Antibiotikaresistens i kommensala E. coli-bakterier, samt gårdskaraktäristika, på vietnamesiska kycklinggårdar Antimicrobial resistance in commensal E. coli bacteria, and farm characteristics, on Vietnamese chicken farms 2025-178-1 SLU.kv.2023.4.4.IÄ-4 https://doi.org/10.5878/d9ck-bd78 Swedish National Data Service Svensk nationell datatjänst Landing page Antibiotikaresistens i kommensala E. coli-bakterier, samt gårdskaraktäristika, på vietnamesiska kycklinggårdar Antimicrobial resistance in commensal E. coli bacteria, and farm characteristics, on Vietnamese chicken farms 2025-178-1 SLU.kv.2023.4.4.IÄ-4 https://doi.org/10.5878/d9ck-bd78 Nohrborg, Sandra Nohrborg, Sandra Magnusson, Ulf Magnusson, Ulf 2018-01093_3 2018-01093_3 Swedish National Data Service Svensk nationell datatjänst Landing page livestock farmers husdjursproducenter antimicrobial drugs antimikrobiella läkemedel antibiotics antibiotika public health folkhälsa public health medicine folkhälsovetenskap antibiotic resistance antibiotikaresistens poultry farming fjäderfäskötsel (arbete) veterinary medicine veterinärmedicin veterinary drugs djurläkemedel livestock industry husdjursskötsel (ekonomi) escherichia coli To increase the understanding of the antibiotic resistance situation small- and medium-scale chicken farming in Vietnam, a study was performed at 305 chicken farms in Thai Nguyen province in Northern Vietnam. The study presents data on antibiotic resistance in commensal E. coli bacteria from healthy chickens (3 from each farm). In total 764 E. coli isolates were analysed for resistance against 15 antibiotic substances belonging to 11 antibiotic classes. Data on multi-drug resistance was also compiled. During the same farm visits, data for a questionnaire-based study was also collected (dataset, and related paper, already published - see related resource), to evaluate farmers' practices and knowledge regarding AMR, as well as farm characteristics. Knowledge and practices were evaluated by using a statistical method called item response theory (IRT). This method is described in more detail in the already published paper (see related resource). Some of those variables are also included in the current dataset since the purpose of the study, besides presenting resistance data, was to search for associations between farm(-er) characteristics and AMR occurrence. The dataset consists of 765 rows and 37 columns. Variable names and answers are coded and explanations can be found in a separate file, "Chicken_farm_AMR_Vietnam_2025_explanations". Some of the variables that are re-used in this dataset has been renamed in the data analysis process. For easier comparisons of the datasets, both the old and new variable names are included in the explanation file. The questionnaire can be found in the data description published elsewhere (see associated data description). För att öka förståelsen för antibiotikaresistenssituationen i små- och medelskalig kycklinguppfödning i Vietnam, har en studie genomförts på 305 kycklinggårdar i Thai Nguyen-provinsen, norra Vietnam. Studien presenterar data gällande resistens i kommensala E. coli-bakterier från friska kycklingar/höns (3 per gård). Totalt analyserades 764 E. coli-isolat för resistens mot 15 antibiotikasubstanser från 11 antibiotikaklasser. Data om multiresistens genererades också. En enkätbaserad studie genomfördes vid samma gårdsbesök (datasetet, och relaterad artikel, redan publicerade - se relaterad resurs). I den tidigare publicerade studien undersöktes kycklinguppfödarnas praktik och kunskap relaterad till antibiotikaresistens, samt allmänna gårdskaraktäristika. Kunskap och praktik utvärderades med en statistisk metod som heter item response theory (IRT), läs mer om denna metod i tidigare publikation (relaterad resurs). Vissa av variablerna från det tidigare publicerade datasetet är inkluderade även i detta dataset då den aktuella studiens syfte innefattade att leta efter associationer mellan bönders kunskap och praktik, samt gårdskaraktäristika, och förekomst av antibiotikaresistens. Datasetet består av 765 rader och 37 kolumner. Variabelnamn och svar är kodade och beskrivning av dessa finns i en separat fil, "Chicken_farm_AMR_Vietnam_2025_explanations". Vissa av de återanvända variablerna har döpts om under databearbetningensprocessen i denna studie. För enklare jämförelse av dataseten så är både de gamla och nya variabelnamnen inkluderade i beskrivningsfilen. Enkäten som användes vid gårdsbesöken kan hittas i databeskrivningen som är publicerad sedan tidigare (se relaterade resurser). 2021-11-25 2022-01-20 2021-11-25 2022-01-20 2023-01-24 2023-11-02 Viet Nam Vietnam HouseholdHousehold HushållHushåll IndividualIndividual IndividIndivid Small- and medium-scale poultry farmers i Thai Nguyen province, Vietnam, and chickens at their farms. Små- och medelskaliga kycklingproducenter, i Thai Nguyen-provinsen, Vietnam, samt kycklingar hos dessa producenter. Numeric Text Cross-sectionCross-section TvärsnittTvärsnitt A sample size of 300 farms in total was considered sufficient for the purpose of the study, and was distributed evenly between the two farm-size categories. To select farms to be included, lists of all small- and medium-scale chicken-raising households, were collected from the sub-Department of Animal Health (sub-DAH) in each district. To avoid an over- or under-representation of a district, the numbers of farms to be included were stratified according to the proportion of farms in each farm size category in each district. Two sampling frames, one for each farm-size category, were created from the obtained lists of chicken-raising households for each district. For logistic reasons, villages with less than five households were removed from the sampling frames. According to the stratification, households were then randomly selected via an online randomization tool (randomizer.org). If one household needed to be replaced for any reason, a nearby farm that met the requirements was included instead. Three chickens/hens from each farm were randomly selected for sampling (cloacal swabs) for the purpose of bacterial culturing (E. coli) and antibiotic susceptibility testing. If several age categories of birds were present at a farm, birds from the oldest age category were sampled.A sample size of 300 farms in total was considered sufficient for the purpose of the study, and was distributed evenly between the two farm-size categories. To select farms to be included, lists of all small- and medium-scale chicken-raising households, were collected from the sub-Department of Animal Health (sub-DAH) in each district. To avoid an over- or under-representation of a district, the numbers of farms to be included were stratified according to the proportion of farms in each farm size category in each district. Two sampling frames, one for each farm-size category, were created from the obtained lists of chicken-raising households for each district. For logistic reasons, villages with less than five households were removed from the sampling frames. According to the stratification, households were then randomly selected via an online randomization tool (randomizer.org). If one household needed to be replaced for any reason, a nearby farm that met the requirements was included instead. Three chickens/hens from each farm were randomly selected for sampling (cloacal swabs) for the purpose of bacterial culturing (E. coli) and antibiotic susceptibility testing. If several age categories of birds were present at a farm, birds from the oldest age category were sampled. Ett urval på 300 gårdar totalt ansågs tillräckligt för studiens syfte, och distribuerades jämnt mellan två kategorier av gårdsstorlekar (småskaliga och medelskaliga, med 20-49 respektive 100-499 kycklingar). Listor på hushåll som höll kycklingar i ovanstående omfattning samlades in från de lokala myndigheterna i Thai Nguyen-provinsen (sub-Department of Animal Health (sub-DAH)). För att undvika en över- eller underrepresentation av ett distrikt, stratifierades urvalet baserat på proportionen av gårdar inom varje storlekskategori per distrikt. Två urvalsramar per distrikt, en för varje storlekskategori, skapades från de erhållna listorna. Av logistiska skäl togs byar med färre än fem hushåll totalt bort från urvalsramarna. Det stratifierade urvalet gjordes sedan med ett web-baserat randomiseringsverktyg (randomizer.org). Om ett hushåll av någon anledning behövde ersättas, valdes en gård så nära ursprungsgården som möjligt som uppfyllde kriterierna. På varje gård valdes 3 kycklingar slumpmässigt ut för provtagning (kloaksvabb). Om flera ålderskategorier av kycklingar/höns fanns på gården så provtogs kycklingar/höns från den äldsta ålderskategorin.Ett urval på 300 gårdar totalt ansågs tillräckligt för studiens syfte, och distribuerades jämnt mellan två kategorier av gårdsstorlekar (småskaliga och medelskaliga, med 20-49 respektive 100-499 kycklingar). Listor på hushåll som höll kycklingar i ovanstående omfattning samlades in från de lokala myndigheterna i Thai Nguyen-provinsen (sub-Department of Animal Health (sub-DAH)). För att undvika en över- eller underrepresentation av ett distrikt, stratifierades urvalet baserat på proportionen av gårdar inom varje storlekskategori per distrikt. Två urvalsramar per distrikt, en för varje storlekskategori, skapades från de erhållna listorna. Av logistiska skäl togs byar med färre än fem hushåll totalt bort från urvalsramarna. Det stratifierade urvalet gjordes sedan med ett web-baserat randomiseringsverktyg (randomizer.org). Om ett hushåll av någon anledning behövde ersättas, valdes en gård så nära ursprungsgården som möjligt som uppfyllde kriterierna. På varje gård valdes 3 kycklingar slumpmässigt ut för provtagning (kloaksvabb). Om flera ålderskategorier av kycklingar/höns fanns på gården så provtogs kycklingar/höns från den äldsta ålderskategorin. Mixed probability and non-probabilityMixed probability and non-probability Blandat sannolikhets- och icke-sannolikhetsurvalBlandat sannolikhets- och icke-sannolikhetsurval Face-to-face interviews using a structured questionnaire.Face-to-face interviews using a structured questionnaire. Datainsamlingen skedde ansikte mot ansikte via ett strukturerat frågeformulär.Datainsamlingen skedde ansikte mot ansikte via ett strukturerat frågeformulär. Face-to-face interviewFace-to-face interview Personlig intervjuPersonlig intervju Cloacal swabs from 3 chickens/hens at each farmCloacal swabs from 3 chickens/hens at each farm Kloaksvabbar från 3 kycklingar/höns på varje gårdKloaksvabbar från 3 kycklingar/höns på varje gård Physical measurements and testsPhysical measurements and tests Fysiska mätningar och testerFysiska mätningar och tester Antibiotic susceptibility testing via broth microdilutionAntibiotic susceptibility testing via broth microdilution Antibiotikaresistenstestning via mikrodilutionAntibiotikaresistenstestning via mikrodilution Physical measurements and testsPhysical measurements and tests Fysiska mätningar och testerFysiska mätningar och tester Access to data through SND. Access to data is restricted. Åtkomst till data via SND. Tillgång till data är begränsad. restrictedAccess