 https://doi.org/10.5878/ea19-6s81 10.1186/s12887-025-06015-7 Adlerberth, Ingegerd Adlerberth, Ingegerd Wold, Agnes Wold, Agnes Hesselmar, Bill Hesselmar, Bill ALFGBG966243 ALFGBG966243 ALFGBG720181 ALFGBG720181 K98-06X-12612-01A K98-06X-12612-01A VGFOUREG-12007 VGFOUREG-12007 Swedish National Data Service Svensk nationell datatjänst Landing page Breast Feeding Amning Bacteria Bakterier Cesarean Section Kejsarsnitt Infant Spädbarn Intestines Tarmar Colony Count, Microbial Mikrobiell koloniräkning Antibiotic Prophylaxis Antibiotikaprofylax Siblings Syskon Delivery, Obstetric Förlossning Gastrointestinal Microbiome Tarmflora Birth Cohort Födelsekohort HEALTH HÄLSA These data underly a study which investigated the influence of early life exposures on longitudinal gut microbiota development during early childhood. The dataset includes variables on: Host factors and early life exposures: sex, delivery mode (caesarian section or vaginal), older siblings (yes or no), exposure to antibiotics during delivery (intrapartum antibiotics, yes or no) and breastfeeding. Gut microbiota development: presence and population counts of selected bacterial groups at 9 timepoints between 3 days and 18 months of age. These data were obtained using quantitative bacterial culture of fecal samples, targeting key facultative and anaerobic bacteria of the infant gut (exception: samples obtained at 3 days of age were not cultured quantitatively and targeted facultative bacteria only). Dessa data ligger till grund för en studie som undersöker sammansättning av tarmfloran över tid under tidig barndom i relation till vissa tidiga exponeringar. Datasetet inkluderar följande variabler: Värdfaktorer och tidiga exponeringar: kön, förlossningssätt (kejsarsnitt eller vaginalt), äldre syskon (ja eller nej), antibiotikaexponering under förlossningen och amning. Tarmfloran: förekomst och populationstal för ett antal olika bakteriegrupper vid 9 provtagningstillfällen mellan 3 dagar och 18 månaders ålder. Bakteriadata är baserade på kvantitativ odling av faecesprover med identifiering av fakultativa och anaeroba bakterier som är vanligt förekommande i den tidiga tarmfloran (undantag prover tagna vid 3 dagars ålder som inte odlades kvantitativt och enbart fakultativa bakterier identifierades i dessa). 2005-09 2009-09 Sweden Sverige Children participating in the FARMFLORA birth cohort study. Around half of these children lived on a farm and half lived in the same rural area but not on a farm. Barn från födelsekohorten FARMFLORA, varav ungefär hälften bodde på en bondgård och hälften i samma region på landsbygden. Numeric The FARMFLORA birth cohort included 65 children of whom 28 lived on dairy farms and 37 lived in the same rural area but not on a farm in the Västra Götaland region in South-West Sweden. Recruitment to the cohort occurred between September 2005 and March 2008, by approaching pregnant women at maternity clinics in the study area. The children included were born at ≥38 weeks of gestation.The FARMFLORA birth cohort included 65 children of whom 28 lived on dairy farms and 37 lived in the same rural area but not on a farm in the Västra Götaland region in South-West Sweden. Recruitment to the cohort occurred between September 2005 and March 2008, by approaching pregnant women at maternity clinics in the study area. The children included were born at ≥38 weeks of gestation. Födelsekohorten FARMFLORA inkluderade 28 barn från familjer på bondgårdar med mjölkproduktion och 37 kontrollbarn från familjer som bodde på landet men inte på bondgård i Västra Götalandsregionen i sydvästra Sverige. Barnen i kohorten var födda i graviditetsvecka ≥38. Rekrytering till kohorten skedde genom mödravårdscentraler i området mellan september 2005 och mars 2008.Födelsekohorten FARMFLORA inkluderade 28 barn från familjer på bondgårdar med mjölkproduktion och 37 kontrollbarn från familjer som bodde på landet men inte på bondgård i Västra Götalandsregionen i sydvästra Sverige. Barnen i kohorten var födda i graviditetsvecka ≥38. Rekrytering till kohorten skedde genom mödravårdscentraler i området mellan september 2005 och mars 2008. Fecal samples were collected from children on nine occasions from 3 days to 18 months of age. The samples were subjected to quantative bacterial culture, and key bacteria of the infant gut were identified and quantified (exception: samples obtained at 3 days of age were not cultured quantitatively). Data on delivery mode (caesarian section or vaginal) and exposure to antibiotics during delivery (intrapartum antibiotics) were retrieved from hospital records. Data on older siblings were registered on inclusion. Data on breastfeeding was registered by the parents and collected at 6, 12 and 18 months of age.Fecal samples were collected from children on nine occasions from 3 days to 18 months of age. The samples were subjected to quantative bacterial culture, and key bacteria of the infant gut were identified and quantified (exception: samples obtained at 3 days of age were not cultured quantitatively). Data on delivery mode (caesarian section or vaginal) and exposure to antibiotics during delivery (intrapartum antibiotics) were retrieved from hospital records. Data on older siblings were registered on inclusion. Data on breastfeeding was registered by the parents and collected at 6, 12 and 18 months of age. Fecesprover erhölls från barnen vid 9 provtagningstillfällen mellan 3 dagar och 18 månaders ålder. Proverna odlades kvantitativt och bakterier vanligt förekommande i småbarns tarmflora identifierades och kvantifierades (undantag: prover tagna vid 3 dagars ålder odlades inte kvantitativt). Uppgifter om förlossningssätt (kejsarsnitt eller vaginalt) och exponering för antibiotika i samband med förlossningen hämtades från mödrarnas förlossningsjournaler. Uppgifter om äldre syskon registrerades i samband med inklusion i studien. Amningsdata registrerades av föräldrarna och dessa uppgifter samlades in vid 6, 12 och 18 månaders ålder.Fecesprover erhölls från barnen vid 9 provtagningstillfällen mellan 3 dagar och 18 månaders ålder. Proverna odlades kvantitativt och bakterier vanligt förekommande i småbarns tarmflora identifierades och kvantifierades (undantag: prover tagna vid 3 dagars ålder odlades inte kvantitativt). Uppgifter om förlossningssätt (kejsarsnitt eller vaginalt) och exponering för antibiotika i samband med förlossningen hämtades från mödrarnas förlossningsjournaler. Uppgifter om äldre syskon registrerades i samband med inklusion i studien. Amningsdata registrerades av föräldrarna och dessa uppgifter samlades in vid 6, 12 och 18 månaders ålder. Biological testsBiological tests Biologiska provtagningarBiologiska provtagningar Access to data through SND. Access to data is restricted. Åtkomst till data via SND. Tillgång till data är begränsad. restrictedAccess Ljung A, Gio-Batta M, Hesselmar B, Rabe H, Nowrouzian FL, Johansen S, Wold AE, Adlerberth I. Major gut microbiota perturbations in firstborn infants compared to those with older siblings soon after delivery. BMC Pediatrics 25, 780 (2025). https://doi.org/10.1186/s12887-025-06015-7 Ljung A, Gio-Batta M, Hesselmar B, Rabe H, Nowrouzian FL, Johansen S, Wold AE, Adlerberth I. Major gut microbiota perturbations in firstborn infants compared to those with older siblings soon after delivery. BMC Pediatrics 25, 780 (2025). https://doi.org/10.1186/s12887-025-06015-7 10.1186/s12887-025-06015-7 2025