Cyp1A- och ABC-transportöruttryck och funktion i PLHC-1cellinje efter exponering för mikrocystin-LR och benso (a)pyren

Carlos M. Luquet

doi:10.5878/bfa6-gd21

Cyp1A- och ABC-transportöruttryck och funktion i PLHC-1cellinje efter exponering för mikrocystin-LR och benso (a)pyren

https://doi.org/10.5878/bfa6-gd21

Detta dataset inkluderar följande parametrar mätta i PLHC-1: cellinje. 1)Cyp1a-aktivitetsdata: Detta avsnitt innehåller rådata som används för att beräkna Cyp1a-aktivitet som EROD-aktivitet (etoxiresorufin-O-deetylas). Filerna inkluderar proteinkoncentration, EROD-lutning och specifik EROD-aktivitet, tillsammans med data från standardkurvor (BSA och resorufin). Dessutom finns det data från ett experiment som involverade pre-induktion av EROD-aktivitet med användning av β-naftoflavon. Detaljerade beskrivningar av mätförhållanden och beräkningar finns i den medföljande README-filen. 2) Cytotoxicitetsdata: Detta avsnitt tillhandahåller rådata (fluorescerande enheter) som används för att beräkna cytotoxicitet med två fluorescerande indikatorer: 5-Carboxyfluorescein Diacetate-Acetoximethyl Ester (CFDA-AM) och Alamar Blue (AB). README-filen innehåller beskrivningar av mätförhållandena och beräkningar. 3) qPCR-data: Detta inkluderar råa Ct-värden från qPCR-experiment. 4) Rhodamine 123-ackumuleringsdata: Detta av

Ladda ner 14 filer (59.82 KiB)

Datafiler

Cytotoxicity_FU.csv
2.58 KiB
EROD_2022_BNF_pretreatment.csv
3.83 KiB
EROD_2022_BSA_Resorufin_curves.csv
1.31 KiB
EROD_2022_protein.csv
5.43 KiB
EROD_2022_slopes.csv
5.8 KiB
EROD_2022_specific_activity.csv
5.74 KiB
qPCR_Ct_data.csv
14.77 KiB
Rh123_2022_BSA_curves.csv
1.75 KiB
Rh123_2022_Rh123_FU.csv
4.97 KiB
Rh123_2022_Rh123_Proteins.csv
5.69 KiB

Dokumentationsfiler

Cytotox_Readme.txt
2.21 KiB
EROD_readme.txt
2.32 KiB
qPCR_readme.txt
1.37 KiB
Rh123_readme.txt
2.05 KiB

Citering och åtkomst

Skapare/primärforskare:

Flavia Bieczynski - Göteborgs universitet - Institutionen för biologi och miljövetenskap
Öppnar nytt fönster hos orcid.org.
ORCIDÖppnas i en ny tabb
Malin Celander - Göteborgs universitet - Institutionen för biologi och miljövetenskap
Öppnar nytt fönster hos orcid.org.
ORCIDÖppnas i en ny tabb
Maja Edenius - Göteborgs universitet - IVL Svenska Miljöinstitutet
Annika Lindkvist - Göteborgs universitet - Institutionen för biologi och miljövetenskap
Julio C. Painefilú - Comahue universitet - Biological and Geoenvironmental Technologies Patagonian Institute
Öppnar nytt fönster hos orcid.org.
ORCIDÖppnas i en ny tabb
Andrés Venturino - Comahue universitet - Environmental Toxicology and Agrobiotechnology Research Centre of Comahue
Öppnar nytt fönster hos orcid.org.
ORCIDÖppnas i en ny tabb
Carlos M. Luquet - Comahue universitet - Laboratory of Aquatic Ecotoxicology
Öppnar nytt fönster hos orcid.org.
ORCIDÖppnas i en ny tabb

Forskningshuvudman:

Göteborgs universitet
Öppnar nytt fönster hos ror.org.
RORÖppnas i en ny tabb

Data innehåller personuppgifter:

Nej

Citering:

Tillgänglighetsnivå:

Data är fritt tillgängliga

Språk:

Engelska

Metod och utfall

Tidsperiod(er) som undersökts:

2022-05-01 - 2024-08-08

Dataformat/datastruktur:

Numeriska

Arter och taxon:

Poeciliopsis lucida (fish) hepatocellular carcinoma cell line (plhc-1)

Datainsamling - Laboratorieexperiment

Insamlingsmetod:

Laboratorieexperiment

Beskrivning av insamlingsmetod:

The data were collected through laboratory experiments conducted at the Department of Biological and Environmental Sciences, University of Gothenburg. All experiments took place in 2022, except for the half-maximal inhibition concentration (IC50) assays for benzo[a]pyrene (BaP) on CYP1A-mediated EROD activity in PLHC-1 cells pre-exposed to BNF (performed in July 2024). The PLHC-1 cell line (ATCC® CRL-2406TM) was obtained from LGC Standards (Borås, Sweden). Cells were cultured in tightly capped 75 cm² cell culture flasks with 25 mM HEPES-buffered MEM, pH 7.1, supplemented with 5% (v/v) FBS at 30 ºC. For each assay, cells were seeded as follows: - EROD and Rh123 accumulation assay: 48-well plates, 6 × 10⁵ cells/mL in 500 µL per well. - Cytotoxicity Analyses: 96-well plates, 5 × 10⁵ cells/mL in 200 µL per well. - mRNA Expression Analyses: 6-well plates, 2 × 10⁶ cells/mL in 2 mL per well. After a 24-hour incubation post-seeding, media were removed from each well, and cells were rinsed with 10 mM Na-phosphate buffer, pH 7.4, containing 0.9% (w/v) NaCl (PBS). Cells were then exposed to DMSO (control), MCLR, BaP, or their mixture. EROD activity, Rh123 accumulation, cytotoxicity, and mRNA expression were measured on separate plates, with each type of measurement conducted on different days. Data were recorded using a VICTORTM 1420 Multilabel Counter (Wallac Sverige AB) for EROD, cytotoxicity, and Rh123 assays, and an iCYCLER instrument (Bio-Rad) for qPCR.

Tidsperiod(er) för datainsamling:

2022-05-01 - 2024-08-08

Datainsamlare:

Göteborgs universitet
Öppnar nytt fönster hos ror.org.
RORÖppnas i en ny tabb

Datakälla:

Biologiska prover

Instrument

Namn:

VICTORTM 1420 Multilabel Counter

Beskrivning av instrument:

fluorometer VICTORTM 1420 Multilabel Counter from Wallac Sverige AB

Namn:

iCYCLER instrument (Bio-Rad)

Beskrivning av instrument:

iCYCLER instrument (Bio-Rad)

Administrativ information

Ansvarig institution/enhet:

Institutionen för biologi och miljövetenskap

Finansiering

Finansiär:

CONICET
Öppnar nytt fönster hos ror.org.
RORÖppnas i en ny tabb

Referensnummer:

S2021-0046

Ämnesområde och nyckelord

Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2025:

Biokemi
Molekylärbiologi

Nyckelord:

Cytokrom p450-enzymsystemet

cytotoxicitet
ABC transportör
mikrocystin-LR
etoxiresorufin-O-deetylasaktivitet
qPCR
polyaromatiska kolväten
Poeciliopsis lucida hepatocellulära karcinomcellinje

Publikationer

Citering:

Title: Effects of Combined Exposures of Microcystin-Lr and Benzo[A]Pyrene on Detoxification Mechanisms in the Fish Liver Cell Line (Plhc-1). Authors: Celander, Malin Charlotta and Bieczynski, Flavia and Edenius, Maja and Lindkvist, Annika and Painefilú, Julio C. and Venturino, Andres and Luquet, Carlos M. This is a preprint article, it offers immediate access but has not been peer reviewed. Available at SSRN: https://ssrn.com/abstract=4997829Öppnas i en ny tabb or http://dx.doi.org/10.2139/ssrn.4997829Öppnas i en ny tabb Journal: Aquatic Toxicology

Kontakt

Flavia Bieczynskiflavia.bieczynski@ub.gu.seÖppnas i en ny tabb

Metadata

Valt format att exportera metadatan.

Version 1

Göteborgs universitet