Researchdata.se

Data för: Konsekvenser av marktäckeklassificering för övervakning av kol i marken – jämförelse mellan LUCAS och svenska markinventeringar

Rong Lang — Fri, 12 Jun 2026 09:28:46 GMT

Datasetet innehåller två datafiler (LUCAS_BlockParcel_compiled_F.tsv och InventoriesSE_F.tsv) som ligger till grund för manuskriptet som jämför Land Use/Land Cover Area Frame Survey (LUCAS) och den svenska nationella markinventeringen på jordbruksmark. Båda datafilerna är kompilerade filer: LUCAS_BlockParcel_compiled_F.tsv bygger på LUCAS och det svenska systemet för identifiering av fastighetsenheter (LPIS), medan InventoriesSE_F.tsv bygger på den svenska Mark- och grödoinventeringen på åkermark (SLU miljöanalys; program jordbrukslandskap) samt den svenska skogsinventeringen (SLU miljöanalys; program skog), som omfattar halvnaturliga gräsmarker. LUCAS_BlockParcel_compiled_F.tsv: 93 kolumner, 188 rader Rådata från LUCAS för marktäcke och 0–20 cm matjord för åren 2009, 2015 och 2018 erhölls från European Soil Data Centre. Vi filtrerade datasetet för att endast inkludera provtagningspunkter klassificerade som åkermark eller gräsmark i kolumnen Land Cover, vilket resulterade i 187 återbesökta provtagningsplatser i Sverige. Jordbruksblock och skiften hämtades från Block- och skiftesdatabasen som laddades ner från Jordbruksverket (https://jordbruksverket.se/e-tjanster-databaser-och-appar/e-tjanster-och-databaser-stod/kartor-och-gis, hämtad i juli 2025). Vi skapade ett LUCAS jordprovtagningspunktslager med hjälp av GPS-koordinater och projicerade det till SWEREF99 TM för att göra en spatial sammanfogning med block- och skiftesdatabasen. Den geospatiala blockdatabasen (jordbruksblock) avgränsar lantbrukarnas jordbruksblock baserat på marktyper (ägoslag), medan skiftesdatabasen (jordbruksskifte eller skifte) vidare delar upp blocken i skiften som innehåller attribut för grödtyp, odlingsområde och typ av stöd, etc. (Widén-Nilsson et al., 2025). Eftersom rutinen för att uppdatera blockdatabasen och det år den representerar ändrades 2009, bör blocket från efterföljande år användas för att matcha gröddata för 2009 och framåt, och eventuella omatchade dataposter bör därefter matchas med blockdatasetet från samma år (Widén-Nilsson et al., 2025). Därför sammanfogade vi spatialt LUCAS provtagningspunkter från 2009, 2015 och 2018 med blockdatabasen för att bestämma ägoslag. Före 2012 hade skiftesdatabasen mycket begränsad spatial täckning av jordbruksmark. Information om grödor för skiften som lantbrukarna ansökte om stöd för var dock tillgänglig som textfiler. Dessa filer kunde matchas med blockdatabasen med hjälp av block-ID för att identifiera vilka grödor som odlades inom varje block. Data för grödor lades till enligt följande: för 2009 extraherade vi alla skiften som var associerade med varje provtagningsplats i LUCAS med hjälp av block-ID och beräknade grödornas sammansättning för varje block baserat på odlad areal; för 2015 och 2018 lades en attribut för grödtyp till direkt via en spatial sammanfogning med skiftesdatabasen. De geodetiska avstånden för samma punkt mellan omdreven beräknades. Spatial databehandling utfördes i ArcGIS Pro med paketet arcpy. Förändringar i matjordens kolkoncentrationer mellan provtagningsåren 2009, 2015 och 2018 beräknades. InventoriesSE_F.tsv: 25 kolumner, 1734 rader Den svenska Mark- och grödoinventeringen på åkermark började att registrera exakta geografiska koordinater i det andra omdrevet (2001-2007), och ett decennium senare (2011-2017) togs prover på samma platser för 0-20 cm matjord, vilket resulterade i 1 821 återbesökta provtagningspunkter. Den svenska Markinventeringen (skogsmark) omfattar naturbetesmarker, som analyserar jordprover för 0-10 cm djup; 63 återbesökta provtagningspunkter är tillgängliga under de två liknande inventeringsperioderna (2003-2009 och 2013-2019). För att möjliggöra en direkt jämförelse av förändringar i kolkoncentrationer i enbart mineraljordar uteslöt vi också från båda inventeringarna provtagningspunkterna på organogena jordar eller de med hög karbonathalt (kolhalt > 16 %, CaCO3 > 5 %), samt de som saknade data för textur. Kolhalten rapporterades i viktprocent av jordmassan, och förändringar i kolkoncentrationer uttrycktes som den absoluta skillnaden i procentenheter genom hela studien. Data har genererats som en del av SLU:s miljöövervakning och bedömning från Mark- och grödoinventeringen (Jordbrukslandskap) och svenska Markinventeringen (skogsmark) (Skogslandskap).

Solvated Molecular Dynamics Simulations for publication: Chemical Mechanism of Allosteric and Asymmetric Dark Reversion in a Bacterial Phytochrome Uncovered by Cryo-EM.

Anna-Lena Fischer — Fri, 12 Jun 2026 00:00:00 GMT

This is a dataset of solvated molecular dynamics simulations of a full-length bacterial phytochrome of Pseudomonas aeruginosa (PaBphP) investigating the dark reversion mechanism (see publication for further information: https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.5c17531). Phytochromes are red light photoswitches in plants, bacteria and fungi controlling diverse biological processes. They exits mainly in two states: the red light absorbing Pr state (both monomers in Pr), and the far-red light absorbing Pfr state (both monomers in Pfr). While left in the dark, they revert to the thermodynamically more stable state, in the case of PaBphP the Pfr state. In this study we investigated this dark reversion reaction and encountered a newly identified hybrid state PrPfr (one monomer Pr and the other Pfr), identifiable by an internal asymmetry in the system. This allows us to further elucidate the dark reversion mechanism to provide a structural framework for tuning phytochrome signaling lifetimes. Dry versions of the simulations are available on Zenodo (10.5281/zenodo.15796800). There are each three replicas in the PrPr state as well as in the PrPfr hybrid state. As force-field ff14SB (force field 14 with Side-chain and Backbone modifications)(Maier et al. JCTC, 2015) was used with the TIP3P (Transferable Intermolecular Potential 3P)(Joergensen et al. JCP, 1983) water model (10 Å minimum wall distance), utilizing the AMBER24 (Assisted model building with energy refinement) tool kit, i.e., the tleap implementation. (Case et al., JCIM, 2023) Charges were neutralized with a uniform background charge and the systems were equilibrated with a multistep protocol. Both systems were simulated for approximately 250 ns three times in an NpT ensemble (constant particle number N, pressure p and temperature T)(using pmemd.cuda)(Salomon-Ferrer et al. JCTC, 2013), using a time step of 2 fs, since the SHAKE algorithm was applied. (Miyamoto et al. JCC, 1992) The particle-mesh Ewald (PME) method took care of electrostatic interactions. The Langevin thermostat kept the temperature at 300 K and the Monte Carlo barostat kept pressure at 1 bar.

Observationer av ett eldklot i norra Sverige, 18:55UT, 27 februari, 2023

Johan Kero — Thu, 11 Jun 2026 13:47:35 GMT

* FITS-filer erhållna med ALIS_4D samt PNG-filer genererade från bildrutorna (50–150) i varje FITS-fil. Datat är uppdelat efter observationsstation och motsvarar de optiska detektioner som användes i analysen som presenteras i den tillhörande publikationen. * Optiska parametrar som användes i bildanalysen samt en sammanfattande figur över fel i stjärnkalibreringen. * Vinddata extraherade från modellen Global Forecast System (GFS) och lagrade i CSV-format. Filen innehåller vindkomponenter och/eller vindhastighet och vindriktning för ett valt geografiskt område och en vald tidsperiod. Vinddata erhölls från offentligt tillgängliga GFS-produkter tillhandahållna av National Centers for Environmental Prediction (NCEP/NOAA). * Bilddata från en svensk meteorkamera placerad i Abisko, Sverige. * Bilddata från en finsk meteorobservatör i Kittilä, Finland.

Politisk resocialisation av invandrare 1975-1976

Tomas Hammar — Thu, 11 Jun 2026 11:56:24 GMT

Forskningsprojektet Politisk resocialisation av invandrare (PRI) syftade till att analysera den politiska resocialiseringen av invandrare i Sverige, med särskilt fokus på politiskt intresse och deltagande. Projektets övergripande mål var att belysa invandrares relation till det svenska samhället och det politiska systemet, deras levnadsförhållanden, erfarenheter av migrationsprocessen samt de faktorer som kan stimulera ett ökat politiskt engagemang. Vidare undersöktes politiska attityder och beteenden, uppfattningar om politiska företrädare och krav, samt tillgången till information om det svenska administrativa och politiska systemet. Den första större datainsamlingen genomfördes under perioden våren 1975 till våren 1976 genom personliga intervjuer. Ur denna respondentgrupp gjordes ett nytt urval som intervjuades i direkt anslutning till riksdagsvalet 1976 – det första svenska valet där invandrare hade rösträtt. Den inledande intervjun omfattade ett brett spektrum av teman, däribland tidpunkt för ankomst till Sverige och till Stockholm, antal tidigare boplatser, språkkunskaper hos respondenten samt eventuella make/maka och barn, läsvanor (svenska och utländska tidningar), nyhetskonsumtion (svenska respektive utländska källor), agerande vid risk för arbetslöshet, socialt umgänge, föreningsmedlemskap och aktivitetsnivå, kännedom om offentliga institutioner och kontaktvägar i Stockholm, myndighetskontakter, uppfattningar om samhällsproblem, intresse för svensk politik, valdeltagande i ursprungsland och i Sverige, jämförelser mellan situationen i Sverige och i ursprungslandet inom olika områden, samt upplevd samhällsposition i relation till andra invandrare och till svenskar. Intervjun innehöll även frågor om respondentens och föräldrars utbildningsnivå, yrkesverksamhet, religiositet och föreningsaktivitet, samt självupplevd samhällsposition i både ursprungslandet och i Sverige. I anslutning till intervjun ombads respondenterna även att fylla i en enkät. Denna inkluderade ett trettiotal generella påståenden samt ett antal specifika påståenden om den egna invandrargruppen, vilka skulle besvaras med grad av instämmande. Enkäten innehöll dessutom ett antal faktabaserade frågor. Valintervjun, som genomfördes efter valet 1976, fokuserade på valrelaterade aktiviteter och upplevelser. Den innehöll frågor om vilka valprogram man följt i radio eller TV, deltagande i studiecirklar om valet, mottagna informationsbroschyrer, deltagande i politiska möten, kännedom om kandidater, röstningsbeteende, upplevt viktiga valfrågor, partiernas engagemang i invandrarrelaterade frågor, eventuell påverkan av andra väljares beslut, jämförelser mellan svenska och utländska partier, intresse för valutgången samt tidpunkt för beslut om att rösta eller att avstå från att rösta.

Kommunalpolitikerundersökningen 1979-80

Gunnar Wallin — Thu, 11 Jun 2026 11:44:11 GMT

Studien är en del av projektet för att utvärdera kommunsammanslagningsreformen. De viktigaste frågorna i undersökningen handlar om hur organisationen av de politiska företrädarna ser ut, dess storlek och arbetsvillkoren för lokala politiker. Studien diskuterar även de politiska partiernas roll i den parlamentariska arenan i kommunerna och vilka skäl som kan ligga till grund för politiskt förtroendevalda att lämna sina uppdrag. Studien är delvis en uppföljning av Kommunala förtroendemän 1968 (SND 0110).

Svenska valdata: Riksdagsvalet 1973

Thu, 11 Jun 2026 09:14:13 GMT

Valresultat för samtliga valdistrikt vid riksdagsvalet 1973. Innehåller uppgifter om det totala antalet röstberättigade, antal röstande, antal giltiga respektive ogiltiga valsedlar samt antalet poströster. Dessutom finns uppgifter om antalet röster för de större partierna. Datasetet är skapat av data hämtade från SCB, och bearbetade av Svensk samhällsvetenskaplig datatjänst (SSD) vid Göteborgs universitet.

Data för: Parascaris spp. orsakad kolik hos buköppnade unga hästar - ett skandinaviskt perspektiv

Ylva Hedberg Alm — Thu, 11 Jun 2026 06:16:49 GMT

Detta dataset innehåller retrospektivt insamlad data från journaler på unga hästar (< 2 år, > 1 månad) som buköppnats vid sex olika hästkliniker Sverige, Norge och Danmark. Datainsamlingsperioden varierar mellan 7-15 år beroende på klinik och datatillgänglighet. Data som insamlats omfattar datum för ankomst till kliniken, ålder, kön och ras, diagnos vid buköppning, förekomst av spolmask samt utgång. Vidare insamlades data avseende avmaskningshistorik när denna fanns tillgänglig.

Input files used for the tutorials of the calorine package

Lindgren, Eric — Thu, 11 Jun 2026 00:00:00 GMT

This record contains input files that are used in the notebooks and examples included in the documentation of the calorine package. These files have been compiled from several different sources as referenced in the tables below. NEP models File Source nep-PbTe.txt https://zenodo.org/records/10108287 nep-CsPbI3-SCAN.txt https://zenodo.org/records/8014365/files/nep-CsPbCl3-SCAN.txt nep-graphite-CX.txt https://zenodo.org/records/7811021/files/nep-C-CX.txt nep-dipole-PTAF.txt https://zenodo.org/records/10255268 Structures File Source CsPbI3-cubic-Pm-3m.xyz https://zenodo.org/records/8014365/files/CsPbBr3-SCAN-cubic-Pm-3m.xyz CsPbI3-delta-Pnma.xyz https://zenodo.org/records/8014365/files/CsPbCl3-SCAN-delta-Pnma.xyz CsPbI3-orthorhombic-Pnma.xyz https://zenodo.org/records/8014365/files/CsPbBr3-SCAN-orthorhombic-Pnma.xyz CsPbI3-tetragonal-I4mcm.xyz https://zenodo.org/records/8014365/files/CsPbCl3-SCAN-tetragonal-I4mcm.xyz CsPbI3-tetragonal-P4mbm.xyz https://zenodo.org/records/8014365/files/CsPbBr3-SCAN-tetragonal-P4mbm.xyz graphite-prim.xyz n/a PTAF-monomer.xyz n/a

Spectral biophysical cytometry with smart nanosensors for monitoring biophysical remodeling of immune cells in atherosclerosis

Erdinc Sezgin — Thu, 11 Jun 2026 00:00:00 GMT

It contains data sets from the publication, with the details for citation provided in the README file. Please cite this item as: Cenk O. Gurdap, Dunya Aydos, Luca A. Andronico, Gábor Tóth, Tugce Ceker, John Cowgill, Irem Muge Akbulut Koyuncu, Neslihan Basak, Jaromir Mikes, Andrey S. Klymchenko, Federico Pietrocola, Petter Brodin, Ingela Lanekoff, Verda Bitirim, Erdinc Sezgin DOI: 10.17044/scilifelab.30406327 It contains raw microscopy images, figures, Prism files, and excel sheets of the data. Abstract Biophysical properties of cells determine cellular physiology. Leveraging these properties for biomedical applications demands the ability to measure multiple parameters simultaneously across millions of cells and diverse cell types. However, current technologies are limited by throughput and low dimensionality. Here, we introduce spectral biophysical cytometry (SBC), a high-throughput platform that integrates environment-sensitive nanosensors with spectral flow cytometry to resolve multi-parametric biophysical properties of immune cells at single-cell resolution. By employing fluorescent nanosensors that report membrane order, mitochondrial potential, and membrane potential, SBC enables simultaneous quantification of key cellular physical states across diverse immune cell populations. When applied to peripheral blood mononuclear cells, SBC reveals cell-type–specific biophysical heterogeneity and identifies distinct remodeling signatures associated with atherosclerosis. In particular, T cell subsets exhibit significant alterations in membrane order and mitochondrial depolarization, reflecting coordinated changes in lipid composition and metabolic pathways. Integration with lipidomics and transcriptomics demonstrates that nanosensors enable detection of biophysical shifts that correlate with dysregulated lipid metabolism and mitochondrial function, providing mechanistic insight into immune dysfunction in disease. Importantly, SBC achieves rapid, label-efficient profiling using commercially available instrumentation, enabling scalable biomarker discovery directly from blood samples and establishing a powerful strategy for linking biophysical phenotypes to immune cell function. Data usage Researchers are welcome to use the data contained in the dataset for any projects. Please cite this item upon use or when published. We encourage reuse using the same CC BY 4.0 License. Data Content Excel files and Prism files for graphs fastq.gz files for omics Software to open files .xlsx or .cvs - Microsoft excel .pzfx or .prism – GraphPad Prism (https://www.graphpad.com/features) .fastq.gz – 10x Genomics Cloud

Double Emulsions Enable In Situ Generation of Permeation Enhancers for Oral Delivery of Peptides

Hannah Pohlit — Thu, 11 Jun 2026 00:00:00 GMT

Double Emulsions Enable In Situ Generation of Permeation Enhancers for Oral Delivery of Peptides Hannah Pohlit¹,², Lingxiao Li², Estela Isabel Bini³, Dario Colucci³, Cristhian Fernando Salas Cotaquispe¹, Maja Sikström¹, Per Larsson²,⁴, Christel A.S. Bergström²,⁴, Shakhawath Hossain²,⁴, David J. Brayden³, Alexandra Teleki¹,²* ¹Department of Pharmacy, Science for Life Laboratory, Uppsala University, Sweden ²The Swedish Drug Delivery Center, Department of Pharmacy, Uppsala University, Sweden ³School of Veterinary Sciences, University College Dublin, Ireland ⁴Department of Pharmacy, Uppsala Biomedical Center, Uppsala University, Sweden * Corresponding author (alexandra.teleki@scilifelab.uu.se) Abstract Oral delivery of peptide therapeutics remains limited by gastrointestinal degradation and poor epithelial permeability. Here, water-in-oil-in-water (W/O/W) double emulsions produced by microfluidics were designed to co-encapsulate octreotide and medium-chain triglycerides, enabling digestion-triggered generation of permeation-enhancing fatty acids. Production parameters were systematically optimized to obtain stable, monodisperse droplets with defined core-shell morphology. The emulsions comprised an inner aqueous phase containing the payload, encapsulated within a Miglyol 812N oil phase stabilized by polyglycerol polyricinoleate (PGPR), and dispersed in an external aqueous phase stabilized by Tween 80, yielding droplets of ~190 μm with a single inner aqueous core (~78 μm). Lipolysis studies confirmed minimal fatty acid release under gastric conditions and substantial release of caprylic (C8) and capric (C10) acids during intestinal digestion, accompanied by release of encapsulated cargo. In differentiated Caco-2 monolayers, digested emulsions increased apparent permeability (Pₐₚₚ) of fluorescein isothiocyanate-dextran (FD-4) and octreotide in a fatty acid concentration-dependent manner. Immunostaining showed occludin redistribution under permeation‑enhancing conditions. Ex vivo studies in rat colonic mucosa using Ussing chambers demonstrated a ~4-fold increase in FD-4 permeability for the digested emulsions, comparable to matched concentrations of free fatty acids, while octreotide permeability remained unchanged. Coarse-grained molecular dynamics simulations revealed strong association of octreotide with mixed bile salt–fatty acid micelles, limiting its freely dissolved fraction, whereas FD-4 remained predominantly solvated, consistent with the experimental findings. This study demonstrates that digestion of structured double emulsions enables in situ generation of permeation enhancers while simultaneously releasing hydrophilic cargo, providing a formulation strategy for oral delivery of peptide therapeutics. Keywords Lipid-based formulation, Lipolysis, Permeation enhancers, Apparent permeability, Molecular dynamics simulations, Intestinal permeability