Data för: Deciduous forest restoration alters but does not restore functional and phylogenetic diversity of saproxylic beetles Data for: Deciduous forest restoration alters but does not restore functional and phylogenetic diversity of saproxylic beetles 2026-265-1 https://doi.org/10.5878/f467-k877 Swedish National Data Service Svensk nationell datatjänst Landing page Data för: Deciduous forest restoration alters but does not restore functional and phylogenetic diversity of saproxylic beetles Data for: Deciduous forest restoration alters but does not restore functional and phylogenetic diversity of saproxylic beetles 2026-265-1 https://doi.org/10.5878/f467-k877 Larsson Ekström, Albin Larsson Ekström, Albin Löfroth, Therese Löfroth, Therese Hjältén, Joakim Hjältén, Joakim Swedish National Data Service Svensk nationell datatjänst Landing page ecosystem restoration deciduous forest boreal forest deadwood volume The dataset contains processed data on saproxylic beetle communities sampled in 2021 from 23 forest stands in Värmland and Dalsland, Sweden. The stands represent three categories: non-restored mixed deciduous–coniferous stands, stands restored through spruce removal and deciduous deadwood creation, and deciduous target stands rich in deadwood. Beetles were collected using 67 unbaited flight-interception traps, generally three traps per stand, from early June to mid-October 2021. Specimens were identified to species level, and species were classified as saproxylic based on literature and expert assessment. The data are provided in one Excel workbook containing seven related worksheets. species_abundance_matrix contains the abundance of 316 beetle species in each trap. functional_traits contains species-level information on adult body length, feeding guild, tree-species association and association with different stages of deadwood decay. taxonomy_hierarchy contains the taxonomic hierarchy from order to species used as a proxy for phylogeny. sample_environmental_data contains trap and stand identifiers together with stand-level deadwood volume, deadwood Shannon diversity, living-tree basal area and living-tree Shannon diversity. diversity_metrics contains trap-level taxonomic, functional and phylogenetic diversity indices. community_weighted_means contains abundance-weighted community means for the functional traits. functional_pcoa_axes contains species coordinates on the five principal coordinate axes used to represent functional trait space. The environmental variables were derived from inventories of dead and living trees. Deadwood volume was calculated per hectare from measurements of deadwood diameter and length or height. Deadwood diversity was calculated using Shannon diversity based on combinations of tree species, deadwood type, decay stage and diameter class. Living-tree diversity was similarly calculated from combinations of tree species and diameter class. Functional diversity was calculated from a Gower distance matrix of species traits followed by principal coordinate analysis with Cailliez correction. The first five axes were used to calculate functional richness, evenness and divergence. Phylogenetic diversity was calculated from a taxonomic tree with equal branch lengths. Community-weighted means represent abundance-weighted trait values; for categorical traits, they represent the relative abundance associated with each trait category. The workbook can be opened using standard spreadsheet software and does not require specialised software for reading or basic reuse. The processing and original analyses were conducted in R 4.3.2 using, among others, the packages FD, picante, vegan, phylospatial, lmerTest, emmeans and iNEXT.3D. R and the relevant packages are required to reproduce the derived diversity metrics and statistical analyses from the species, trait, taxonomy and environmental data. See README for references. Datasetet innehåller bearbetade data om 316 vedlevande skalbaggar insamlade under 2021 i 23 skogsbestånd i Värmland och Dalsland. Bestånden representerar tre kategorier: icke-restaurerade blandskogar, bestånd som restaurerats genom avverkning av gran och skapande av lövträdsved samt lövträdsdominerade målbestånd med riklig förekomst av död ved. Skalbaggar samlades in med 67 obetade fönsterfällor, i regel tre fällor per bestånd, från början av juni till mitten av oktober 2021. Individerna identifierades till art och arterna klassificerades som vedlevande utifrån litteratur och expertbedömningar. Data tillhandahålls i sju csv filer. species_abundance_matrix innehåller antalet individer av 316 skalbaggsarter i varje fälla. functional_traits innehåller artdata för kroppslängd, födogrupp, trädslagsassociation och association med olika successions- eller nedbrytningsstadier av död ved. taxonomy_hierarchy innehåller den taxonomiska hierarkin från ordning till art som användes som en approximation av fylogeni. sample_environmental_data innehåller identiteter för fällor och bestånd samt beståndsvisa variabler för volym och Shannondiversitet av död ved och grundyta och Shannondiversitet av levande träd. diversity_metrics innehåller taxonomiska, funktionella och fylogenetiska diversitetsmått beräknade för varje fälla. community_weighted_means innehåller abundansviktade medelvärden för de funktionella egenskaperna. functional_pcoa_axes innehåller arternas koordinater längs de fem huvudkoordinataxlar som användes för att beskriva det funktionella egenskapsrummet. Miljövariablerna beräknades från inventeringar av döda och levande träd. Volymen död ved beräknades per hektar utifrån mätningar av diameter och längd eller höjd. Diversiteten av död ved beräknades med Shannondiversitet baserat på kombinationer av trädslag, typ av död ved, nedbrytningsstadium och diameterklass. Diversiteten av levande träd beräknades på motsvarande sätt utifrån kombinationer av trädslag och diameterklass. Funktionell diversitet beräknades från en Gower-avståndsmatris baserad på arternas funktionella egenskaper, följt av en huvudkoordinatanalys med Cailliez-korrigering. De fem första axlarna användes för att beräkna funktionell rikedom, jämnhet och divergens. Fylogenetisk diversitet beräknades från ett taxonomiskt träd där alla grenar tilldelades samma längd. Abundansviktade medelvärden beskriver det genomsnittliga egenskapsvärdet i varje skalbaggssamhälle; för kategoriska egenskaper motsvarar värdet den relativa abundansen inom respektive egenskapskategori. Arbetsboken kan öppnas med vanliga kalkylprogram och kräver ingen särskild programvara för att läsas eller återanvändas. Databearbetningen och de ursprungliga analyserna genomfördes i R 4.3.2, bland annat med paketen FD, picante, vegan, phylospatial, lmerTest, emmeans och iNEXT.3D. R och de relevanta paketen behövs för att återskapa de härledda diversitetsmåtten och de statistiska analyserna från art-, egenskaps-, taxonomi- och miljödata. See README för referenser. 2021-06 2021-10 Sweden Sverige Numeric Text Beetles collected with IBL2 traps, environmental variables in sampling plots, see: Larsson Ekström A, Hjältén J, Löfroth T (2024) A decadal study reveals that restoration guided by an umbrella species does not reach target levels. Journal of Applied Ecology 61:513–525. https://doi.org/10.1111/1365-2664.14586Beetles collected with IBL2 traps, environmental variables in sampling plots, see: Larsson Ekström A, Hjältén J, Löfroth T (2024) A decadal study reveals that restoration guided by an umbrella species does not reach target levels. Journal of Applied Ecology 61:513–525. https://doi.org/10.1111/1365-2664.14586 Skalbaggar insamlade med IBL2 fällor, miljödata insamlat i provytor, se: Larsson Ekström A, Hjältén J, Löfroth T (2024) A decadal study reveals that restoration guided by an umbrella species does not reach target levels. Journal of Applied Ecology 61:513–525. https://doi.org/10.1111/1365-2664.14586Skalbaggar insamlade med IBL2 fällor, miljödata insamlat i provytor, se: Larsson Ekström A, Hjältén J, Löfroth T (2024) A decadal study reveals that restoration guided by an umbrella species does not reach target levels. Journal of Applied Ecology 61:513–525. https://doi.org/10.1111/1365-2664.14586 Measurements and testsMeasurements and tests Mätningar och testerMätningar och tester Access to data through SND. Data are freely accessible. Åtkomst till data via SND. Data är fritt tillgängliga. openAccess