Gå direkt till huvudinnehåll

Data från immunosupprimerade individer vaccinerade med SARS-CoV-2-vacciner: antikroppstitrar, sekvensering av B-cellsreceptorrepertoar och immunfenotypning av B-celler

https://doi.org/10.48723/bbag-t656
Datasetet innehåller B-cellsreceptor (BCR) sekvenseringsdata. Två typer av data ingår: Antigenspecifika BCR-sekvenser framtagna genom sortering av B-celler (CD19+, CD20+, IgG+, IgM-, Spike+) följt av PCR och Sanger-sekvensering för SARS-CoV-2. Sekvenserna tillhandahålls per individ samt som en kombinerad dataset. Bulk BCR-repertoire sekvensering för IgM och IgG, med en FASTQ-fil per individ och prov. Alla sekvenser tillhandahålls som FASTQ- eller FASTA-filer. Användare behöver realignera och reannotera VDJ-segment med sitt val av referensdatabas och programvara. Mer information om experimentell design och sorteringsstrategi finns i den publicerade artikeln: DOI 10.1002/cti2.70077 Inga direkta identifierare ingår; prov-ID är pseudonymiserade. Datasetets storlek är ca 30 GB.

Citering och åtkomst

Metod och utfall

Prover/material Nya från vetenskaplig samling/biobank

Geografisk täckning

Administrativ information

Finansiering

Ämnesområde och nyckelord

Publikationer

Kontakt

Metadata

doriski