Data (bilder) för: Nya streckkoder för Svenska kiselalger från sötvatten
De publicerade data är bilder av sötvattenskiselalger tagna inom forskningsprojektet FRESHBAR. FRESHBAR var ett av åtta forskningsprojekt med fokus på utveckling av DNA-metoder för nationell miljöövervakning. Projektet har finansierats med medel från Naturvårdsverkets miljöforskningsanslag som finansierar forskning till stöd för Naturvårdsverkets och Havs- och vattenmyndighetens kunskapsbehov. Se vidare under den engelska beskrivningen för mera info.
Gå till källa för data
http://hdl.handle.net/20.500.12703/6968
Dokumentationsfiler
Dokumentationsfiler
Citering och åtkomst
Citering och åtkomst
Tillgänglighetsnivå:
Skapare/primärforskare:
Forskningshuvudman:
Diarienummer hos huvudman:
- SLU.ma.2025.4.2.IÄ-7
Data innehåller personuppgifter:
Nej
Citering:
Språk:
Metod och utfall
Metod och utfall
Tidsperiod(er) som undersökts:
Dataformat/datastruktur:
Arter och taxon:
Prover/material - Nya från vetenskaplig samling/biobank
Prover/material - Nya från vetenskaplig samling/biobank
Namn:
Herbarium Berolinense (B)
Typ(er) av prov:
kiselalger
Datainsamling - Biologiska provtagningar
Datainsamling - Biologiska provtagningar
Insamlingsmetod:
Biologiska provtagningar
Beskrivning av insamlingsmetod:
Kiselalger isolerades från färska prover tagna i samordning med det svenska nationella övervakningsprogrammet under 2019 och 2020. Dessa prover togs enligt den europeiska standarden EN 13946:2025 Vattenundersökningar - Vägledning för provtagning och förbehandling av bentiska kiselalger i vattendrag. Totalt etablerades 273 monoklonala kulturer från enskilda celler med hjälp av mikropipettmetoden. Kulturerna odlades i WC (Guillard och Lorenzen 1972), PM (Stosch och Fecher 1979) eller L16 (Lindström 1991) medium vid rumstemperatur. Fotografier togs från varje levande kultur om möjligt. Kulturerna skördades och sekvenserades därefter, och identifierades parallellt med hjälp av morfologiska karaktärer med hjälp av ljusmikroskopi i ett första steg. Utvalda kulturer studerades också och bilder togs med elektronmikroskopi. Klonerna skördades när biomassan var tillräcklig för alla ytterligare projektrelevanta analyssteg, vilket inkluderade DNA-streckkodssekvensering för rbcL och 18SV4.
Tidsperiod(er) för datainsamling:
2020 - 2021
Datainsamlare:
- Sveriges lantbruksuniversitet
Öppnar nytt fönster hos ror.org.
ROR
Datakälla:
- Forskningsdata
- Biologiska prover
- Övrigt
Geografisk täckning
Geografisk täckning
Geografisk plats:
Geografisk beskrivning:
Kiselalger har provtagits från 44 olika vattendrag i Sverige, geografiskt spridda över landet från norr till söder (58.3475 to 65.4433 WGS84).
Administrativ information
Administrativ information
Ansvarig institution/enhet:
Institutionen för vatten och miljö
Uppdragsgivare:
- Naturvårdsverket
Öppnar nytt fönster hos ror.org.
ROR
Diarienummer hos uppdragsgivare:
- 18/171
Identifierare
Identifierare
Handle:
Finansiering
Finansiering
Finansiär:
- Havs- och Vattenmyndigheten
Öppnar nytt fönster hos ror.org.
ROR
Referensnummer:
18/171
Finansiär:
- Naturvårdsverket
Öppnar nytt fönster hos ror.org.
ROR
Referensnummer:
18/171
Ämnesområde och nyckelord
Ämnesområde och nyckelord
Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2025:
Relationer
Relationer
Är metadata för:
Publikationer
Publikationer
Citering:
Kahlert, M., Mora, D. Kusber, W-H., Abarca, N. & Zimmermann, J. (XXXX) New DNA barcode reference data of freshwater diatoms from Sweden - old acquaintances and new taxa. Environmental DNA. in process
