Genexpressionsdata från patienter med endokrinresistent bröstcancer
Citering och åtkomst
Citering och åtkomst
Tillgänglighetsnivå:
Skapare/primärforskare:
Forskningshuvudman:
Data innehåller personuppgifter:
Ja
Typ av personuppgifter:
Genetisk data, Hälsodata relaterat till cancerdiagnos
Kodnyckel existerar:
Ja
Data innehåller känsliga personuppgifter:
Ja
Citering:
Språk:
Metod och utfall
Metod och utfall
Population:
Patienter med endokrinresistent bröstcancer i Stockholm, Sverige.
Studiedesign:
- Experimentell studie
Beskrivning av studiedesign:
Patienter med endokrinresistent bröstcancer i Stockholm, Sverige. RNA erhölls från patienters primär- och recidivtumörer. RNA extraherades från formalinfixerat, paraffininbäddat tumörmaterial och analyserades med Affymetrix Clariom D Microarray. Preprocessning utfört i Transcriptome Analysis Console med SST-RMA metod.
Beskrivning av urval:
Retrospektivt urval av patienter med endokrinresistent bröstcancer diagnosticerad i Stockholm, Sverige. Primär- och recidivtumörer från samma patient identifierades via informationssystem vid Karolinska Universitetssjukhuset, Stockholm, Sverige.
Antal individer/objekt:
3
Dataformat/datastruktur:
Prover/material - Befintliga från vetenskaplig samling/biobank
Prover/material - Befintliga från vetenskaplig samling/biobank
Namn:
Typ(er) av prov:
Geografisk täckning
Geografisk täckning
Geografisk plats:
Administrativ information
Administrativ information
Ansvarig institution/enhet:
Institutionen för onkologi-patologi
Medverkande:
Etikprövning:
Stockholm - 2015/1768-31/2
Finansiering
Finansiering
Finansiär:
- Vetenskapsrådet
Öppnar nytt fönster hos ror.org.
RORÖppnas i en ny tabb
Referensnummer:
2023-03009_VR
Projektnamn på ansökan:
Vilka faktorer påverkar den långsiktiga risken för bröstcancerpatienter med hormonkänslig sjukdom att få återfall och dö
Information om finansiering:
Bröstcancer är en heterogen sjukdom med varierande spridningsförmåga och tid till eventuell spridning. De flesta kvinnor diagnosticeras med hormonkänslig cancer, vilket betyder att tumören är beroende av östrogen för att växa. Anti-hormonell behandling är en mycket viktig del i det kliniska omhändertagandet för dessa kvinnor men också en källa till lidande pga biverkningar speciellt hos yngre kvinnor med en högre risk att avlida i sjukdomen. Vi och andra forskare har visat att kvinnor med hormonkänslig cancer har en långsiktig risk att insjukna i spridd obotlig sjukdom, ibland flera decennier efter diagnos, och att endast hälften har nytta av anti-hormonell behandling. Sjukdomsmekanismerna bakom detta är dock inte klarlagda, vilket är en klinisk utmaning, då det är nödvändigt att kunna förutsäga långsiktig risk för individanpassad behandling. Vi kommer därför att undersöka vilka tumöregenskaper, både kliniskt använda och nydanande, samt intra-tumör heterogenitet, dvs tumörceller med motsatta egenskaper inom samma tumör, som påverkar långsiktig risk. Detta genom att på ett unikt sätt i stora kliniska bröstcancerstudier med lång uppföljning och detaljerad tumörbiologisk information jämföra tumöregenskaper hos kvinnor som har dött av sin sjukdom och kvinnor som har överlevt. Vi kommer att använda oss av nydanande metoder för bildanalys med djupinlärning och samtidig analys av ett större antal proteiner såkallad multiplex analys. Vårt projekt avser att ge ökad kunskap kring mekanismerna bakom långsiktig risk genom att identifiera tumöregenskaper som förutsäger vilka som har en hög risk att dö av sin sjukdom samt patienter som har långsiktig, övergående eller ingen nytta av anti-hormonell behandling. Analyserna sker i nära tvärvetenskapligt samarbete, och kan få betydelse för förbättrad information till kvinnor med bröstcancer, för möjligheten att planera kliniska prövningar för att minska sena återfall, och för planeringen av återbesök efter bröstcancerbehandling.
Ämnesområde och nyckelord
Ämnesområde och nyckelord
Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2025:
Publikationer
Publikationer
Citering:
ISBN:
9789180179720
