Transkriptomikdata på humana PSC odlade under olika förhållanden
Den här studien har använt transkkriptomikdata från kvalitetstestning av pluripotenta stamceller för att undersöka hur olika odlingsförhållanden påverkar genuttryck. Alla pluripotenta stamceller i studien har klarat test av pluripotens. Data innehåller transkriptomiska signaturer av pluripotenta stamcell-linjer från humana donatorer, uppmätta med Illumina Gene Expression HT12 Direct Hybridization assay (Illumina HT 12v.4). Humana inducerade pluripotenta stamceller (iPSC) och embryonala stamceller (ESC) odlades under antingen odefinierad eller definierad och xenofri kultur, eller överförd från odefinierade till definierade kultur. Dessa benämns som feeder, laminin och transfer tabellen över proverna, respektive. Hudbiopsier samlades in efter samtycke från donatorer för modellering av tidig human utveckling. Donatorproverna omprogrammerades till iPCS och transkriptomanalyser utfördes för att kvalitetstesta de pluripotenta stamcellerna. Datasetet består av 115 filer i IDAT-format och en i CSV-format. Datasetets totala storlek är ungefär 335 MB.
