mRNA sequencing and LC-MS data for: Exposure of colon-derived epithelial monolayers to fecal luminal factors from patients with colon cancer and ulcerative colitis results in distinct gene expression patterns
https://doi.org/10.5878/bdc2-kk22
Resultat från mRNA sekvensering från epiteliala monolager odlade med fekala supernatanter från patienter med ulcerös kolit, coloncancer och friska. Resultat från analys av metaboliter i de fekala supernatanterna mha LC-MS.
Datasetet innehåller:
Två dokumentationsfiler där metod och datainsamling redovisas
En fil innehållande tabulär data där resultaten från analyser redovisas.
Citering och åtkomst
Citering och åtkomst
Tillgänglighetsnivå:
Skapare/primärforskare:
Forskningshuvudman:
Data innehåller personuppgifter:
Nej
Citering:
Språk:
Metod och utfall
Metod och utfall
Population:
Patienter med ulcerös kolit, patienter med koloncancer samt friska individer.
Tidsdimension:
Studiedesign:
- Experimentell studie
Beskrivning av studiedesign:
Se bifogad fil "Data collection and method"
Tidsperiod(er) som undersökts:
Dataformat/datastruktur:
Prover/material - Befintliga från vetenskaplig samling/biobank
Prover/material - Befintliga från vetenskaplig samling/biobank
Namn:
Administrativ information
Administrativ information
Etikprövning 1:
Göteborg - Dnr 563-02
Etikprövning 2:
Göteborg - Dnr 233-10
Etikprövning 3:
Göteborg - Dnr 988-14
Finansiering
Finansiering
Finansiär:
- Vetenskapsrådet
Öppnar nytt fönster hos ror.org.
RORÖppnas i en ny tabb
Referensnummer:
2019-01052, 2018-02566
Finansiär:
- Apotekare Hedbergs stiftelse
Projektnamn på ansökan:
Resolution av inflammation hos patienter med ulcerös kolit
Finansiär:
Referensnummer:
ALFGBG-723921, ALFGBG-722331, ALFGBG-965619
Ämnesområde och nyckelord
Ämnesområde och nyckelord
Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2025:
Publikationer
Publikationer
Citering:
Moraes Holst, L., Iribarren, C., Sapnara, M., Savolainen, O., Törnblom, H., Wettergren, Y., Strid, H., Simrén, M., Magnusson, M. K., & Öhman, L. (n.d.). Fecal Luminal Factors from Patients with Gastrointestinal Diseases Alter Gene Expression Profiles in Caco-2 Cells and Colonoids. In International Journal of Molecular Sciences (No. 15505; Vol. 23, Issue 24). https://doi.org/10.3390/ijms232415505Öppnas i en ny tabb
Citering:
Iribarren, C., Nordlander, S., Sundin, J., Isaksson, S., Savolainen, O., Törnblom, H., Magnusson, M. K., Simrén, M., & Öhman, L. (n.d.). Fecal luminal factors from patients with irritable bowel syndrome induce distinct gene expression of colonoids. In Neurogastroenterology and Motility (Vol. 34, Issue 10). https://doi.org/10.1111/nmo.14390Öppnas i en ny tabb
