Data for: Impacts of large herbivores on mycorrhizal fungal communities across the Arctic
https://doi.org/10.5878/zf1c-vz95
Data deposited in association with article to be published in the journal: Ecography. Fungal DNA was extracted from soil samples collected at herbivore exclosure experiments in 15 sites around the Arctic to evaluate the impact of large mammalian herbivores on mycorrhizal fungal communities. The data includes DNA sequence reads amplified using ITS1m-LR5 and SSU515fngs-AML2 long-read primer pairs targeting general fungal sequences and arbuscular mycorrhizae, respectively. Sequences were taxonomically assigned through the UNITE database using PlutoF, and the MaarjAM database and assigned to fungal guild using FUNguild. The pipeline from trimmed, demultiplexed sequence reads to taxonomic and functional assignment is included in the Rscript "EcographySubmission_SynthesisScript.R". Soil properties, date of exclosure establishment, and general metadata is included in the file "MetaData.csv", and percent plant functional type cover is included for 11 sites in the file "Cover_data.csv".
Raw sequence reads were deposited in the Sequence Read Archive (SRA) under the title "Impacts of large herbivores on mycorrhizal fungal communities across the Arctic".
Download 8 files with open access (23.72 MiB)
Files with open access (8)
Files with open access (8)
Citation and access
Citation and access
Access level:
Creator/Principal investigator(s):
- Oula Kalttopää – Helsingfors Universitet
Research principal:
Data contains personal data:
No
Citation:
Language:
Method and outcome
Method and outcome
Time period(s) investigated:
Species and taxons:
Geographic coverage
Geographic coverage
Geographic description:
The study was conducted at 15 sites across the Arctic tundra: five sites in Sweden (Långfjället, Sonfjället, Ritsem heath, Ritsem meadow, Abisko), four in Finland (Sodankylä, Pallas, Kevo, Kilpisjärvi), two in USA (Toolik Lake, Utqiagvik), two in Canada, one in Iceland (Auðkúluheiði), and one in Russia (Erkuta).
Administrative information
Administrative information
Responsible department/unit:
Department of Earth Sciences
Funding
Funding
Funding agency:
- Vetenskapsrådet
Öppnar nytt fönster hos ror.org.
ROR
Award number:
2018-04202_VR
Award title:
Vikten av trofiska interaktioner för mykorrhiza dynamiken i Arktis
Funding information:
Under det senaste decenniet har bevisen stärkts om att det arktiska landskapet för närvarande genomgår stora förändringar. Förändringar såsom att permafrosten börjat tina upp samtidigt som vegetationen förändras är förmodligen till följd av den pågående klimatförändringen. Fjärranalysstudier har visat att den Arktiska tundran har blivit grönare, men även långtidsobservationer runt om i Arktis visar på en förbuskning av tundran samt att trädgränsen avancerar in i dessa miljöer. Denna förbuskning utgör en av de mest slående klimatstyrda förändringarna i tundravegetationen och har främst hänförts till en ökning av lövfällande buskar, såsom björk, videarter och al. Konsekvenserna av denna ökning av buskar har diskuterats mycket, eftersom dessa buskar väsentligt kan påverka klimatet. Mycket mindre uppmärksamhet har dock ägnats åt det faktum att ett antal studier också har funnit en stark ökning av vintergröna ris också som svar på uppvärmning av klimatet och dessa dvärgbuskar ingår vanligen inte i begreppet förbuskning. De ekologiska konsekvenserna av en förbuskning av vintergröna ris är emellertid markant annorlunda jämfört med högre lövfällande buskar. Till exempel så är risen lägre än många lövfällande buskar vilket påverkar dess förmåga att fånga upp snö samt binda inkommande solvärme. Dessutom producerar de mer svårnedbrytbar förna, vilket kan ge olika effekter på kol- och näringscyklerna med konsekvenser för ekosystemets kollagringskapacitet. Vidare är ett slående evolutionsdrag hos vintergröna buskar att majoriteten tillhör Ericaeae-familjen, som har utvecklat en unik mykorrhiza symbios - Ericoid mycorrhiza. I motsats till de vintergröna buskarna har de flesta lövfällande buskarna en annan symbios - Ectomykorrhiza. Ericoida svamphyfer är mer motståndskraftig mot nedbrytning, så inte bara själva de vintergröna risen utan även deras svampsymbionter kan således bidra till att minska kol- och näringsomsättning. Till exempel har fjällbjörksetablering av kalfjällets rishedar visat på en nettoförlust av kol till atmosfären, eftersom ett skifte från ericoid mykorrhiza mot ektomykorrhiza dominans resulterat i effektivare nedbrytning av markens organiska material. Följaktligen kan en expansion av vintergröna ris motverka den föreslagna ökade kolomsättningen för Arktis och öka i stället kolsekvestrering i marken. Genom att använda en Pan-Arktisk tillvägagångssätt med långtids undersökningar av utestängning av betesdjur på flera områden över Arktis kommer vi att 1) bestämma produktion och omsättning av biomassa av svampmycel i förhållande till bete över Arktis; 2) bestämma hur betet påverkar marksvamp och svampmycelsamhällsdynamik i Arktis, 3) avgränsa marksvamp- och svampmycelsamhällsdynamiken under ericoida- och ektomykorrhiza buskar och separera det "aktiva samhället" som bidrar till mycelproduktionen; och 4) urskilja effekten av ericoida- och ektomykorrhiza buskar på ekosystemets koldynamik. Jag kommer att identifiera nyckelsamband över trofinivåer (från den stora växtätaren till markmikroberna) och testa hur dessa hypoteser håller i ett cirkumpolärt perspektiv.
Funding agency:
- Carl Tryggers foundation
Award number:
CTS 21:1470
Funding agency:
- Academy of Finland
Award number:
315415
Funding agency:
- Russian Ministry of Science and Higher Education program
Award number:
122021000089-9
Funding agency:
- US National Science Foundation
Award number:
DEB-1637459
Funding agency:
- US National Science Foundation
Award number:
OPP-2221133
Funding agency:
- US National Science Foundation
Award number:
OPP-1836861
Funding agency:
- University of Iceland Research Fund
Funding agency:
- Soil Conservation Service of Iceland
Award number:
NÝR-09-2017
Funding agency:
- Soil Conservation Service of Iceland
Award number:
NÝR-14-2018
Funding agency:
- Soil Conservation Service of Iceland
Award number:
NÝR-12-2019
Funding agency:
- The W. Garfield Weston Foundation
Award title:
W. Garfield Weston Award in Northern Research
Funding agency:
- European Union H2020
Award title:
INTERACT III
Topic and keywords
Topic and keywords
Swedish Standard Classification of Research Subjects 2025:
Publications
Publications
Citation:
Brachmann, C. G., Ryberg, M., Furneaux, B. R., Rosling, A., Ou, T., Ekblad, E., Barrio, I. C., Bret-Harte, M. S., Fritze, H., Gough, L., Hollister, R. D., Jónsdóttir, I. S., Kalttopää, O., Lindén, E., Mäkiranta, P., Olofsson, J., Partanen, R., Reid, K. A., Sokolov, A., Abdulmanova, S., Sujuala, M. S., Sundqvist, M., Suominen, O., Tweedie, C. E., Young, A., and Björk, R. G. Impacts of large herbivores on mycorrhizal fungal communities across the Arctic. Ecography [accepted], 2025.
Metadata
Metadata
Version 1
