INDILACT - Förlängd frivillig väntetid för förstakalvare. Part 2: Individanpassad FVT - Metadata och R-script med statistiska beräkningar

Detta är del 2 i INDILACT, del 1 finns publicerad separat. Studien syftar till att undersöka hur individanpassad frivillig väntetid melan kalvning och första insemination påverkar mjölkproduktion, fertilitet och hälsa för förstakalvare under deras första kalvningsintervall. Data registrerades mellan januari 2019 och oktober 2022. Denna data finns arkiverad: - Metadata (Excel och PDF): tillgänglig - Rådata (.txt filer) från kokontrollen som drivs av Växa Sverige: begränsad åtkomst pga avtal med VÄXA och gårdarna som äger datan, kodlistor finns tillgängligt i INDILACT del 1. - Aggregated data (Excel filer): begränsad åtkomst pga avtal med VÄXA och gårdarna som äger datan - R- script med statistiska beräkningar Metadata (3 filer): - Metadata gentypning: Den enda nya filtypen jämfört med INDILACT del 1, beskrivning hur denna kategori av data har hanterats - i övriga filtyper har hanterats på samma sätt som i INDILACT del 1. - Metadata - del 2 - generell sammanfattning över grundläggande datahantering för aggregering av datafiler (datum osv) för att skapa de excelfiler som sedan använts som grundfiler för R-scripten. - DisCodes: Indelning av diagnoser i sjukdomskategorier. Rådata: -59 .txt filer med kokontrolldata uttagna vid 8 tillfällen. -Data från 18 svenska gårdar från jan 2019 till okt 2022. Aggregerade data: - 29 Excelfiler. Textfilerna har bearbetats till användbart format så all data av samma typ från alla 8 tillfällen finns i samma Excelfil. - Insamlade data från gårdarna via mail och telefonkontakt om de korna som inkluderats i försöket från oktober 2020 till oktober 2022. - ett sammaslaget script med bearbetade data efter datahantering i R (output från scriptet "Data analysis part 2 - final") där relevanta variabler har räknats ut och sammanställts för vidare statistiska beräkningar. R-script med datahantering och statistiska beräkningar: - "Data analysis part 2 - final": Data hantering för att skapa filen med relevanta variabler som används i de statistiska beräkningarna. - "Part 2 - Binomial models - Fertility": Statistiska beräkningar av variabler som kräver Binomiala modeller. - "Part 2 - glmmTMB models - Fertility" : Statistiska beräkningar av variabler som kräver glmmTMB modeller. - "Part 2 - linear models - Fertility": Statistiska beräkningar av fruktsamhetsvariabler som kräver linjära modeller. - "Part 2 - linear models": Statistiska beräkningar av variabler som kräver linjära modeller - ffa mjölkvariabler.