SweGen: en kartläggning av den genetiska variationen hos 1000 svenska individer
SweGen är ett dataset som innehåller information om den genetiska variationen hos 1000 svenska individer, baserat på helgenomsekvensering. Datat är tänkt att användas som en generell resurs för forskare och kliniskt verksamma.
DNA från blodprover helgenomsekvenserades med Illumina's X Ten instrument hos SciLifeLab Uppsala och SciLifeLab Stockholm. Sekvensdata analyserades med GATK's verktyg för inpassning och variantdetektion för att skapa ett dataset med genetiska frekvenser. För mer information, se: https://www.nature.com/articles/ejhg2017130Öppnas i en ny tabb
Gå till källa för data
Öppnas i en ny tabbhttps://swefreq.nbis.se
Citering och åtkomst
Citering och åtkomst
Tillgänglighetsnivå:
Skapare/primärforskare:
- Ulf Gyllensten - Uppsala universitet - Institutionen för immunologi, genetik och patologi
Forskningshuvudman:
Data innehåller personuppgifter:
Nej
Citering:
Språk:
Metod och utfall
Metod och utfall
Population:
1000 individer som representerar ett tvärsnitt av den svenska populationen
Studiedesign:
- Observationsstudie
Antal individer/objekt:
1000
Dataformat/datastruktur:
Datainsamling - Registerutdrag och/eller tillgång till prov i biobank
Datainsamling - Registerutdrag och/eller tillgång till prov i biobank
Insamlingsmetod:
Registerutdrag och/eller tillgång till prov i biobank
Datakälla:
- Biologiska prover
Administrativ information
Administrativ information
Ansvarig institution/enhet:
Institutionen för immunologi, genetik och patologi
Ämnesområde och nyckelord
Ämnesområde och nyckelord
Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2025:
Nyckelord:
Relationer
Relationer
Publikationer
Publikationer
Citering:
Ameur A, Dahlberg J, Olason P, Vezzi F, Karlsson R, Martin M, Viklund J,
Kähäri AK, Lundin P, Che H, Thutkawkorapin J, Eisfeldt J, Lampa S, Dahlberg M,
Hagberg J, Jareborg N, Liljedahl U, Jonasson I, Johansson Å, Feuk L, Lundeberg J,
Syvänen AC, Lundin S, Nilsson D, Nystedt B, Magnusson PK, Gyllensten U. SweGen: a
whole-genome data resource of genetic variability in a cross-section of the
Swedish population. Eur J Hum Genet. 2017 Nov;25(11):1253-1260, doi:10.1038/ejhg.2017.130
Metadata
Metadata
Version 1
