Data för: Impacts of large herbivores on mycorrhizal fungal communities across the Arctic
https://doi.org/10.5878/zf1c-vz95
Data deponerade i samband med artikel som ska publiceras i tidskriften Ecography.
Svamp-DNA extraherades från jordprover insamlade vid betesfria experiment på 15 platser runt Arktis för att utvärdera effekten av stora däggdjursbetare på mykorrhizasvampsamhällen.
Datan inkluderar DNA-sekvensläsningar som amplifierats med primerparen ITS1m-LR5 och SSU515fngs-AML2 för långläsning, vilka riktar sig mot generella svampsekvenser respektive arbuskulära mykorrhizor.
Sekvenserna har taxonomiskt tilldelats via UNITE-databasen med PlutoF samt MaarjAM-databasen och har klassificerats i svampgillen med hjälp av FUNguild.
Arbetsflödet från trimmade, demultiplexerade sekvensläsningar till taxonomisk och funktionell tilldelning finns i R-skriptet "EcographySubmission_SynthesisScript.R".
Jordegenskaper, datum för etablering av betesfria områden och generella metadata finns i filen "MetaData.csv", och procentuell täckning av växtfunktionella typer finns för 11 platser i filen "Cover_data.csv".
Råa sekvensläsningar har deponerats i Sequence Read Archive (SRA) under titeln "Impacts of large herbivores on mycorrhizal fungal communities across the Arctic".
Datafiler
Datafiler
Dokumentationsfiler
Dokumentationsfiler
Citering och åtkomst
Citering och åtkomst
Tillgänglighetsnivå:
Skapare/primärforskare:
- Oula Kalttopää - Helsingfors Universitet
Forskningshuvudman:
Data innehåller personuppgifter:
Nej
Citering:
Språk:
Metod och utfall
Metod och utfall
Geografisk täckning
Geografisk täckning
Administrativ information
Administrativ information
Ämnesområde och nyckelord
Ämnesområde och nyckelord
Publikationer
Publikationer
Metadata
Metadata
Version 1
