https://researchdata.se/sv/catalogue Search results sv Denna datauppsättning innehåller longitudinella multiomiska profiler härledda från patienter med tidig HER2-positiv bröstcancer som deltog i den randomiserade fas II-studien PREDIX HER2 (NCT02568839). Studien jämförde neoadjuvant behandling med docetaxel, trastuzumab och pertuzumab (DHP) jämfört med trastuzumab emtansin (T-DM1). Det primära syftet med denna datainsamling var att övervaka tumörutveckling och tumörmikromiljödynamik under HER2-riktad behandling. Datamaterial och insamling: Datumuppsättningen omfattar multiomiska data från patientprover som samlats in vid olika tidpunkter: under behandling (efter två cykler av neoadjuvant behandling) och efter behandling (efter sex cykler av neoadjuvant behandling). Metod och analys: Omfattande molekylär karakterisering utfördes med hjälp av flera högkapacitetstekniker. Detta inkluderar hel-exomsekvensering (WES) för att identifiera somatiska mutationer och genomiska förändringar, RNA-sekvensering (RNA-seq) för bulktranskriptomisk profilering och proteomik för att övervaka proteinmängd. Dessutom utfördes avbildningsbaserad spatial transkriptomik med hjälp av Xenium In Situ-plattformen för att kartlägga den rumsliga organisationen av tumörmikromiljön; observera att Xeniums rumsliga data exklusivt är tillgängliga för tidpunkten för behandling. Mon, 22 Jun 2026 06:38:42 GMT https://researchdata.se/sv/catalogue/dataset/2026-179 https://researchdata.se/sv/catalogue/dataset/2026-179 Karolinska Institutet Kang Wang Emmanouil Sifakis Theodoros Foukakis