Simulated ancient metagenomic ground truth dataset used for aMeta publication
https://doi.org/10.17044/SCILIFELAB.21261405
This is a simulated ancient metagenomic dataset used for benchmarking the anciemt microbiome profiling workflow aMeta against Heuristic Operations for Pathogen Screening (HOPS), see link under references. The dataset was simulated using gargammel software, see link under references. Both ancient and modern reads were simulated, sequencing errors and Illumina adapters were added. The simulated datase was built by Nikolay Oskolkov, Lund University, Sweden, within the NBIS SciLifeLab long-term support project, PI Anders Götherström, Centre for Palaeogenetics, Stockholm, Sweden.
Gå till källa för data
Öppnas i en ny tabbhttps://doi.org/10.17044/SCILIFELAB.21261405
Citering och åtkomst
Citering och åtkomst
Skapare/primärforskare:
Forskningshuvudman:
Citering:
Administrativ information
Administrativ information
Finansiering
Finansiering
Finansiär:
- Knut and Alice Wallenberg Foundation
Öppnar nytt fönster hos ror.org.
RORÖppnas i en ny tabb
Ämnesområde och nyckelord
Ämnesområde och nyckelord
Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2025:
Nyckelord:
- Bioinformatic methods development
Relationer
Relationer
Är ett komplement till:
Metadata
Metadata
