Towards Ultimate NMR Resolution with Deep Learning
https://doi.org/10.5878/5xp8-g969
Datamängden innehåller bearbetade lösningstillstånds-protein-NMR-spektra för MALT1 (45 kDa), Azurin (14 kDa) och Tau (ostrukturerat, 45,8 kDa), härledda från experimentellt inspelade 2D- och 3D-data som erhållits i tidigare studier och publicerats tidigare:
(1) DOI: 10.1371/journal.pone.0146496; DOI: 10.1007/s12104-022-10105-3;
(2) DOI: 10.1110/ps.0225403;
(3) DOI: 10.1002/anie.202102758.
All bearbetad data lagras i NMRPipe-format (.ft2- och .ft3-filer) och har genererats med hjälp av standardiserade NMR-bearbetningsprocedurer. Datan kan läsas och visualiseras med programvara som är kompatibel med NMRPipe, såsom NMRPipe (https://www.ibbr.umd.edu/nmrpipe
), Python-paketet nmrglue (https://github.com/jjhelmus/nmrglue
) eller annan programvara som stöder NMRPipe-formatet, inklusive CCPN 3.0 (https://ccpn.ac.uk
) och senare versioner. Dessa bearbetade spektra används som indatafiler för AI-baserade metoder för att förbättra NMR-spektral upplösning.
Dokumentationsfiler
Dokumentationsfiler
Citering och åtkomst
Citering och åtkomst
Tillgänglighetsnivå:
Skapare/primärforskare:
Forskningshuvudman:
Data innehåller personuppgifter:
Nej
Citering:
Språk:
Metod och utfall
Metod och utfall
Tidsperiod(er) som undersökts:
Dataformat/datastruktur:
Datainsamling - Other
Datainsamling - Other
Insamlingsmetod:
Other
Beskrivning av insamlingsmetod:
All processed data were generated in this study using standard NMR processing procedures and are stored in NMRPipe format (.ft2 and .ft3 files). The data are derived from experimentally recorded 2D and 3D solution-state protein NMR spectra of MALT1 (45 kDa), Azurin (14 kDa), and Tau (disordered, 45.8 kDa), obtained in previous studies and published previously:
(1) DOI: 10.1371/journal.pone.0146496; DOI: 10.1007/s12104-022-10105-3;
(2) DOI: 10.1110/ps.0225403;
(3) DOI: 10.1002/anie.202102758
Ämnesområde och nyckelord
Ämnesområde och nyckelord
Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2025:
Relationer
Relationer
Continues:
Continues:
Continues:
Continues:
Publikationer
Publikationer
Citering:
Amir Jahangiri, Tatiana Agback, Ulrika Brath, Vladislav Orekhov, Towards Ultimate NMR Resolution with Deep Learning, arXiv preprint arXiv:2502.20793, 2025
Versioner
Versioner
Version:
2
Metadata added:
Added SHA256 checksums in sha256sums.txtData added:
Added file TA_CaM.zip
Publicerad:
Metadata
Metadata
Versioner
Versioner
Version:
2
Metadata added:
Added SHA256 checksums in sha256sums.txtData added:
Added file TA_CaM.zip
Publicerad:
