Datauppsättning från konfokalmikroskopi av växtprover – ”High throughput”-karakterisering av kortikala mikrotubuli-nätverks svar på mekanisk stress.
Dokumentationsfiler
Dokumentationsfiler
Citering och åtkomst
Citering och åtkomst
Tillgänglighetsnivå:
Skapare/primärforskare:
Forskningshuvudman:
Diarienummer hos huvudman:
- SLU.genfys.2023.4.4.IÄ-2
Data innehåller personuppgifter:
Nej
Citering:
Språk:
Metod och utfall
Metod och utfall
Dataformat/datastruktur:
Arter och taxon:
Datainsamling - Recording
Datainsamling - Recording
Insamlingsmetod:
Recording
Beskrivning av insamlingsmetod:
Confocal microscope time series images of hypocotyls (every 20 minutes during 4 hours) were taken on microtubules reporter lines
Datakälla:
- Research data
- Biological samples
Tidsupplösning:
20 minute
Prov
Prov
Namn/benämning:
Beskrivning av prov:
Fluorophore fused to a microtubule binding domain from the Microtubule Associated Protein 4 (MAP4). (Marc et al., 1998) DOI: 10.1105/tpc.10.11.1927
Namn/benämning:
Beskrivning av prov:
GFP-MBD line crossed with bot1-7 a katanin mutant with impaired rearrangement of microtubules. (Uyttewaal et al., 2012) DOI: 10.1016/j.cell.2012.02.048
Namn/benämning:
Beskrivning av prov:
GFP fused to a tubulin subunit. (Ueda et al., 1999) https://doi.org/10.1007/BF01279267
Namn/benämning:
Beskrivning av prov:
Fluorophore fused to a microtubule binding domain from the Microtubule Associated Protein 4 (MAP4). (Armezzani et al., 2018) DOI: 10.1242/dev.162255
Instrument
Instrument
Namn:
confocal microscope Zeiss LSM800
Beskrivning av instrument:
Upright confocal microscope from Zeiss
Administrativ information
Administrativ information
Ansvarig institution/enhet:
Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi
Finansiering
Finansiering
Finansiär:
- Swedish Research Council
Opens a new window at ror.org.
ROR
Referensnummer:
2020-03974
Projektnamn på ansökan:
Mechanics and dynamics of cell-to-cell adhesion in plants
Information om finansiering:
Mekanik och dynamik av cell till cell adhesion i växter
Finansiär:
- Bio4Energy
Finansiär:
- Knut and Alice Wallenberg Foundation
Opens a new window at ror.org.
ROR
Referensnummer:
KAW 2016.0352
Finansiär:
- Knut and Alice Wallenberg Foundation
Opens a new window at ror.org.
ROR
Referensnummer:
KAW 2016.0341
Finansiär:
Referensnummer:
2016-00504
Projektnamn på ansökan:
UPSC Centre for Forest Biotechnology
Information om finansiering:
UPSC Centrum för Skogsbioteknik (UPSC)
Ämnesområde och nyckelord
Ämnesområde och nyckelord
Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2025:
Nyckelord:
Relationer
Relationer
Is derived from:
Is referenced by:
Versioner
Versioner
Version:
File conversion:
Repackage data files so files for each genotype are in a separate zip file, rather than everything in one very large zip file.Data added:
Added "Pavement cells.zip", update documentation file ReadMe_Experiment settings.txt and metadata. The first version of the data set contained images from time series experiment of acquired on hypocotyls of cortical microtubules reporter either with few or no ablated cells. The second version contains additional images of a time serie experiment on one cotyledon from a microtubule reporter line after ablating a few cells.
Publicerad:
Metadata
Metadata
Versioner
Versioner
Version:
File conversion:
Repackage data files so files for each genotype are in a separate zip file, rather than everything in one very large zip file.Data added:
Added "Pavement cells.zip", update documentation file ReadMe_Experiment settings.txt and metadata. The first version of the data set contained images from time series experiment of acquired on hypocotyls of cortical microtubules reporter either with few or no ablated cells. The second version contains additional images of a time serie experiment on one cotyledon from a microtubule reporter line after ablating a few cells.
Publicerad:
