DNA-sekvenseringsdata för "Stabilt klonalt bidrag från härstamningsbegränsade stamceller till mänsklig hematopoies"
https://doi.org/10.48723/313d-dd68
Detta dataset innehåller tre typer av DNA-sekvenseringsdata.
-Error-corrected DNA capture sequencing (ECTS)
-Bulk whole-exome sequencing (WES)
-Single-colony whole-genome sequencing (WGS)
All sekvensering utfördes på en Illumina NovaSeq 6000 vid National Genomics Infrastructure i Stockholm, med hjälp av "paired-end sequencing mode".
ECTS
Mononukleära benmärgsceller isolerade från alla 93 friska donatorer utsattes för ECTS för identifiering av somatiska mutationer riktade mot 23 gener som omfattar de mest återkommande muterade generna som rapporterats i klonal hematopoes.
WES
BM MNC-DNA isolerat från det första besöket från 20 friska donatorer över 71 år utsattes för WES i bulk. Parat buckalt swab-DNA användes för normala kontroller.
Enkelkoloni WGS
DNA extraherat från 333 genotypade enskilda kolonier och 10 kontroll-buckala pinnprover från 10 donatorer genomgick WGS.
Datasetet består av tre mappar:
scWGS innehåller 343 filer i format CRAM totalt cirka 16.3 TiB (17.9 TB).
WES innehåller 40 filer i format CRAM totalt cirka 650 GiB (710 GB).
ECTS innehåller 117 filer i format CRAM totalt cirka 18 GiB (20 GB).
Dokumentationsfiler
Dokumentationsfiler
Citering och åtkomst
Citering och åtkomst
Tillgänglighetsnivå:
Skapare/primärforskare:
Forskningshuvudman:
Data innehåller personuppgifter:
Ja
Typ av personuppgifter:
Genetiska data (Germline enstaka nukleotidpolymorfismer och somatiska mutationer)
Kodnyckel existerar:
Ja
Data innehåller känsliga personuppgifter:
Ja
