Antibiotikaresistens i kommensala E. coli-bakterier, samt gårdskaraktäristika, på vietnamesiska kycklinggårdar
https://doi.org/10.5878/d9ck-bd78
För att öka förståelsen för antibiotikaresistenssituationen i små- och medelskalig kycklinguppfödning i Vietnam, har en studie genomförts på 305 kycklinggårdar i Thai Nguyen-provinsen, norra Vietnam. Studien presenterar data gällande resistens i kommensala E. coli-bakterier från friska kycklingar/höns (3 per gård). Totalt analyserades 764 E. coli-isolat för resistens mot 15 antibiotikasubstanser från 11 antibiotikaklasser. Data om multiresistens genererades också.
En enkätbaserad studie genomfördes vid samma gårdsbesök (datasetet, och relaterad artikel, redan publicerade - se relaterad resurs). I den tidigare publicerade studien undersöktes kycklinguppfödarnas praktik och kunskap relaterad till antibiotikaresistens, samt allmänna gårdskaraktäristika. Kunskap och praktik utvärderades med en statistisk metod som heter item response theory (IRT), läs mer om denna metod i tidigare publikation (relaterad resurs).
Vissa av variablerna från det tidigare publicerade datasetet är inkluderade även i detta dataset då den aktuella studiens syfte innefattade att leta efter associationer mellan bönders kunskap och praktik, samt gårdskaraktäristika, och förekomst av antibiotikaresistens.
Datasetet består av 765 rader och 37 kolumner. Variabelnamn och svar är kodade och beskrivning av dessa finns i en separat fil, "Chicken_farm_AMR_Vietnam_2025_explanations". Vissa av de återanvända variablerna har döpts om under databearbetningensprocessen i denna studie. För enklare jämförelse av dataseten så är både de gamla och nya variabelnamnen inkluderade i beskrivningsfilen. Enkäten som användes vid gårdsbesöken kan hittas i databeskrivningen som är publicerad sedan tidigare (se relaterade resurser).
Dokumentationsfiler
Dokumentationsfiler
- Chicken_farm_AMR_Vietnam_2025_explanations.xlsx14.97 KiB
Citering och åtkomst
Citering och åtkomst
Tillgänglighetsnivå:
Skapare/primärforskare:
Forskningshuvudman:
Diarienummer hos huvudman:
- SLU.kv.2023.4.4.IÄ-4
Data innehåller personuppgifter:
Ja
Typ av personuppgifter:
Pseudonymiserad data. Datasetet innehåller id-nummer som via en kodnyckel kan kopplas till koordinater för de besökta gårdarna.
Kodnyckel existerar:
Ja
Citering:
Språk:
Metod och utfall
Metod och utfall
Population:
Små- och medelskaliga kycklingproducenter, i Thai Nguyen-provinsen, Vietnam, samt kycklingar hos dessa producenter.
Tidsdimension:
Studiedesign:
- Tvärsnittsstudie
- Observationsstudie
Urvalsmetod:
Beskrivning av urval:
Ett urval på 300 gårdar totalt ansågs tillräckligt för studiens syfte, och distribuerades jämnt mellan två kategorier av gårdsstorlekar (småskaliga och medelskaliga, med 20-49 respektive 100-499 kycklingar).
Listor på hushåll som höll kycklingar i ovanstående omfattning samlades in från de lokala myndigheterna i Thai Nguyen-provinsen (sub-Department of Animal Health (sub-DAH)). För att undvika en över- eller underrepresentation av ett distrikt, stratifierades urvalet baserat på proportionen av gårdar inom varje storlekskategori per distrikt.
Två urvalsramar per distrikt, en för varje storlekskategori, skapades från de erhållna listorna. Av logistiska skäl togs byar med färre än fem hushåll totalt bort från urvalsramarna. Det stratifierade urvalet gjordes sedan med ett web-baserat randomiseringsverktyg (randomizer.org). Om ett hushåll av någon anledning behövde ersättas, valdes en gård så nära ursprungsgården som möjligt som uppfyllde kriterierna.
På varje gård valdes 3 kycklingar slumpmässigt ut för provtagning (kloaksvabb). Om flera ålderskategorier av kycklingar/höns fanns på gården så provtogs kycklingar/höns från den äldsta ålderskategorin.
Tidsperiod(er) som undersökts:
Variabler:
37
Antal individer/objekt:
764
Svarsfrekvens/deltagarfrekvens:
100%
Arter och taxon:
Datainsamling - Personlig intervju
Datainsamling - Personlig intervju
Insamlingsmetod:
Personlig intervju
Beskrivning av insamlingsmetod:
Datainsamlingen skedde ansikte mot ansikte via ett strukturerat frågeformulär.
Tidsperiod(er) för datainsamling:
2021-11-25 - 2022-01-20
Datainsamlare:
- International Livestock Research Institute
Öppnar nytt fönster hos ror.org.
ROR
Datakälla:
- Befolkningsgrupp
Instrument
Instrument
Namn:
Netigate
Typ:
Tekniskt/-a instrument
Beskrivning av instrument:
Webbaserad plattform för enkätdistribution och datainsamling
Datainsamling - Fysiska mätningar och tester
Datainsamling - Fysiska mätningar och tester
Insamlingsmetod:
Fysiska mätningar och tester
Beskrivning av insamlingsmetod:
Kloaksvabbar från 3 kycklingar/höns på varje gård
Tidsperiod(er) för datainsamling:
2021-11-25 - 2022-01-20
Datainsamlare:
- International Livestock Research Institute
Öppnar nytt fönster hos ror.org.
ROR
Datakälla:
- Biologiska prover
Instrument
Instrument
Namn:
Typ:
Tekniskt/-a instrument
Datainsamling - Fysiska mätningar och tester
Datainsamling - Fysiska mätningar och tester
Insamlingsmetod:
Fysiska mätningar och tester
Beskrivning av insamlingsmetod:
Antibiotikaresistenstestning via mikrodilution
Tidsperiod(er) för datainsamling:
2023-01-24 - 2023-11-02
Datainsamlare:
- Sveriges lantbruksuniversitet
Öppnar nytt fönster hos ror.org.
ROR
Datakälla:
- Biologiska prover
Instrument
Instrument
Namn:
Thermofisher EUVSEC3 mikrodilution platta
Typ:
Tekniskt/-a instrument
Beskrivning av instrument:
Platta för testning av antibiotikaresistens i Salmonella eller E. coli bakterier via mikrodilution.
Geografisk täckning
Geografisk täckning
Geografisk plats:
Geografisk beskrivning:
Tre distrikt: Thai Nguyen City, Dong Hy och Vo Nhai, i Thai Nguyen-provinsen, norra Vietnam.
Administrativ information
Administrativ information
Ansvarig institution/enhet:
Institutionen för kliniska vetenskaper
Finansiering
Finansiering
Finansiär:
- Forskningsrådet för Miljö, Areella Näringar och Samhällsbyggande
Öppnar nytt fönster hos ror.org.
ROR
Referensnummer:
2018-01093_3
Projektnamn på ansökan:
Begränsa spridningen av antibiotikaresistens i en föränderlig global djurhållning
