Data (bilder) för: Nya streckkoder för Svenska kiselalger från sötvatten
De publicerade data är bilder av sötvattenskiselalger tagna inom forskningsprojektet FRESHBAR. FRESHBAR var ett av åtta forskningsprojekt med fokus på utveckling av DNA-metoder för nationell miljöövervakning. Projektet har finansierats med medel från Naturvårdsverkets miljöforskningsanslag som finansierar forskning till stöd för Naturvårdsverkets och Havs- och vattenmyndighetens kunskapsbehov. Se vidare under den engelska beskrivningen för mera info.
Gå till källa för data
http://hdl.handle.net/20.500.12703/6968
Citering och åtkomst
Citering och åtkomst
Åtkomstnivå:
Skapare/primärforskare:
Forskningshuvudman:
Diarienummer hos huvudman:
- SLU.ma.2025.4.2.IÄ-7
Data innehåller personuppgifter:
Nej
Citering:
Språk:
Metod och utfall
Metod och utfall
Tidsperiod(er) som undersökts:
Dataformat/datastruktur:
Arter och taxon:
Prover/material - Nya från vetenskaplig samling/biobank
Prover/material - Nya från vetenskaplig samling/biobank
Namn:
Herbarium Berolinense (B)
Typ(er) av prov:
kiselalger
Datainsamling - Biological tests
Datainsamling - Biological tests
Insamlingsmetod:
Biological tests
Beskrivning av insamlingsmetod:
Diatoms were isolated from fresh samples taken in coordination with the Swedish national monitoring program in 2019 and 2020. Those samples were taken following the European standard EN 13946:2025 Water quality - Guidance standard for the routine sampling and preparation of benthic diatoms from rivers and lakes. In total, 273 monoclonal cultures were established from single cells using the micropipette method. Cultures were grown in WC (Guillard and Lorenzen 1972), PM (Stosch and Fecher 1979), or L16 (Lindström 1991) medium at room temperature. Photographs were taken from each living culture if possible. The cultures were subsequently harvested and sequenced, and in parallel identified using morphological characters using light microscopy in a first step. Selected cultures were also studied and pictures taken using scanning electronic microscopy. The clones were harvested when the biomass was sufficient for all further project relevant analysis steps, which included DNA barcode sequencing for rbcL and 18SV4.
Tidsperiod(er) för datainsamling:
2020 - 2021
Datainsamlare:
- Swedish University of Agricultural Sciences
Opens a new window at ror.org.
ROR
Datakälla:
- Research data
- Biological samples
- Other
Geografisk täckning
Geografisk täckning
Geografisk plats:
Geografisk beskrivning:
Kiselalger har provtagits från 44 olika vattendrag i Sverige, geografiskt spridda över landet från norr till söder (58.3475 to 65.4433 WGS84).
Administrativ information
Administrativ information
Ansvarig institution/enhet:
Institutionen för vatten och miljö
Uppdragsgivare:
- Swedish Environmental Protection Agency
Opens a new window at ror.org.
ROR
Diarienummer hos uppdragsgivare:
- 18/171
Identifierare
Identifierare
Handle:
Finansiering
Finansiering
Finansiär:
- Swedish Agency for Marine and Water Management
Opens a new window at ror.org.
ROR
Referensnummer:
18/171
Finansiär:
- Swedish Environmental Protection Agency
Opens a new window at ror.org.
ROR
Referensnummer:
18/171
Ämnesområde och nyckelord
Ämnesområde och nyckelord
Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2025:
Relationer
Relationer
Is metadata for:
Is documented by:
Is documented by:
Is documented by:
Is documented by:
Is documented by:
Publikationer
Publikationer
Citering:
Kahlert, M., Mora, D. Kusber, W-H., Abarca, N. & Zimmermann, J. (XXXX) New DNA barcode reference data of freshwater diatoms from Sweden - old acquaintances and new taxa. Environmental DNA. in process
