Gå direkt till huvudinnehåll
Researchdata.se

Data för: Randomized trial of neoadjuvant palbociclib and endocrine therapy versus chemotherapy in ER+/HER2- breast cancer (PREDIX LumB): Primary analysis and development of the CDKPredX metagene predictor

https://doi.org/10.48723/j14a-6r76
Datasetet innehåller hel-exomsekvensering (WES) och RNA-sekvensering (RNA-Seq) i form av FASTQ-filer från tumörprover inom ramen för PREDIX Lum B-studien, en prospektiv randomiserad fas II-studie (ClinicalTrials.govÖppnas i en ny tabb ID: NCT02603679) utförd vid tre sjukhus i Sverige. Totalt omfattar datasetet 166 WES-prover och 163 RNA-Seq-prover. För WES ingår även matchade normalprover från blod. Metadatan inkluderar anonymiserat patient-ID, behandlingsarm, kön, och korresponderande WES- och RNA-seq anonymiserade prov-IDn. Filer är organiserade efter sekvenseringstyp (WES och RNA-Seq), samt en metadatafil med variabler: prövnings-ID, kön, behandlingsarm och filvägar. Ingen särskild programvara krävs för åtkomst till FASTQ-filer eller metadata. Vidare analys kräver relaterade bioinformatik-verktyg. Datasetet består av: - 4 974 FASTQ-filer, komprimerade som GNU zip-filer - 3 CSV-filer - 1 readme-fil i TXT-format Datasetets totala storlek är ca 7,6 TB .

Citering och åtkomst

Metod och utfall

Geografisk täckning

Administrativ information

Ämnesområde och nyckelord

Relationer

Kontakt

Metadata

doriski