Gå direkt till huvudinnehåll

Longitudinell multiomisk karakterisering av patientsvar på neoadjuvant HER2-riktad behandling

https://doi.org/10.48723/js80-sx29
Denna datauppsättning innehåller longitudinella multiomiska profiler härledda från patienter med tidig HER2-positiv bröstcancer som deltog i den randomiserade fas II-studien PREDIX HER2 (NCT02568839). Studien jämförde neoadjuvant behandling med docetaxel, trastuzumab och pertuzumab (DHP) jämfört med trastuzumab emtansin (T-DM1). Det primära syftet med denna datainsamling var att övervaka tumörutveckling och tumörmikromiljödynamik under HER2-riktad behandling. Datamaterial och insamling: Datumuppsättningen omfattar multiomiska data från patientprover som samlats in vid olika tidpunkter: under behandling (efter två cykler av neoadjuvant behandling) och efter behandling (efter sex cykler av neoadjuvant behandling). Metod och analys: Omfattande molekylär karakterisering utfördes med hjälp av flera högkapacitetstekniker. Detta inkluderar hel-exomsekvensering (WES) för att identifiera somatiska mutationer och genomiska förändringar, RNA-sekvensering (RNA-seq) för bulktranskriptomisk profilering och proteomik för att övervaka proteinmängd. Dessutom utfördes avbildningsbaserad spatial transkriptomik med hjälp av Xenium In Situ-plattformen för att kartlägga den rumsliga organisationen av tumörmikromiljön; observera att Xeniums rumsliga data exklusivt är tillgängliga för tidpunkten för behandling.

Filer med öppen tillgång (2)

Citering och åtkomst

Metod och utfall

Administrativ information

Etikprövning

Finansiering

Ämnesområde och nyckelord

Relationer

Kontakt

Metadata

doriski