Data for: Proteomics reveal biomarkers for diagnosis, disease activity and long-term disability outcomes in multiple sclerosis
https://doi.org/10.48360/jcps-gw67
Koncentrationen av 1463 proteiner mättes med hjälp av Olink Explore-plattformen som använder Proximity Extension Assay (PEA) teknologi. Proteinerna är förvalda från fyra Olink-paneler: Explore 384 Cardiometabolic, Explore 384 Inflammation, Explore 384 Neurology och Explore 384 Oncology. Proteinernas koncentrationer anges som Olinks relativa proteinmängdsenhet på log2-skalan: Normalized Protein Expression (NPX). NPX-värdena normaliserades (intensity normalization) av Olink. Proteinhalten mättes i ryggvätskeprov (n = 186) och plasmaprov (n = 165) från personer med multipel skleros och friska kontroller.
Datasetet publicerades ursprungligen i DiVA och flyttades till SND 2024.
Filer med öppen tillgång (1)
Filer med öppen tillgång (1)
Citering och åtkomst
Citering och åtkomst
Åtkomstnivå:
Skapare/primärforskare:
- Mika Gustafsson – Linköpings universitet - Institutionen för fysik, kemi och biologi
Forskningshuvudman:
Data innehåller personuppgifter:
Ja
Typ av personuppgifter:
Datan är pseudonymiserad och innehåller information om prover är från personer med MS eller friska kontroller, och ålder och kön på dessa personer.
Kodnyckel existerar:
Ja
Data innehåller känsliga personuppgifter:
Ja
Citering:
Språk:
Metod och utfall
Metod och utfall
Population:
Ryggvätskeprov (CSF) och plasmaprov togs från 92 personer med CIS eller RRMS vid Linköpings universitetssjukhus, Sverige, och 51 personer med CIS eller RRMS vid Karolinska Universitetssjukhuset, Sverige. Alla uppfyllde de reviderade McDonald-kriterierna från 2010 och 2017 för CIS eller multipel skleros (MS). Åldersmatchade friska kontroller (HC) rekryterades från friska blodgivare (23 vid Linköpings universitetssjukhus och 20 vid Karolinska Universitetssjukhuset).
Tidsdimension:
Studiedesign:
- Observationsstudie
- Fall-kontrollstudie
Dataformat/datastruktur:
Administrativ information
Administrativ information
Övriga forskningshuvudmän:
Etikprövning
Etikprövning
Utförare:
- Linköping etikprövningsnämnd
Diarienummer:
2017/288-31
Utförare:
- Linköping etikprövningsnämnd
Diarienummer:
2016/305-32
Utförare:
- Stockholms etikprövningsnämnd
Diarienummer:
2022-03650-02
Utförare:
- Linköping etikprövningsnämnd
Diarienummer:
2013/155-32
Utförare:
- Linköping etikprövningsnämnd
Diarienummer:
2016/304-32
Utförare:
- Linköping etikprövningsnämnd
Diarienummer:
2014/311-31
Finansiering
Finansiering
Finansiär:
- European Union's Marie Sklodowska-Curie
Finansiär:
- Swedish Brain Foundation
Finansiär:
- Swedish Foundation for Strategic Research
Finansiär:
- Knut and Alice Wallenberg Foundation
Finansiär:
- Margareth AF Ugglas Foundation
Finansiär:
- Vetenskapsrådet
Finansiär:
- Swedish Knowledge Foundation
Finansiär:
- Medical Research Council of Southeast Sweden
Finansiär:
- NEURO Sweden
Finansiär:
- ALF grants
Finansiär:
- Region Östergötland
Finansiär:
- Swedish Foundation for MS Research
Ämnesområde och nyckelord
Ämnesområde och nyckelord
Ämnesklassificering enligt CESSDA:
Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2025:
Nyckelord:
Relationer
Relationer
Publikationer
Publikationer
Citering:
Åkesson, J., Hojjati, S., Hellberg, S., Raffetseder, J., Khademi, M., Rynkowski, R., … Gustafsson, M. (2023). Proteomics reveal biomarkers for diagnosis, disease activity and long-term disability outcomes in multiple sclerosis. Nature Communications, 14(1). https://doi.org/10.1038/s41467-023-42682-9
