Data och kod för "The potential of semiochemical blends to monitor saproxylic beetle communities"

Den här mappen innehåller data och kod till artikeln ”The potential of semiochemical blends to monitor saproxylic beetle communities” av Viktor Gårdman, Bo Aulin, Mikael A. Molander & Mats Jonsell. Rådatan härstammar från jordbruksverkets övervakning av vedlevande skalbaggar vid Sveriges hamnar. Skalbaggarna samlas in med crosstraps betade med en av tre feromonblandningar. Detta har gjorts mellan 2017-2023 (exklusive 2022) vid tre olika hamnar i södra Sverige: Göteborg (57,7017° N, 11,9479° E), Mönsterås (57,0416° N, 16,4431° E) och Norrköping (58,5877° N, 16,1924° E). Alla registrerade arter av vedlevande vivlar (Curculionidae) (inklusive barkborrar (Scolytinae)), långhorningar (Cerambycidae) och praktbaggar (Buprestidae) har räknats till individantal. Datan anger individantal av varje art per månad, år, hamn, feromonblandning och antal fällor som använts. Datainsamlingen har utförts av Jordbruksverket i syfte att kartlägga den potentiella införseln av vedlevande skadegörare genom timmerimport till svenska hamnar. Identifieringen av skalbaggarna har gjorts av experter vid Sveriges lantbruksuniversitet. Alla datafiler är .csv-filer. Observera att fler typer av feromonblandningar eller andra lockmedel har använts i andra fällor på samma platser, och att fler platser har övervakats under åren. Uppgifterna här är endast från konsekvent använda platser och blandningar mellan 2017-2023. För fullständiga uppgifter om fångster av skalbaggar från alla provtagningslokaler och beten, kontakta Jordbruksverket (https://jordbruksverket.seÖppnas i en ny tabb). SpeciesMatrix innehåller rådata av individer som provtagits per art och månad, år, hamn och feromonblandning. Antalet fällor som användes vid varje tillfälle anges också. Data kring vilka trädslag arterna lever av (filen ”TreeHost”) hämtades från ArtDatabanken (SLU ArtDatabanken, https://artfakta.seÖppnas i en ny tabb). Mappen GLMM_Species_Modified innehåller individuella .csv filer för varje art som valts ut för individuella analyser med individalantal för varje kombination av år, månad, hamn och bete. Även information om antalet fällor per fångstillfälle anges. Hamnar, år eller beten med noll fynd för varje art har tagits bort. Syftet med detta är att undvika zero-inflation i modellerna. GLMM_Species_Modified innehåller alltså filerna som används för att köra GLMM-modellerna. SSOS filen innehåller alla vedlevande vivlar, barkborrar, långhorningar och praktbaggar som rapporterats från Artportalen i en 10x10km ruta kring varje hamn mellan 2017-2023 (https://www.artportalen.seÖppnas i en ny tabb). Alla analyser är utförda i R version 4.4.0 och presenteras via Rmarkdown.