Allel-specific read counts for sprat population samples used in "Limited parallelism in genetic adaptation to brackish water bodies in European sprat and Atlantic herring"
https://doi.org/10.17044/SCILIFELAB.25836238
"Sprat_DeDup_v2_HiC.fasta.gz" contians the draft genome used in the study, in FASTA format. It is the version upon the SNPs (single nucleotide polymorphisms) described have been called.
"Sprat_pool_AD_DeDup_v2_PASS.txt.gz" contains tab-separated allele counts, as output using the "--counts" option in vcftools, from pool re-sequencting of the samples used in the study. Please see the corresponding supplementary information for sample codes etc. These counts underly the frequencies used throughout the study.
Gå till källa för data
https://doi.org/10.17044/SCILIFELAB.25836238
Citering och åtkomst
Citering och åtkomst
Skapare/primärforskare:
- María Quintela
- François Besnier
- Qiaoling Deng
- Cecilie Kvamme
- Dorte Bekkevold - Technical University of Denmark
- Mai-Britt Mosbech
- Ignas Bunikis
- Roger Lille-Langøy
- Iole Leonori
Forskningshuvudman:
Citering:
Administrativ information
Administrativ information
Finansiering
Finansiering
Finansiär:
- The Research Council of Norway
Öppnar nytt fönster hos ror.org.
ROR
Referensnummer:
299554
Projektnamn på ansökan:
Strategic initiatives at the Institute of Marine Research
Finansiär:
- Swedish Research Council
Öppnar nytt fönster hos ror.org.
ROR
Referensnummer:
2017-02907_VR
Projektnamn på ansökan:
The genetics of biodiversity
Ämnesområde och nyckelord
Ämnesområde och nyckelord
Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2025:
Nyckelord:
- Biological adaptation
- Genomics
Relationer
Relationer
Är ett komplement till:
Är härledd från:
Metadata
Metadata
