Antikroppsnivåer mot Epstein Barr-virusantigen och molekylära sekvenshomologa proteinter hos patienter med multipel skleros och kontroller
https://doi.org/10.48723/0xhc-vp63
Dessa data genererades med hjälp av plasmaprover från EIMS-studien (1). Det övergripande målet med EIMS studien är att förstå vilka livstil och genetiska faktorer som påverkar MS risk. Denna delstudies mål var att bättre förstå hur epstein barr virus kan påverka uppkomst av autoimmuna reaktioner. Studien inkluderar data från 661 populationsbaserade kontroller och 650 multipel sklerospatienter från Sverige. Datan består av antikroppsnivåer mätta med fluorescensaktiverad pärlbaserad analys. Prover kördes i duplikat. Nivåerna justerades mellan plattorna med användning av batchkontrollprover. De angivna värdena är medelvärdet av de två körningarna efter batchkorrigering.
HLA-genotyper har imputerats från SNP-genotyper i HlA-regionen av kromosom 6 med hjälp av HLA*IMP:02 som beskrivits tidigare (2).
Datasetet består av följande filer:
- PNAS_Data_combined.csv (433 kB)
- MetaData.csv
- MetaDescription.docx
Mer information om variablerna i tabellerna finns i dokumentationsfilen.
Dokumentationsfiler
Dokumentationsfiler
Citering och åtkomst
Citering och åtkomst
Tillgänglighetsnivå:
Skapare/primärforskare:
Forskningshuvudman:
Data innehåller personuppgifter:
Ja
Typ av personuppgifter:
Genetiska data (två alleler), födelseår, kön, ålder vid provtagning. Antikropps nivåer, kan tillsammans med data som finns lokalt leda till identifering av personerna
Data innehåller känsliga personuppgifter:
Ja
Citering:
Språk:
Metod och utfall
Metod och utfall
Analysenhet:
Population:
Patienter med multipel skleros i Sverige som gett sitt godkännande till att delta i EIMS studien samt populations baserade kontroller. Vi har analyserat plasma från blodprover från dessa individer för nivåer av antikroppar riktade mot Epstein Barr Virus antigen samt humana proteiner med aminosyra homologier med EBNA1 proteinet
Tidsdimension:
Studiedesign:
- Observational study
- Case-control study
Beskrivning av studiedesign:
Ny diagnosticerade MS patienter har bjudits in att delta i studien som bestått av att svara på en enkät samt att lämna blodprov. Ålders, köns och region matchade kontroller har bjudits in att delta i studien, även de har svarat på en enkät och lämnat blodprov.
Beskrivning av urval:
Ny diagnosticerade MS patienter identiferade via neurologkliniker i sverige har bjudits in att delta i studien som bestått av att svara på en enkät samt att lämna blodprov. Ålders, köns och region matchade kontroller har bjudits in att delta i studien, även de har svarat på en enkät och lämnat blodprov.
Tidsperiod(er) som undersökts:
Variabler:
33
Antal individer/objekt:
1311
Dataformat/datastruktur:
Prover/material - Befintliga från vetenskaplig samling/biobank
Prover/material - Befintliga från vetenskaplig samling/biobank
Namn:
KI biobank
Typ(er) av prov:
Plasma
Geografisk täckning
Geografisk täckning
Geografisk plats:
Geografisk beskrivning:
Hela Sverige
Administrativ information
Administrativ information
Ansvarig institution/enhet:
Institutionen för klinisk neurovetenskap / Institutet för miljömedicin
Etikprövning
Etikprövning
Utförare:
- Swedish Ethical Review Authority
components.catalogue.resource.content.administrativeInformation.ethicalReview.rorId.srText
ROR
Diarienummer:
2019-00639
Finansiering
Finansiering
Finansiär:
- Swedish Research Council
Opens a new window at ror.org.
ROR
Referensnummer:
2022-00565_VR
Projektnamn på ansökan:
Causes and pathogenesis of multiple sclerosis; prevention and precise treatment
Information om finansiering:
In MS, immune cells from the blood enter the central nervous system causing damage to nerve tracts. With time, MS becomes progressive with increased disabilities. Some therapies can dampen the relapse rates up to 90%, but act broadly on immunity, which can lead to severe complications. Since MS is due to inflammation, the disease should be curable. We study the causes, pathogenesis and severity/progression of MS in large-scale clinical MS materials, integrated with molecular genetics/immunology and studies in rodent models, to achieve prevention and precise treatment. The current project focus on function of factors we have found to be strongly associated to disease, and thereby deemed relevant and often unique for MS, providing a basis for precision medicine. We aim to: 1) Further define, lifestyle/environmental factors and pathways that drive MS risk and severity/progression. 2) Decipher gene-environment interactions, and interactions between environmental factors. 3) Define the function of selected MS gene loci and environmental factors. 4) Define disease relevant T cells, and explore precise tolerance therapies; first in rodent MS models, in which the detailed knowledge of auto-antigenic targets have enabled precise therapies and cure. Translation to human MS is expected. 5) Develop MS biomarkers in blood samples for diagnosis, severity, prognosis and disease heterogeneity. We approach these aims in ten different, but strongly inter-related sub-projects.
Ämnesområde och nyckelord
Ämnesområde och nyckelord
Ämnesklassificering enligt CESSDA:
Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2025:
Publikationer
Publikationer
Citering:
Sattarnezhad, N., Kockum, I., Thomas, O., Liu, Y., Ho, P., Barrett, A., Comanescu, A., Wijeratne, T., Utz, P., & Alfredsson, L. (2025). Antibody reactivity against EBNA1 and GlialCAM differentiates multiple sclerosis patients from healthy controls. In PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA (Vol. 122, Issue 11). https://doi.org/10.1073/pnas.2424986122
