Gå direkt till huvudinnehåll
Researchdata.se

Cyp1A- och ABC-transportöruttryck och funktion i PLHC-1cellinje efter exponering för mikrocystin-LR och benso (a)pyren

https://doi.org/10.5878/bfa6-gd21
Detta dataset inkluderar följande parametrar mätta i PLHC-1: cellinje. 1)Cyp1a-aktivitetsdata: Detta avsnitt innehåller rådata som används för att beräkna Cyp1a-aktivitet som EROD-aktivitet (etoxiresorufin-O-deetylas). Filerna inkluderar proteinkoncentration, EROD-lutning och specifik EROD-aktivitet, tillsammans med data från standardkurvor (BSA och resorufin). Dessutom finns det data från ett experiment som involverade pre-induktion av EROD-aktivitet med användning av β-naftoflavon. Detaljerade beskrivningar av mätförhållanden och beräkningar finns i den medföljande README-filen. 2) Cytotoxicitetsdata: Detta avsnitt tillhandahåller rådata (fluorescerande enheter) som används för att beräkna cytotoxicitet med två fluorescerande indikatorer: 5-Carboxyfluorescein Diacetate-Acetoximethyl Ester (CFDA-AM) och Alamar Blue (AB). README-filen innehåller beskrivningar av mätförhållandena och beräkningar. 3) qPCR-data: Detta inkluderar råa Ct-värden från qPCR-experiment. 4) Rhodamine 123-ackumuleringsdata: Detta av
Ladda ner data och dokumentation (14 filer / 59.82 KiB)

Datafiler

  • Cytotoxicity_FU.csv
    2.58 KiB
  • EROD_2022_BNF_pretreatment.csv
    3.83 KiB
  • EROD_2022_BSA_Resorufin_curves.csv
    1.31 KiB
  • EROD_2022_protein.csv
    5.43 KiB
  • EROD_2022_slopes.csv
    5.8 KiB
  • EROD_2022_specific_activity.csv
    5.74 KiB
  • qPCR_Ct_data.csv
    14.77 KiB
  • Rh123_2022_BSA_curves.csv
    1.75 KiB
  • Rh123_2022_Rh123_FU.csv
    4.97 KiB
  • Rh123_2022_Rh123_Proteins.csv
    5.69 KiB

Dokumentationsfiler

  • Cytotox_Readme.txt
    2.21 KiB
  • EROD_readme.txt
    2.32 KiB
  • qPCR_readme.txt
    1.37 KiB
  • Rh123_readme.txt
    2.05 KiB

Citering och åtkomst

Tillgänglighetsnivå:

Skapare/​primärforskare:

Forskningshuvudman:

Data innehåller personuppgifter:

Nej

Citering:

Språk:

Metod och utfall

Tidsperiod(er) som undersökts:

Dataformat/​datastruktur:

Arter och taxon:

Datainsamling Laboratorieexperiment

Insamlingsmetod:

Laboratorieexperiment

Beskrivning av insamlingsmetod:

The data were collected through laboratory experiments conducted at the Department of Biological and Environmental Sciences, University of Gothenburg. All experiments took place in 2022, except for the half-maximal inhibition concentration (IC50) assays for benzo[a]pyrene (BaP) on CYP1A-mediated EROD activity in PLHC-1 cells pre-exposed to BNF (performed in July 2024). The PLHC-1 cell line (ATCC® CRL-2406TM) was obtained from LGC Standards (Borås, Sweden). Cells were cultured in tightly capped 75 cm² cell culture flasks with 25 mM HEPES-buffered MEM, pH 7.1, supplemented with 5% (v/v) FBS at 30 ºC. For each assay, cells were seeded as follows: - EROD and Rh123 accumulation assay: 48-well plates, 6 × 10⁵ cells/mL in 500 µL per well. - Cytotoxicity Analyses: 96-well plates, 5 × 10⁵ cells/mL in 200 µL per well. - mRNA Expression Analyses: 6-well plates, 2 × 10⁶ cells/mL in 2 mL per well. After a 24-hour incubation post-seeding, media were removed from each well, and cells were rinsed with 10 mM Na-phosphate buffer, pH 7.4, containing 0.9% (w/v) NaCl (PBS). Cells were then exposed to DMSO (control), MCLR, BaP, or their mixture. EROD activity, Rh123 accumulation, cytotoxicity, and mRNA expression were measured on separate plates, with each type of measurement conducted on different days. Data were recorded using a VICTORTM 1420 Multilabel Counter (Wallac Sverige AB) for EROD, cytotoxicity, and Rh123 assays, and an iCYCLER instrument (Bio-Rad) for qPCR.

Tidsperiod(er) för datainsamling:

2022-05-01 - 2024-08-08

Datainsamlare:

Datakälla:

  • Biologiska prover

Instrument

Namn:

VICTORTM 1420 Multilabel Counter

Beskrivning av instrument:

fluorometer VICTORTM 1420 Multilabel Counter from Wallac Sverige AB

Namn:

iCYCLER instrument (Bio-Rad)

Beskrivning av instrument:

iCYCLER instrument (Bio-Rad)

Administrativ information

Ansvarig institution/​enhet:

Institutionen för biologi och miljövetenskap

Finansiering

Finansiär:

Referensnummer:

RD - EX-2021-93553723-APN-CB#CONICET

Projektnamn på ansökan:

Effects of the combination of cyanotoxins and polycyclic aromatic hydrocarbons on the multiple xenobiotic resistance system in fish

Information om finansiering:

Partial Funding Program for Assistant Researchers, CONICET, 2021, to F. Bieczynski

Finansiär:

Referensnummer:

PICT 2019-649

Projektnamn på ansökan:

Evaluation of combined effects of contaminants and environmental risk on fish present in the waters of Northern Patagonia

Information om finansiering:

PICT 2019-649 to F. Bieczynski

Finansiär:

Referensnummer:

PIP 2753

Information om finansiering:

PIP 2753 to C. Luquet

Finansiär:

Referensnummer:

GFOv2024-004

Projektnamn på ansökan:

Chemical Interactions on the Detoxification Pathway in Fish Liver Cells Exposed to Mixtures

Information om finansiering:

GFOv2024-004 to M. C. Celander

Finansiär:

Referensnummer:

942-215-605

Information om finansiering:

942-215-605 to M. Edenius

Finansiär:

Referensnummer:

S2021-0046

Ämnesområde och nyckelord

Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2025:

Nyckelord:

Publikationer

Citering:

Title: Effects of Combined Exposures of Microcystin-Lr and Benzo[A]Pyrene on Detoxification Mechanisms in the Fish Liver Cell Line (Plhc-1). Authors: Celander, Malin Charlotta and Bieczynski, Flavia and Edenius, Maja and Lindkvist, Annika and Painefilú, Julio C. and Venturino, Andres and Luquet, Carlos M. This is a preprint article, it offers immediate access but has not been peer reviewed. Available at SSRN: https://ssrn.com/abstract=4997829Öppnas i en ny tabb or http://dx.doi.org/10.2139/ssrn.4997829Öppnas i en ny tabb Journal: Aquatic Toxicology

Kontakt

Metadata

Version 1
doris
gu_sv
Publicerad:|Uppdaterad: