Data för Freshwater mollusc community screening - classical and eDNA monitoring to detect rare, indicator and invasive species

Uppgifterna tillhör studien Freshwater mollusc community screening - classical and eDNA monitoring methods to detect rare, indicator and invasive species. Tabeller och figurer representerar i detalj resultat från provorterna för 15 svenska sjöar och älvar. Studien fokuserade på planktonprover och två sorters sedimentprover (Kick-net och M42 metoden) vid två provtagningstillfällen (vår och höst). Arter hittades genom a) klassiska morfologiska studier där sötvattensmollusker bestämdes för hand med ett stereolupe; b) med streckkodning av cytochrome c oxidase subunit I (COI) och c) genom eDNA metabarcoding analys (Illumina sekvensering). Huvudfokus låg på ärtmusslor, men även andra bentiska sötvattensmollusker och organismer kunde påvisas. COI streckkodsdata analyserades för ett streckkodsträd med software MEGA version 11.0.13 (https://www.megasoftware.net) (Stecher et al., 2020). Metabarcoding data analyserades med software Apscale pipeline (https://github.com/DominikBuchner/apscale, Buchner et al., 2022).