Data för: Deciduous forest restoration alters but does not restore functional and phylogenetic diversity of saproxylic beetles
https://doi.org/10.5878/f467-k877
Datasetet innehåller bearbetade data om 316 vedlevande skalbaggar insamlade under 2021 i 23 skogsbestånd i Värmland och Dalsland. Bestånden representerar tre kategorier: icke-restaurerade blandskogar, bestånd som restaurerats genom avverkning av gran och skapande av lövträdsved samt lövträdsdominerade målbestånd med riklig förekomst av död ved. Skalbaggar samlades in med 67 obetade fönsterfällor, i regel tre fällor per bestånd, från början av juni till mitten av oktober 2021. Individerna identifierades till art och arterna klassificerades som vedlevande utifrån litteratur och expertbedömningar.
Data tillhandahålls i sju csv filer. species_abundance_matrix innehåller antalet individer av 316 skalbaggsarter i varje fälla. functional_traits innehåller artdata för kroppslängd, födogrupp, trädslagsassociation och association med olika successions- eller nedbrytningsstadier av död ved. taxonomy_hierarchy innehåller den taxonomiska hierarkin från ordning till art som användes som en approximation av fylogeni. sample_environmental_data innehåller identiteter för fällor och bestånd samt beståndsvisa variabler för volym och Shannondiversitet av död ved och grundyta och Shannondiversitet av levande träd. diversity_metrics innehåller taxonomiska, funktionella och fylogenetiska diversitetsmått beräknade för varje fälla. community_weighted_means innehåller abundansviktade medelvärden för de funktionella egenskaperna. functional_pcoa_axes innehåller arternas koordinater längs de fem huvudkoordinataxlar som användes för att beskriva det funktionella egenskapsrummet.
Miljövariablerna beräknades från inventeringar av döda och levande träd. Volymen död ved beräknades per hektar utifrån mätningar av diameter och längd eller höjd. Diversiteten av död ved beräknades med Shannondiversitet baserat på kombinationer av trädslag, typ av död ved, nedbrytningsstadium och diameterklass. Diversiteten av levande träd beräknades på motsvarande sätt utifrån kombinationer av trädslag och diameterklass. Funktionell diversitet beräknades från en Gower-avståndsmatris baserad på arternas funktionella egenskaper, följt av en huvudkoordinatanalys med Cailliez-korrigering. De fem första axlarna användes för att beräkna funktionell rikedom, jämnhet och divergens. Fylogenetisk diversitet beräknades från ett taxonomiskt träd där alla grenar tilldelades samma längd. Abundansviktade medelvärden beskriver det genomsnittliga egenskapsvärdet i varje skalbaggssamhälle; för kategoriska egenskaper motsvarar värdet den relativa abundansen inom respektive egenskapskategori.
Arbetsboken kan öppnas med vanliga kalkylprogram och kräver ingen särskild programvara för att läsas eller återanvändas. Databearbetningen och de ursprungliga analyserna genomfördes i R 4.3.2, bland annat med paketen FD, picante, vegan, phylospatial, lmerTest, emmeans och iNEXT.3D. R och de relevanta paketen behövs för att återskapa de härledda diversitetsmåtten och de statistiska analyserna från art-, egenskaps-, taxonomi- och miljödata. See README för referenser.
Ladda ner 8 öppna filer (187.62 KiB)
Filer med öppen tillgång (8)
Filer med öppen tillgång (8)
Citering och åtkomst
Citering och åtkomst
Åtkomstnivå:
Skapare/primärforskare:
Forskningshuvudman:
Data innehåller personuppgifter:
Nej
Citering:
Språk:
Metod och utfall
Metod och utfall
Tidsperiod(er) som undersökts:
Arter och taxon:
Datainsamling - Mätningar och tester
Datainsamling - Mätningar och tester
Insamlingsmetod:
Mätningar och tester
Beskrivning av insamlingsmetod:
Skalbaggar insamlade med IBL2 fällor, miljödata insamlat i provytor, se: Larsson Ekström A, Hjältén J, Löfroth T (2024) A decadal study reveals that restoration guided by an umbrella species does not reach target levels. Journal of Applied Ecology 61:513–525. https://doi.org/10.1111/1365-2664.14586
Tidsperiod(er) för datainsamling:
2021-06 - 2021-10
Datakälla:
- Biologiska prover
Tidsupplösning:
2021 år
Geografisk täckning
Geografisk täckning
Geografisk plats:
Geografisk beskrivning:
Värmland och Dalsland
