Bröstcancer- en metastasstudie Breast Cancer-metastases study ext0122-1-1 Swedish National Data Service Svensk nationell datatjänst http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0026560 http://www.pnas.org/content/108/34/14252.full.pdf+html Bröstcancer- en metastasstudie Breast Cancer-metastases study ext0122-1-1 Olsson, Håkan Olsson, Håkan Swedish National Data Service Svensk nationell datatjänst Scania Metadatabase for Epidemiology (SME) The aim of the Scania Metadatabase for Epidemiology (SME) was to invent and create a catalogue that describes epidemiological studies collected within Lund University and Region Skåne. The project was initiated by Kristina Jakobsson (Division of Occupational and Environmental Medicine, Region Skåne, Lund), Jonas Björk (assistant coordinator of the national, interdisciplinary research project SIMSAM Lund) and Peter Nilsson (coordinator of SFO EpiHealth). The study inventory have been conducted by the R&D-centre in Scania and BBMRI.se in close cooperation with the Swedish National Data Service (SND). SME was initiated in the autumn of 2012 and it currently comprises information about 50 studies, including a total of just over 680,000 study participants as well as biological samples from more than 217 000 individuals. Skånes metadatabas för epidemiologi (SME) initierades under hösten 2012 med syftet att skapa en katalog med översiktliga beskrivningar av en del av de epidemiologiska studier som genomförts i Lunds universitets eller Region Skånes regi genom åren. Projektet initierades av Kristina Jakobsson (avdelningen för arbets- och miljömedicin vid institutionen för laboratoriemedicin, Region Skåne, Lund), Jonas Björk (biträdande koordinator för det nationella, tvärvetenskapliga forskningsprojektet SIMSAM Lund) samt Peter Nilsson (koordinator för SFO EpiHealth). Studieinventeringen har genomförs av FoU-centrum Skåne och BBMRI i nära samarbete med Svensk Nationell Datatjänst (SND). SME omfattar i dagsläget omkring 50 studier med sammanlagt fler än ca 680 000 studiedeltagare, samt biologiska prover från drygt 217 000 individer. Studierna som finns representerade är allt från regionala hälsoundersökningar och folkhälsoenkäter till kohortstudier av specifika yrkesgrupper. Förhoppningen är att SME ska kunna fungera som en kontaktyta mellan forskare med gemensamma beröringspunkter, exempelvis intresse för samma exponeringar, sjukdomsutfall, biologiska markörer, åldersgrupper eller socioekonomiska faktorer – det handlar således om att skapa möjligheter att nyttja redan insamlade data, också på ett tids- och resurseffektivt sätt. Alla studier som ingår i samlingen har det unika nyckelordet epiHealth_Skåne och kan sökas fram genom att ange sökordet i SNDs sökssytem. http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0026560 http://www.pnas.org/content/108/34/14252.full.pdf+html CANCER CANCER Blood Specimen Collection Blodprovstagning Neoplasms Tumörer Biomarkers Biomarkörer Breast Neoplasms Brösttumörer DNA DNA Serum Serum Biomarkers, Tumor Tumörmarkörer Plasma Plasma Paraffin Embedding Paraffininbäddning Tissue Embedding Vävnadsinbäddning HEALTH HÄLSA The participants in this cohort are individuals with breast cancer and metastatic disease coming to the Department of Oncology in Lund for treatment since 2003. The data collection in the study is still ongoing. From all individuals, there is information about the status of the primary tumor, metastatic sites, tumor volume, and treatments. There are also paraffin-embedded tissue from primary tumor saved from all individuals, and for a subset of the cohort also frozen primary tumor tissue saved. There is DNA, plasma and serum saved from all individuals. Purpose: To find tumor markers or tumor cells in the blood from patients with metastatic breast cancer. Data collection was started in 2003 and is ongoing (in 2010 there were over 300 individuals included in the study). Deltagarna i denna kohort är individer som har drabbats av metastaserande bröstcancer och som sedan 2003 har kommit till onkologen i Lund för behandling. Insamlingen till studien pågår fortfarande. Från alla individer finns det information om status för den primära tumören, metastaslokal, tumörvolym, samt vilken/vilka behandlingar de har genomgått. Det finns även paraffininbäddad primärtumör sparad från alla individer, och för en subgrupp av kohorten har fryst primärtumörvävnad sparats. DNA, plasma och serum finns sparat från samtliga individer. Syfte: Att hitta tumörmarkörer eller tumörceller i blod från patienter med metastaserande bröstcancer. Insamling i studien startade 2003 och är pågående (antal individer uppgick till drygt 300 år 2010). 2003 IndividualIndividual IndividIndivid Individuals with metastatic breast cancer, treated at the oncologist in Lund. Individer med metastaserande bröstcancer som kommit till onkologen i Lund för behandling. Numeric Cross-sectionCross-section TvärsnittTvärsnitt ProbabilityProbability SannolikhetsurvalSannolikhetsurval Physical measurements and testsPhysical measurements and tests Fysiska mätningar och testerFysiska mätningar och tester Access to data through an external actor. Access to data is restricted. Åtkomst till data via extern aktör. Tillgång till data är begränsad. restrictedAccess Carlsson MC, Cederfur C, Schaar V, Balog CI, Lepur A, Touret F, Salomonsson E, Deelder AM, Fernö M, Olsson H, Wuhrer M, Leffler H. Galectin-1-binding glycoforms of haptoglobin with altered intracellular trafficking, and increase in metastatic breast cancer patients. PLoS One. 2011;6(10):e26560. doi: 10.1371/journal.pone.0026560. Epub 2011 Oct 18. Carlsson MC, Cederfur C, Schaar V, Balog CI, Lepur A, Touret F, Salomonsson E, Deelder AM, Fernö M, Olsson H, Wuhrer M, Leffler H. Galectin-1-binding glycoforms of haptoglobin with altered intracellular trafficking, and increase in metastatic breast cancer patients. PLoS One. 2011;6(10):e26560. doi: 10.1371/journal.pone.0026560. Epub 2011 Oct 18. 2011 Carlsson A, Wingren C, Kristensson M, Rose C, Fernö M, Olsson H, Jernström H, Ek S, Gustavsson E, Ingvar C, Ohlsson M, Peterson C, Borrebaecka C A.K. Molecular serum portraits in patients with primary breast cancer predict the development of distant metastases. Proc Natl Acad Sci U S A. Aug 23, 2011; 108(34): 14252-14257. doi: 10.1073/pnas.1103125108. Published online Aug 15, 2011. Carlsson A, Wingren C, Kristensson M, Rose C, Fernö M, Olsson H, Jernström H, Ek S, Gustavsson E, Ingvar C, Ohlsson M, Peterson C, Borrebaecka C A.K. Molecular serum portraits in patients with primary breast cancer predict the development of distant metastases. Proc Natl Acad Sci U S A. Aug 23, 2011; 108(34): 14252-14257. doi: 10.1073/pnas.1103125108. Published online Aug 15, 2011. 2011 Carlsson A, Wingren C, Ingvarsson J, Ellmark P, Baldertorp B, Fernö M, Olsson H, Borrebaeck CA. Serum proteome profiling of metastatic breast cancer using recombinant antibody microarrays. Eur J Cancer. 2008 Feb;44(3):472-80. doi: 10.1016/j.ejca.2007.11.025. Epub 2008 Jan 2. Carlsson A, Wingren C, Ingvarsson J, Ellmark P, Baldertorp B, Fernö M, Olsson H, Borrebaeck CA. Serum proteome profiling of metastatic breast cancer using recombinant antibody microarrays. Eur J Cancer. 2008 Feb;44(3):472-80. doi: 10.1016/j.ejca.2007.11.025. Epub 2008 Jan 2. 2008 Carlsson MC, Balog CI, Kilsgård O, Hellmark T, Bakoush O, Segelmark M, Fernö M, Olsson H, Malmström J, Wuhrer M, Leffler H. Different fractions of human serum glycoproteins bind galectin-1 or galectin-8, and their ratio may provide a refined biomarker for pathophysiological conditions in cancer and inflammatory disease. Biochim Biophys Acta. 2012 Sep;1820(9):1366-72. doi: 10.1016/j.bbagen.2012.01.007. Epub 2012 Jan 17. Carlsson MC, Balog CI, Kilsgård O, Hellmark T, Bakoush O, Segelmark M, Fernö M, Olsson H, Malmström J, Wuhrer M, Leffler H. Different fractions of human serum glycoproteins bind galectin-1 or galectin-8, and their ratio may provide a refined biomarker for pathophysiological conditions in cancer and inflammatory disease. Biochim Biophys Acta. 2012 Sep;1820(9):1366-72. doi: 10.1016/j.bbagen.2012.01.007. Epub 2012 Jan 17. 2012