Kod och data för "Stable clonal contribution of lineage-restricted stem cells to human hematopoiesis" Codes and data for "Stable clonal contribution of lineage-restricted stem cells to human hematopoiesis" 2025-273-1 https://doi.org/10.48723/vany-1s63 Swedish National Data Service Svensk nationell datatjänst Landing page Kod och data för "Stable clonal contribution of lineage-restricted stem cells to human hematopoiesis" Codes and data for "Stable clonal contribution of lineage-restricted stem cells to human hematopoiesis" 2025-273-1 https://doi.org/10.48723/vany-1s63 10.1038/s41588-025-02405-w Yoshizato, Tetsuichi Yoshizato, Tetsuichi Jacobsen, Sten Eirik Jacobsen, Sten Eirik KAW 2016.0105, 2015.0195 KAW 2016.0105, 2015.0195 4-1122/2014 4-1122/2014 613/06 613/06 538-2013-8995, 2015-03561 538-2013-8995, 2015-03561 MC_UU_12009/5 22 2178 Pj 22 2178 Pj 224132, 244282 224132, 244282 2021-00087 2021-00087 Swedish National Data Service Svensk nationell datatjänst Landing page Hematopoietic Stem Cells Blodstamceller Sequence Analysis, DNA DNA-sekvensanalys Klonal hematopoes av obestämd potential (CHIP) Klonal hematopoes av obestämd potential (CHIP) (Fördjupningskod) This dataset consists of code for reproducing the figures and statistical analyses from "Stable clonal contribution of lineage-restricted stem cells to human hematopoiesis" and its input data. The code (scripts.zip) is openly available. The files in the "data" folder contain personal data and can only be accessed after completing an assessment process. There are 12 R script files in scripts.zip, and the input data for these scripts are contained within the "data" folder. The input data are stored in text, Newick, or RDS format. The "data" contains 65 files of approximately 247MB total. The file size and path of each file in "data" can be found in the Data_file_list.txt file. For details on each file and instructions on running the code, please refer to README.pdf. Denna datauppsättning består av kod för att reproducera siffrorna och statistiska analyserna från "Stable clonal contribution of lineage-restricted stem cells to human hematopoiesis" och dess indata. Koden (scripts.zip) är öppet tillgänglig. Filerna i mappen "data" innehåller personuppgifter och kan endast nås efter att en bedömningsprocess har slutförts. Det finns 12 R-skriptfiler i scripts.zip, och indata för dessa skript finns i mappen "data". Indata lagras i text-, Newick- eller RDS-format. "Data" innehåller 65 filer på totalt cirka 247 MB. Filstorleken och sökvägen för varje fil i "data" finns i filen Data_file_list.txt. För information om varje fil och instruktioner om hur du kör koden, se README.pdf. Sweden Sverige Healthy individuals with rigorous inclusion criteria ensuring the absence of current or previous blood disorders or cancer and without ongoing treatment with immunosuppressive or other drugs likely to affect hematopoiesis. Friska individer med rigorösa inklusionskriterier som säkerställer frånvaron av nuvarande eller tidigare blodsjukdomar eller cancer och utan pågående behandling med immunsuppressiva eller andra läkemedel som sannolikt påverkar hematopoesen. Other LongitudinalLongitudinal LongitudinellLongitudinell Using bone marrow aspiration samples collected from donors, we performed error-corrected targeted DNA capture sequencing (ECTS), whole-exome sequencing, or single colony whole-genome sequencing to obtain mutation lists.Using bone marrow aspiration samples collected from donors, we performed error-corrected targeted DNA capture sequencing (ECTS), whole-exome sequencing, or single colony whole-genome sequencing to obtain mutation lists. Med hjälp av benmärgsaspirationsprover insamlade från donatorer utförde vi felkorrigerad riktad DNA-infångningssekvensering (ECTS), hel-exomsekvensering eller helgenomsekvensering av en enda koloni för att erhålla mutationslistor.Med hjälp av benmärgsaspirationsprover insamlade från donatorer utförde vi felkorrigerad riktad DNA-infångningssekvensering (ECTS), hel-exomsekvensering eller helgenomsekvensering av en enda koloni för att erhålla mutationslistor. Non-probabilityNon-probability Icke-sannolikhetsurvalIcke-sannolikhetsurval Access to data through SND. Access to data is restricted. Åtkomst till data via SND. Tillgång till data är begränsad. restrictedAccess Yoshizato, T., Nilsson, C., Grasso, F. et al. Stable clonal contribution of lineage-restricted stem cells to human hematopoiesis. Nat Genet (2025). https://doi.org/10.1038/s41588-025-02405-w Yoshizato, T., Nilsson, C., Grasso, F. et al. Stable clonal contribution of lineage-restricted stem cells to human hematopoiesis. Nat Genet (2025). https://doi.org/10.1038/s41588-025-02405-w 10.1038/s41588-025-02405-w 2025