Data för Freshwater mollusc community screening - classical and eDNA monitoring to detect rare, indicator and invasive species
Uppgifterna tillhör studien Freshwater mollusc community screening - classical and eDNA monitoring methods to detect rare, indicator and invasive species. Tabeller och figurer representerar i detalj resultat från provorterna för 15 svenska sjöar och älvar. Studien fokuserade på planktonprover och två sorters sedimentprover (Kick-net och M42 metoden) vid två provtagningstillfällen (vår och höst). Arter hittades genom a) klassiska morfologiska studier där sötvattensmollusker bestämdes för hand med ett stereolupe; b) med streckkodning av cytochrome c oxidase subunit I (COI) och c) genom eDNA metabarcoding analys (Illumina sekvensering). Huvudfokus låg på ärtmusslor, men även andra bentiska sötvattensmollusker och organismer kunde påvisas. COI streckkodsdata analyserades för ett streckkodsträd med software MEGA version 11.0.13 (https://www.megasoftware.net/Öppnas i en ny tabb) (Stecher et al., 2020). Metabarcoding data analyserades med software Apscale pipeline (https://github.com/DominikBuchner/apscaleÖppnas i en ny tabb, Buchner et al., 2022).
Datafiler
Datafiler
Dokumentationsfiler
Dokumentationsfiler
Citering och åtkomst
Citering och åtkomst
Metod och utfall
Metod och utfall
Datainsamling - Fältexperiment
Datainsamling - Fältexperiment
Geografisk täckning
Geografisk täckning
Administrativ information
Administrativ information
Ämnesområde och nyckelord
Ämnesområde och nyckelord
Relationer
Relationer
Publikationer
Publikationer
Metadata
Metadata
