SUPPLEMENTARY MATERIAL: Transcriptomic analysis reveals pro-inflammatory signatures associated with acute myeloid leukemia progression
https://doi.org/10.57804/xryk-dn78
Studie beskriven i den engelska versionen av denna katalogpost.
Data består av en kompletterande Pdf-fil och en Excel-fil med följande tabeller:
Kompletterande tabell 1. Översikt över urval av studiekohort
Kompletterande tabell 2. Egenskaper för urvalet av studiekohorten
Kompletterande tabell 3. Klinisk information
Kompletterande tabell 4. Egenskaper hos CD34+ BM-kontrollprover
Kompletterande tabell 5. Information om antikroppar
Kompletterande tabell 6. Statistik för RNA-seq
Kompletterande tabell 7. SNV:er och små InDels som upptäckts med RNA-seq
Kompletterande tabell 8. Samlade metadata och RNA-seq- och WGS/WES-resultat
Kompletterande tabell 9. Fusionstranskript i R/PR AML
Kompletterande tabell 10. Provanvändning för generering av olika analyser
Kompletterande tabell 11. DEG associerade med kort kontra lång EFS
Kompletterande tabell 12. GO-analys av DEG mellan korta och långa EFS-associerade prover
Kompletterande tabell 13. Statistik i samband med överlevnadsanalyser
Kompletterande tabell 14. DEG mellan patientmatchade diagnos- och återfallsprover
Kompletterande tabell 15. GO-analys av DEGs mellan patientmatchade diagnos- och återfallsprover
Kompletterande tabell 16. Regler för maskininlärningsmodeller för diagnos och återfall i AML hos vuxna
Kompletterande tabell 17. Regler för maskininlärningsmodeller för diagnos och återfall i AML hos barn
Kompletterande tabell 18. Modellregler för maskininlärning för diagnos och återfall i pediatrisk AML (funktioner sammanslagna med TARGET)
Kompletterande tabell 19. Modellregler för maskininlärning för diagnos och återfall i TARGET-kohorten (funktioner sammanslagna med Local Pediatric)
Kompletterande tabell 20. Verifiering av transkriptomiska fusionshändelser och tillhörande primerinformation
Datasetet har ursprungligen publicerats i DiVA och flyttades över till SND 2024.
Datafiler
Datafiler
Citering och åtkomst
Citering och åtkomst
Tillgänglighetsnivå:
Skapare/primärforskare:
- Sara A. Yones - Uppsala universitet - Institutionen för cell- och molekylärbiologi / Science for Life Laboratory
- Jitong Sun - Uppsala universitet - Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Experimentell och klinisk onkologi / Science for Life Laboratory
- Aron Skaftason - Karolinska Institutet - Institutionen för molekylär medicin och kirurgi
- Nina Norgren - Umeå universitet - Institutionen för molekylärbiologi, Nationell Bioinformatik Infrastruktur Sverige / Science for Life Laboratory
- Morten Krogh Herlin - Århus universitet - Institutionen för klinisk medicin / Institutionen för pediatrik och ungdomsmedicin
- Jonas Abrahamsson - Sahlgrenska akademin vid Göteborgs universitet - Institutionen för pediatrik, Institutionen för kliniska vetenskaper
- Kirsi Jahnukainen - Helsingfors universitet och Helsingfors universitetscentralsjukhus - Barnsjukhuset
- Monica Cheng Munthe-Kaas - Norska Folkhälsoinstitutet
- Bernward Zeller - Oslo universitetssjukhus - Avdelningen för barn- och ungdomsmedicin
- Katja Pokrovskaja Tamm - Karolinska Institutet och Karolinska Universitetssjukhuset - Institutionen för onkologi och patologi
- Lucia Cavelier - Uppsala universitet - Department of Immunology, Genetics and Pathology / Science for Life Laboratory
Forskningshuvudman:
Data innehåller personuppgifter:
Nej
Citering:
Språk:
Metod och utfall
Metod och utfall
Administrativ information
Administrativ information
Ämnesområde och nyckelord
Ämnesområde och nyckelord
Relationer
Relationer
Publikationer
Publikationer
Metadata
Metadata
Version 1
