Gå direkt till huvudinnehåll
Researchdata.se

Data för: Impacts of large herbivores on mycorrhizal fungal communities across the Arctic

https://doi.org/10.5878/zf1c-vz95
Data deponerade i samband med artikel som ska publiceras i tidskriften Ecography. Svamp-DNA extraherades från jordprover insamlade vid betesfria experiment på 15 platser runt Arktis för att utvärdera effekten av stora däggdjursbetare på mykorrhizasvampsamhällen. Datan inkluderar DNA-sekvensläsningar som amplifierats med primerparen ITS1m-LR5 och SSU515fngs-AML2 för långläsning, vilka riktar sig mot generella svampsekvenser respektive arbuskulära mykorrhizor. Sekvenserna har taxonomiskt tilldelats via UNITE-databasen med PlutoF samt MaarjAM-databasen och har klassificerats i svampgillen med hjälp av FUNguild. Arbetsflödet från trimmade, demultiplexerade sekvensläsningar till taxonomisk och funktionell tilldelning finns i R-skriptet "EcographySubmission_SynthesisScript.R". Jordegenskaper, datum för etablering av betesfria områden och generella metadata finns i filen "MetaData.csv", och procentuell täckning av växtfunktionella typer finns för 11 platser i filen "Cover_data.csv". Råa sekvensläsningar har deponerats i Sequence Read Archive (SRA) under titeln "Impacts of large herbivores on mycorrhizal fungal communities across the Arctic".
Ladda ner data och dokumentation (8 filer / 23.72 MiB)

Citering och åtkomst

Metod och utfall

Geografisk täckning

Administrativ information

Ämnesområde och nyckelord

Publikationer

Metadata

dorisgu_sv