Data (images) for: New barcodes of freshwater diatoms from Sweden
Documentation files
Documentation files
Citation and access
Citation and access
Data access level:
Creator/Principal investigator(s):
Research principal:
Principal's reference number:
- SLU.ma.2025.4.2.IÄ-7
Data contains personal data:
No
Citation:
Language:
Method and outcome
Method and outcome
Time period(s) investigated:
Data format/data structure:
Species and taxons:
Samples/material - Collected from scientific collection/biobank
Samples/material - Collected from scientific collection/biobank
Name:
Type(s) of sample:
Data collection - Biologiska provtagningar
Data collection - Biologiska provtagningar
Mode of collection:
Biologiska provtagningar
Description of the mode of collection:
Kiselalger isolerades från färska prover tagna i samordning med det svenska nationella övervakningsprogrammet under 2019 och 2020. Dessa prover togs enligt den europeiska standarden EN 13946:2025 Vattenundersökningar - Vägledning för provtagning och förbehandling av bentiska kiselalger i vattendrag. Totalt etablerades 273 monoklonala kulturer från enskilda celler med hjälp av mikropipettmetoden. Kulturerna odlades i WC (Guillard och Lorenzen 1972), PM (Stosch och Fecher 1979) eller L16 (Lindström 1991) medium vid rumstemperatur. Fotografier togs från varje levande kultur om möjligt. Kulturerna skördades och sekvenserades därefter, och identifierades parallellt med hjälp av morfologiska karaktärer med hjälp av ljusmikroskopi i ett första steg. Utvalda kulturer studerades också och bilder togs med elektronmikroskopi. Klonerna skördades när biomassan var tillräcklig för alla ytterligare projektrelevanta analyssteg, vilket inkluderade DNA-streckkodssekvensering för rbcL och 18SV4.
Time period(s) for data collection:
2020 - 2021
Data collector:
- Sveriges lantbruksuniversitet
Öppnar nytt fönster hos ror.org.
ROR
Source of the data:
- Forskningsdata
- Biologiska prover
- Övrigt
Geographic coverage
Geographic coverage
Geographic location:
Geographic description:
The diatom material has been sampled from 44 different streams in Sweden, geographically distributed over the country from North to South (58.3475 to 65.4433 WGS84).
Administrative information
Administrative information
Responsible department/unit:
Department of Aquatic Sciences and Assessment
Commissioning organisation:
- Naturvårdsverket
Öppnar nytt fönster hos ror.org.
ROR
Registration number at commissioning organization:
- 18/171
Identifiers
Identifiers
Handle:
Funding
Funding
Funding agency:
- Havs- och Vattenmyndigheten
Öppnar nytt fönster hos ror.org.
ROR
Award number:
18/171
Funding agency:
- Naturvårdsverket
Öppnar nytt fönster hos ror.org.
ROR
Award number:
18/171
