Prokaryota planktons respiration, tillväxt och förekomst i Arktiska oceanen 2021
Data setet utgörs av resultat från mätningar av prokaryota (Bakterier och Arkéer) planktons respiration, tillväxt och förekomst i Arktiska oceanens ytksikt (0-500 m) 2021. Data insamlades under expeditionen Synoptic Arctic Survey med den svenska forskningsisbrytaren Oden mellan 25 juli och 20 september 2021. Prover insamlades främst med Niskin-flaskor på en rosett-hämtare utrustad med en CTD-sond. Några prover togs också i gränsskiktet mellan is och havsvatten med Ruttner hämtare efter att ett hål till vattenytan borrats. Processhastigheter mättes ombord inom någon timme från provtagning i ett svalt laboratorium med en temperatur på 7 °C. Planktonrespiration mättes med syre-optoder i åtta samtidiga prover inkuberade vid in situ-temperatur. För PROMAC-projektet förfiltrerade samtliga prover med 1,2 µm filter för att specifikt mäta prokaryot respiration. Tillväxt hos det prokaryota samhället mättes med upptag av DNA-basen tymidin märkt med tritium inkuberade vid in situ-temperatur. Förekomst av prokaryoter mättes med epifluorescens-mikroskopi efter inmärkning med färgämnet akridinorange. Cellmorfologi och -interaktioner studerades också via skannande elektronmikroskopi i prover konserverade med glutaraldehyd. I de filtrerade proverna bestämdes förekomsten av olika prokaryota taxa med sekvensning av 16S-RNA genen. Dessutom mättes uttryck av gener från isolerat mRNA. För metagenomik och transkriptomik från ofiltrerade prover hänvisas till OMICS-projektet från samma expedition. Huvudprojekten (”SASIce24h” och ”SAS”) har som syfte att bidra med kunskap om prokaryota planktons respiration, tillväxthastighet och totalbiomassa i syfte att bättre förstå omsättningen av kol i Arktiska oceanen och regleringen av den. Resultaten från expeditionen ska ge underlag för jämförelse med liknande studier i framtiden för att följa klimatförändringar. Den rumsliga täckningen ska öka förståelsen av hur processerna varierar i olika delar av oceanen. Samtidiga mätningar i andra delar av andra länderav Arktiska oceanen ska bidra till en mer heltäckande bild. I projektet ”PROMAC” studeras underhållsrespirationen hos prokaryota plankton och vilka aktiviteter som ingår där. Temperaturkänsligheten hos planktonrespiration undersöks i projektet ”RespirationQ10”. Bestämning av konversionsfaktorn från tymidinupptag till celltillväxt utfördes i delprojektet ”TCF”. Om tillräcklig mängd av spårämnet tymidin tillsattes undersöktes i delprojektet ”Isotope dilution”. Resultaten ska börja publiceras under 2024.