Subcellular Thiol Functional Group Distribution in Geobacter sulfurreducens Determined by Hg LIII-Edge EXAFS: Research Data
Datafiler
Datafiler
- F2a_Data_for_Figure_2a_S_xanes_data_and_fitting.tsv111.35 KiB
- F3_Data_for_Figure_3_EXAFS_data_and_fitting.tsv1.49 MiB
- F4_Data_for_Figure_4_first_derivative_Hg_XANES.tsv595.34 KiB
- F5_Data_for_Figure_5 _RSH_concentration_density.tsv396 Bytes
- FS1a_Data_for_Figure_S1a_cell_growth_curve.tsv181 Bytes
- FS1b_Data_for_Figure_S1b_cell_density.tsv184 Bytes
- FS1c_Data_for_Figure_S1c_OD600_OD660_relationship.tsv251 Bytes
- FS2_Data_for_Figure_S2_correlation_matrix.tsv1.49 KiB
- T1_Data_for_Table_1_mass_TOC_TS_RSH_concentration.tsv1.2 KiB
- T2_Data_for_Table_2 _mass_TOC_TS_RSH_distribution.tsv1.14 KiB
- T4_Data_for_Table_4_first_shell_fits_Hg_EXAFS.tsv2.54 KiB
- TS5_Data_for_Table_S5_1st_and_2nd_shell_fits_Hg_EXAFS .tsv4.08 KiB
Dokumentationsfiler
Dokumentationsfiler
Citering och åtkomst
Citering och åtkomst
Tillgänglighetsnivå:
Skapare/primärforskare:
Forskningshuvudman:
Diarienummer hos huvudman:
- SLU.seksko.2025.4.2-76
Data innehåller personuppgifter:
Nej
Citering:
Språk:
Metod och utfall
Metod och utfall
Tidsperiod(er) som undersökts:
Arter och taxon:
Datainsamling - Laboratorieexperiment
Datainsamling - Laboratorieexperiment
Insamlingsmetod:
Laboratorieexperiment
Beskrivning av insamlingsmetod:
Hg LIII-kantens EXAFS-spektra togs vid Diamond Light Source (strållinje I20, scanner). Dataanalys och anpassning utfördes med hjälp av WinXAS tillsammans med FEFF-7.
Tidsperiod(er) för datainsamling:
2022-05-01 - 2025-04-30
Datainsamlare:
- Sveriges lantbruksuniversitet
Öppnar nytt fönster hos ror.org.
ROR
Datakälla:
- Processer
- Biologiska prover
Instrument
Instrument
Namn:
Synkrotron-röntgenanläggning
Typ:
Tekniskt/-a instrument
Beskrivning av instrument:
Synkrotron-röntgenstrålningslinje I20-skanning vid Synkrotron-röntgenanläggningen, Diamond Light Source, Storbritannien
Datainsamling - Laboratorieexperiment
Datainsamling - Laboratorieexperiment
Insamlingsmetod:
Laboratorieexperiment
Beskrivning av insamlingsmetod:
Totalt organiskt kol och total svavelhalt kvantifierades med en elementaranalysator (Vario MACRO cube) med en relativ standardavvikelse (RSD) på 0,5%. Totalhalter av kvicksilver bestämdes genom förbränningsatomabsorptionsspektrometri med en direktkvicksilveranalysator (DMA-80, Milestone; detektionsgräns = 0,01 ng; RSD = 6%).
Tidsperiod(er) för datainsamling:
2022-06-01 - 2024-10-31
Datainsamlare:
- Sveriges lantbruksuniversitet
Öppnar nytt fönster hos ror.org.
ROR
Instrument
Instrument
Namn:
Elementaranalysator (Vario MACRO cube)
Typ:
Tekniskt/-a instrument
Namn:
Direktkvicksilveranalysator (DMA-80, Milestone)
Typ:
Tekniskt/-a instrument
Datainsamling - Laboratorieexperiment
Datainsamling - Laboratorieexperiment
Insamlingsmetod:
Laboratorieexperiment
Beskrivning av insamlingsmetod:
Svavel K-kant XANES-spektra samlades in vid 4B7A Medium Energy X-ray Beamline vid Beijing Synchrotron Radiation Facility. Databehandling, inklusive normalisering och linjärkombinationsanpassning, utfördes med hjälp av Larch-programvarupaketet.
Tidsperiod(er) för datainsamling:
2022-06-01 - 2024-12-31
Datainsamlare:
- Sveriges lantbruksuniversitet
Öppnar nytt fönster hos ror.org.
ROR
Datakälla:
- Processer
- Biologiska prover
Instrument
Instrument
Namn:
Synkrotron-röntgenanläggning
Typ:
Tekniskt/-a instrument
Beskrivning av instrument:
Synkrotron-röntgen vid 4B7A Medium Energy X-ray-strålningslinje vid Beijing Synkrotronstrålningsanläggningen
Administrativ information
Administrativ information
Ansvarig institution/enhet:
Institutionen för skogens ekologi och skötsel
Finansiering
Finansiering
Finansiär:
- Forskningsrådet för Miljö, Areella Näringar och Samhällsbyggande
Öppnar nytt fönster hos ror.org.
ROR
Referensnummer:
2021-00551_Formas
URI hos finansiär:
Projektnamn på ansökan:
Mekanismer bakom cellulärt upptag av kvicksilver (II) vid bakteriell kvicksilvermetylering
Ämnesområde och nyckelord
Ämnesområde och nyckelord
Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2025:
Publikationer
Publikationer
Citering:
Versioner
Versioner
Version:
Metadata tillagda:
README-filen har uppdaterats med information om en ny datafil samt med en länk till den publicerade artikeln.Data tillagda:
En ytterligare datafil, ”T2_Data_for_Table_2_mass_TOC_TS_RSH_distribution.tsv”, har lagts till och redovisar den procentuella fördelningen av torrmassa, totalt organiskt kol (TOC), totalt svavel (TS) samt tiolgrupper (RSH) mellan extracellulära och subcellulära fraktioner hos G. sulfurreducens.
Publicerad:
Metadata
Metadata
Versioner
Versioner
Version:
Metadata tillagda:
README-filen har uppdaterats med information om en ny datafil samt med en länk till den publicerade artikeln.Data tillagda:
En ytterligare datafil, ”T2_Data_for_Table_2_mass_TOC_TS_RSH_distribution.tsv”, har lagts till och redovisar den procentuella fördelningen av torrmassa, totalt organiskt kol (TOC), totalt svavel (TS) samt tiolgrupper (RSH) mellan extracellulära och subcellulära fraktioner hos G. sulfurreducens.
Publicerad:
