Spatial metatranscriptomics resolves host-bacteria-fungi interactomes, Source Data
https://doi.org/10.5281/zenodo.8308137
Source Data for a publication: Spatial metatranscriptomics resolves host-bacteria-fungi interactomes.
Includes the data sets to generate the results.
Contains five different experiment types:
- Pst bacterial infiltration experiment
- Enrichment experiment with different array types
- Comparison between SmT vs. Amp-seq
- Outdoor-grown leaf experiments
- Sterile leaf experiment
For each of the experiments are included (if generated, see the README file):
- Gene count matrices
- Microbial taxa count matrices
- Bright field images
- Alignment files (Spot files)
- Putative microbial reads and related probe information
- Data for enrichment analysis
- Fluorescent images and corresponding fluorescent values
Gå till källa för data
Öppnas i en ny tabbhttps://doi.org/10.5281/zenodo.8308137
Citering och åtkomst
Citering och åtkomst
Tillgänglighetsnivå:
Skapare/primärforskare:
- Carlos, Vanessa - Max Planck Institute for Biology Tübingen, Tübingen, Germany
Forskningshuvudman:
Citering:
Språk:
Administrativ information
Administrativ information
oai:
oai:zenodo.org:8308137
Ämnesområde och nyckelord
Ämnesområde och nyckelord
Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2025:
Nyckelord:
- Spatial Transcriptomics
- Spatial metaTranscriptomics
- Transcriptomics
- Microbe
- Host-microbe interactions
Relationer
Relationer
Är publicerad i:
Är publicerad i:
Är version av:
Metadata
Metadata
