TARGET-seq genotyped single-cell RNA sequencing of hematopoietic stem cells and megakaryocyte-erythroid progenitor cells from a dual SF3B1-mutant MDS-RS patient and 3 healthy donors

Eva Hellström-Lindberg

doi:10.48723/d7s9-6336

TARGET-seq genotyped single-cell RNA sequencing of hematopoietic stem cells and megakaryocyte-erythroid progenitor cells from a dual SF3B1-mutant MDS-RS patient and 3 healthy donors

https://doi.org/10.48723/d7s9-6336

Denna datauppsättning består av TARGETseq (genotypriktad plattbaserad SmartSeq2) RNA-sekvenseringsdata från renade hematopoetiska stamceller (HSC) och megakaryocyt-erytroida progenitorer (MEP) från benmärgen hos en dubbel SF3B1-mutant MDS-RS patient vid två tillfällen poäng (39 månader efter diagnos och 118 månader efter diagnos); och renad benmärg HSC/MEP från tre friska donatorer. Syftet med denna datainsamling var att bedöma de molekylära egenskaperna som ökar "fitness" i SF3B1-mutant HSC jämfört med normal HSC. Se den engelska beskrivningen för mer information.

Ladda ner 2 dokumentationsfiler (3.49 KiB)

Dokumentationsfiler

Citering och åtkomst

Skapare/primärforskare:

Forskningshuvudman:

Karolinska Institutet
Öppnar nytt fönster hos ror.org.
RORÖppnas i en ny tabb

Data innehåller personuppgifter:

Ja

Typ av personuppgifter:

Genetiska och biologiska data av patienter

Kodnyckel existerar:

Ja

Data innehåller känsliga personuppgifter:

Ja

Citering:

Metod och utfall

Administrativ information

Ämnesområde och nyckelord

Publikationer

Metadata

Version 1

TARGET-seq genotyped single-cell RNA sequencing of hematopoietic stem cells and megakaryocyte-erythroid progenitor cells from a dual SF3B1-mutant MDS-RS patient and 3 healthy donors

Dokumentationsfiler

Citering och åtkomst

Skapare/primärforskare:

Forskningshuvudman:

Data innehåller personuppgifter:

Typ av personuppgifter:

Kodnyckel existerar:

Data innehåller känsliga personuppgifter:

Citering:

Tillgänglighetsnivå:

Licens:

Språk:

Metod och utfall

Analysenhet:

Population:

Tidsdimension:

Studiedesign:

Urvalsmetod:

Beskrivning av urval:

Dataformat/datastruktur:

Prover/material - Befintliga från vetenskaplig samling/biobank

Namn:

Typ(er) av prov:

Administrativ information

Ansvarig institution/enhet:

Medverkande:

Etikprövning:

Finansiering

Finansiär:

Referensnummer:

Finansiär:

Referensnummer:

Finansiär:

Referensnummer:

Finansiär:

Referensnummer:

Ämnesområde och nyckelord

Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2025:

Nyckelord:

Publikationer

Citering:

DOI:

Metadata