Researchdata.se

Data för: Fibroblast-driven collagen expansion and altered thymic medullary niches in 22q11.2 deletion syndrome

Olov Ekwall — Thu, 16 Apr 2026 13:11:36 GMT

Syftet med studien var att identifiera skillnader avseende spatiala transkriptom och proteom mellan tymusvävnad från patienter med 22q11.2-deletionssyndrom och kontroller. Tymusvävnad från två patienter med 22q11DS och åtta kontroller analyserades med spatial transkriptomik och proteomik med hjälp av Visium- respektive Phenocycler-metodik. Datasetet innehåller data från manuskriptet ”Fibroblast-driven collagen expansion and altered thymic medullary niches in 22q11.2 deletion syndrome” av Hennings et al., som skickades in för publicering i februari 2026.

NorthPop – Barns hälsa i Västerbotten

Magnus Domellöf — Fri, 28 Nov 2025 09:44:31 GMT

NorthPop är en forskningsinfrastruktur vid Region Västerbotten och Umeå universitet. Den består av en databas och biobank som innehåller omfattande populationsbaserade, longitudinella data. Dessa samlas in från 30 000 individer, vilket inkluderar 10 000 barn och deras föräldrar, som i genomsnitt är 32 år gamla vid förlossningen. Region Västerbotten och Umeå universitet har en framgångsrik tradition av forskning baserad på databaser och biobanker, men tidigare har fokus nästan helt legat på medelålders och äldre individer eller specifika sjukdomar. Det finns ett stort behov av en befolkningsbaserad infrastruktur med en biobank för barn och unga vuxna, eftersom majoriteten av våra livsstilsrelaterade sjukdomar och beteenden etableras tidigt i livet. Barn och unga vuxna utgör 50% (130 000 individer) av befolkningen i Västerbotten. NorthPop kompletterar därför perfekt Västerbottens hälsoundersökningar (VHU), som täcker åldrarna 40 år och uppåt, och möjliggör helt nya fler-generations forskningsprojekt. Datainsamlingen består av: 1. Enkäter: Under graviditeten besvarar föräldrarna tre enkäter var. Enkäter skickas sedan ut när barnet är 4 månader, 9 månader, 18 månader, 2 år, 3 år och 7 år gammalt. 2. Provtagning: Biologiska prover samlas in från kvinnorna under graviditeten, i graviditetsveckorna 14-24, runt graviditetsvecka 28 och 1 månad efter förlossningen. Barnen provtas vid födseln, 48 timmar efter födseln, vid 1, 9, 18 månader samt vid 3 och 7 års ålder. Mekonium, avföring, munsvabb och bröstmjölk samlas antingen in av föräldrarna hemma eller på sjukhuset. - Urin: Ett urinprov på 10 ml samlas in från mödrarna vid det rutinmässiga ultraljudet, i graviditetsveckorna 14-24. - Blod: Venösa blodprover tas från kvinnorna i graviditetsvecka 28, från navelsträngen vid födseln och från barnen vid 18 månader och 7 års ålder. - Mekonium. - Munsvabb: Föräldrarna samlar in munsvabb från barnen 48 timmar efter födseln, vid 1, 9, 18 månader samt vid 3 och 7 års ålder. - Avföring: Föräldrarna samlar in avföringsprover hemma, vid 1, 9, 18 månader samt vid 3 och 7 års ålder. - Bröstmjölk: När barnet är 1 månad gammalt samlas bröstmjölk in hemma vid dagens första matning. 3. Ytterligare mätningar Aktigrafi (fysisk aktivitet, ljusexponering och sömnmönster) i en sub-kohort vid 3 och 7 års ålder. Vid 7 års ålder: Blodtryck, puls, pricktest, handgreppstyrka, längd, vikt, arbetsminne och tejp-prov på huden. 4. Ytterligare register: Barnhälsovårdsjournaler Tandvårdsjournaler Mödravårdsjournaler Elevhälsovårdsjournaler Longitudinell integrationsdatabas för sjukförsäkrings- och arbetsmarknadsstudier (LISA) Patientregistret Läkemedelsregistret Svenska barnhälsovårdsregistret (BHVQ) Svenska geografiska databasen Svenska neonatal kvalitetsregistret (SNQ) Graviditetsregistret Svenska kvalitetsregistret för karies och parodontit (SKaPa) Svenska skolhälsovårdens kvalitetsregister (EMQ) Befolkningsregistret (RTB)

Data för "Hypergammaglobulinemia in treated and untreated people with HIV"

Isabel Vigmo — Fri, 21 Nov 2025 19:21:51 GMT

Detta dataset innehåller pseudoanonymiserad data för kön, ålder och blodprover (n = 821), varav 750 prover är från 584 vuxna (≥ 18 år) personer med HIV (persons with HIV; PWH) och 71 från HIV-negativa kontroller. Blodproverna insamlades på ett standardiserat sätt i samband med mottagningsbesök som en del av "the Gothenburg HIV CSF Study Cohort" vid Avdelningen för infektionssjukdomar vid Sahlgrenska Universitetssjukhuset, Göteborg, Sverige. Data blev tillgänglig i samband med provtagningen och sammanställdes för analys mellan 13/11/1985 och 14/3/2023. Proverna från HIV-positiva deltagare kategoriserades i åtta kategorier motsvarande immunologiskt olika stadier av HIV-infektion: primär HIV-infektion (PHI; inom 12 månader från initial HIV-infektion), fem grupper karaktäriserade av CD4+ T cells-tal (≥ 500; 350−499; 200−349, 50−199 and < 50 celler/μL), pågående infektion eller malignitet (OIM) och deltagare med ART. PHI diagnos baserades på en kombination av anamnes och serokonversion, HIV-RNA eller enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA)-testning. OIM definierades som förekomst av opportunistisk eller icke-opportunistisk bakteriell, viral eller parasitinfektion eller aktiv cancer i samband med eller inom två veckor från provtagning. ART suppression definierades som pågående ART med plasma HIV-RNA < 50 kopiopr/mL i ≥ 6 months och innebar antiretroviral terapi med två eller fler aktiva läkemedel (nukleosid omvänt transkriptashämmare, non-nukleosid omvänt transkriptashämmare, proteashämmare, integrashämmare) enligt aktuella riktlinjer vid inklusionstillfället. Den HIV-negativa kontrollgruppen (n = 71) bestod av 44 individer med HIV preexponeringsprofylax (PrEP) med tenofovir disoproxil fumarate (TDF)/emtricitabine (FTC) och 27 frivilliga (sjukvårdspersonal, studenter och deras släktingar) utan PrEP. Blodproverna analyserades avseende IgG, neopterin, β2-microglobulin, albumin, HIV-RNA , CD4+, and CD4+ nadir. Därutöver finns information om antiretroviral terapi, varaktighet av viral suppression och hepatit C status. Data på hepatit C status erhölls från den svenska InfCareHIV kohorten.