Gå direkt till huvudinnehåll
Researchdata.se

Data (bilder) för: Nya streckkoder för Svenska kiselalger från sötvatten

FRESHBAR diatom images
De publicerade data är bilder av sötvattenskiselalger tagna inom forskningsprojektet FRESHBAR. FRESHBAR var ett av åtta forskningsprojekt med fokus på utveckling av DNA-metoder för nationell miljöövervakning. Projektet har finansierats med medel från Naturvårdsverkets miljöforskningsanslag som finansierar forskning till stöd för Naturvårdsverkets och Havs- och vattenmyndighetens kunskapsbehov. Se vidare under den engelska beskrivningen för mera info.
Gå till källa för data
http://hdl.handle.net/20.500.12703/6968
Ladda ner dokumentation (5 filer / 5.6 MiB)

Dokumentationsfiler

Citering och åtkomst

Tillgänglighetsnivå:

Skapare/​primärforskare:

Forskningshuvudman:

Diarienummer hos huvudman:

  • SLU.ma.2025.4.2.IÄ-7

Data innehåller personuppgifter:

Nej

Citering:

Licens:

Språk:

Metod och utfall

Tidsperiod(er) som undersökts:

Dataformat/​datastruktur:

Arter och taxon:

Prover/material Nya från vetenskaplig samling/biobank

Namn:

Herbarium Berolinense (B)

Typ(er) av prov:

kiselalger

Datainsamling Biologiska provtagningar

Insamlingsmetod:

Biologiska provtagningar

Beskrivning av insamlingsmetod:

Kiselalger isolerades från färska prover tagna i samordning med det svenska nationella övervakningsprogrammet under 2019 och 2020. Dessa prover togs enligt den europeiska standarden EN 13946:2025 Vattenundersökningar - Vägledning för provtagning och förbehandling av bentiska kiselalger i vattendrag. Totalt etablerades 273 monoklonala kulturer från enskilda celler med hjälp av mikropipettmetoden. Kulturerna odlades i WC (Guillard och Lorenzen 1972), PM (Stosch och Fecher 1979) eller L16 (Lindström 1991) medium vid rumstemperatur. Fotografier togs från varje levande kultur om möjligt. Kulturerna skördades och sekvenserades därefter, och identifierades parallellt med hjälp av morfologiska karaktärer med hjälp av ljusmikroskopi i ett första steg. Utvalda kulturer studerades också och bilder togs med elektronmikroskopi. Klonerna skördades när biomassan var tillräcklig för alla ytterligare projektrelevanta analyssteg, vilket inkluderade DNA-streckkodssekvensering för rbcL och 18SV4.

Tidsperiod(er) för datainsamling:

2020 - 2021

Datainsamlare:

Datakälla:

  • Forskningsdata
  • Biologiska prover
  • Övrigt

Geografisk täckning

Geografisk plats:

Geografisk beskrivning:

Kiselalger har provtagits från 44 olika vattendrag i Sverige, geografiskt spridda över landet från norr till söder (58.3475 to 65.4433 WGS84).

Administrativ information

Ansvarig institution/​enhet:

Institutionen för vatten och miljö

Uppdragsgivare:

Diarienummer hos uppdragsgivare:

  • 18/171

Handle:

20.500.12703/6968

Finansiering

Finansiär:

Referensnummer:

18/171

Finansiär:

Referensnummer:

18/171

Ämnesområde och nyckelord

Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2025:

Nyckelord:

Relationer

Hemsida:

Är metadata för:

Collection Code = [FRESHBAR] i sökfält

Publikationer

Citering:

Kahlert, M., Mora, D. Kusber, W-H., Abarca, N. & Zimmermann, J. (XXXX) New DNA barcode reference data of freshwater diatoms from Sweden - old acquaintances and new taxa. Environmental DNA. in process

Kontakt

Metadata

Version 1
doris
slu
Version 1 publicerad: